# 0 Query: pF1KE0800, 1531 aa
# 1 CCDS45672.1 TOP2A gene_id:7153|Hs108|chr17 (1531 aa)
# 2 CCDS82746.1 TOP2B gene_id:7155|Hs108|chr3 (1626 aa)
# 3 CCDS46776.1 TOP2B gene_id:7155|Hs108|chr3 (1621 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 10077 100.0 1 1531
2 0 6939 69.3 28 1584
3 0 6937 69.6 37 1579
//
0 ( 1) MEVSPLQPVNENMQVNKIKKNE-------DAKKRLSVERIYQKKTQLEHILLRPDTYIGS
1 ( 1) MEVSPLQPVNENMQVNKIKKNE-------DAKKRLSVERIYQKKTQLEHILLRPDTYIGS
2 ( 28) .............QNNAAKKEESETANKNDSSKKLSVERVYQKKTQLEHILLRPDTYIGS
3 ( 37) ...................KN--------DSSKKLSVERVYQKKTQLEHILLRPDTYIGS
//
0 ( 54) VELVTQQMWVYDEDVGINYREVTFVPGLYKIFDEILVNAADNKQRDPKMSCIRVTIDPEN
1 ( 54) VELVTQQMWVYDEDVGINYREVTFVPGLYKIFDEILVNAADNKQRDPKMSCIRVTIDPEN
2 ( 75) VEPLTQFMWVYDEDVGMNCREVTFVPGLYKIFDEILVNAADNKQRDKNMTCIKVSIDPES
3 ( 70) VEPLTQFMWVYDEDVGMNCREVTFVPGLYKIFDEILVNAADNKQRDKNMTCIKVSIDPES
//
0 ( 114) NLISIWNNGKGIPVVEHKVEKMYVPALIFGQLLTSSNYDDDEKKVTGGRNGYGAKLCNIF
1 ( 114) NLISIWNNGKGIPVVEHKVEKMYVPALIFGQLLTSSNYDDDEKKVTGGRNGYGAKLCNIF
2 ( 135) NIISIWNNGKGIPVVEHKVEKVYVPALIFGQLLTSSNYDDDEKKVTGGRNGYGAKLCNIF
3 ( 130) NIISIWNNGKGIPVVEHKVEKVYVPALIFGQLLTSSNYDDDEKKVTGGRNGYGAKLCNIF
//
0 ( 174) STKFTVETASREYKKMFKQTWMDNMGRAGEMELKPFNGEDYTCITFQPDLSKFKMQSLDK
1 ( 174) STKFTVETASREYKKMFKQTWMDNMGRAGEMELKPFNGEDYTCITFQPDLSKFKMQSLDK
2 ( 195) STKFTVETACKEYKHSFKQTWMNNMMKTSEAKIKHFDGEDYTCITFQPDLSKFKMEKLDK
3 ( 190) STKFTVETACKEYKHSFKQTWMNNMMKTSEAKIKHFDGEDYTCITFQPDLSKFKMEKLDK
//
0 ( 234) DIVALMVRRAYDIAGSTKDVKVFLNGNKLPVKGFRSYVDMYLKDKLDETGNSLKVIHEQV
1 ( 234) DIVALMVRRAYDIAGSTKDVKVFLNGNKLPVKGFRSYVDMYLKDKLDETGNSLKVIHEQV
2 ( 255) DIVALMTRRAYDLAGSCRGVKVMFNGKKLPVNGFRSYVDLYVKDKLDETGVALKVIHELA
3 ( 250) DIVALMTRRAYDLAGSCRGVKVMFNGKKLPVNGFRSYVDLYVKDKLDETGVALKVIHELA
//
0 ( 294) NHRWEVCLTMSEKGFQQISFVNSIATSKGGRHVDYVADQIVTKLVDVVKKKNKGGVAVKA
1 ( 294) NHRWEVCLTMSEKGFQQISFVNSIATSKGGRHVDYVADQIVTKLVDVVKKKNKGGVAVKA
2 ( 315) NERWDVCLTLSEKGFQQISFVNSIATTKGGRHVDYVVDQVVGKLIEVVKKKNKAGVSVKP
3 ( 310) NERWDVCLTLSEKGFQQISFVNSIATTKGGRHVDYVVDQVVGKLIEVVKKKNKAGVSVKP
//
0 ( 354) HQVKNHMWIFVNALIENPTFDSQTKENMTLQPKSFGSTCQLSEKFIKAAIGCGIVESILN
1 ( 354) HQVKNHMWIFVNALIENPTFDSQTKENMTLQPKSFGSTCQLSEKFIKAAIGCGIVESILN
2 ( 375) FQVKNHIWVFINCLIENPTFDSQTKENMTLQPKSFGSKCQLSEKFFKAASNCGIVESILN
3 ( 370) FQVKNHIWVFINCLIENPTFDSQTKENMTLQPKSFGSKCQLSEKFFKAASNCGIVESILN
//
0 ( 414) WVKFKAQVQLNKKCSAVKHNRIKGIPKLDDANDAGGRNSTECTLILTEGDSAKTLAVSGL
1 ( 414) WVKFKAQVQLNKKCSAVKHNRIKGIPKLDDANDAGGRNSTECTLILTEGDSAKTLAVSGL
2 ( 435) WVKFKAQTQLNKKCSSVKYSKIKGIPKLDDANDAGGKHSLECTLILTEGDSAKSLAVSGL
3 ( 430) WVKFKAQTQLNKKCSSVKYSKIKGIPKLDDANDAGGKHSLECTLILTEGDSAKSLAVSGL
//
0 ( 474) GVVGRDKYGVFPLRGKILNVREASHKQIMENAEINNIIKIVGLQYKKNYEDEDSLKTLRY
1 ( 474) GVVGRDKYGVFPLRGKILNVREASHKQIMENAEINNIIKIVGLQYKKNYEDEDSLKTLRY
2 ( 495) GVIGRDRYGVFPLRGKILNVREASHKQIMENAEINNIIKIVGLQYKKSYDDAESLKTLRY
3 ( 490) GVIGRDRYGVFPLRGKILNVREASHKQIMENAEINNIIKIVGLQYKKSYDDAESLKTLRY
//
0 ( 534) GKIMIMTDQDQDGSHIKGLLINFIHHNWPSLLRHRFLEEFITPIVKVSKNKQEMAFYSLP
1 ( 534) GKIMIMTDQDQDGSHIKGLLINFIHHNWPSLLRHRFLEEFITPIVKVSKNKQEMAFYSLP
2 ( 555) GKIMIMTDQDQDGSHIKGLLINFIHHNWPSLLKHGFLEEFITPIVKASKNKQELSFYSIP
3 ( 550) GKIMIMTDQDQDGSHIKGLLINFIHHNWPSLLKHGFLEEFITPIVKASKNKQELSFYSIP
//
0 ( 594) EFEEWKSSTPNHKKWKVKYYKGLGTSTSKEAKEYFADMKRHRIQFKYSGPEDDAAISLAF
1 ( 594) EFEEWKSSTPNHKKWKVKYYKGLGTSTSKEAKEYFADMKRHRIQFKYSGPEDDAAISLAF
2 ( 615) EFDEWKKHIENQKAWKIKYYKGLGTSTAKEAKEYFADMERHRILFRYAGPEDDAAITLAF
3 ( 610) EFDEWKKHIENQKAWKIKYYKGLGTSTAKEAKEYFADMERHRILFRYAGPEDDAAITLAF
//
0 ( 654) SKKQIDDRKEWLTNFMEDRRQRKLLGLPEDYLYGQTTTYLTYNDFINKELILFSNSDNER
1 ( 654) SKKQIDDRKEWLTNFMEDRRQRKLLGLPEDYLYGQTTTYLTYNDFINKELILFSNSDNER
2 ( 675) SKKKIDDRKEWLTNFMEDRRQRRLHGLPEQFLYGTATKHLTYNDFINKELILFSNSDNER
3 ( 670) SKKKIDDRKEWLTNFMEDRRQRRLHGLPEQFLYGTATKHLTYNDFINKELILFSNSDNER
//
0 ( 714) SIPSMVDGLKPGQRKVLFTCFKRNDKREVKVAQLAGSVAEMSSYHHGEMSLMMTIINLAQ
1 ( 714) SIPSMVDGLKPGQRKVLFTCFKRNDKREVKVAQLAGSVAEMSSYHHGEMSLMMTIINLAQ
2 ( 735) SIPSLVDGFKPGQRKVLFTCFKRNDKREVKVAQLAGSVAEMSAYHHGEQALMMTIVNLAQ
3 ( 730) SIPSLVDGFKPGQRKVLFTCFKRNDKREVKVAQLAGSVAEMSAYHHGEQALMMTIVNLAQ
//
0 ( 774) NFVGSNNLNLLQPIGQFGTRLHGGKDSASPRYIFTMLSSLARLLFPPKDDHTLKFLYDDN
1 ( 774) NFVGSNNLNLLQPIGQFGTRLHGGKDSASPRYIFTMLSSLARLLFPPKDDHTLKFLYDDN
2 ( 795) NFVGSNNINLLQPIGQFGTRLHGGKDAASPRYIFTMLSTLARLLFPAVDDNLLKFLYDDN
3 ( 790) NFVGSNNINLLQPIGQFGTRLHGGKDAASPRYIFTMLSTLARLLFPAVDDNLLKFLYDDN
//
0 ( 834) QRVEPEWYIPIIPMVLINGAEGIGTGWSCKIPNFDVREIVNNIRRLMDGEEPLPMLPSYK
1 ( 834) QRVEPEWYIPIIPMVLINGAEGIGTGWSCKIPNFDVREIVNNIRRLMDGEEPLPMLPSYK
2 ( 855) QRVEPEWYIPIIPMVLINGAEGIGTGWACKLPNYDAREIVNNVRRMLDGLDPHPMLPNYK
3 ( 850) QRVEPEWYIPIIPMVLINGAEGIGTGWACKLPNYDAREIVNNVRRMLDGLDPHPMLPNYK
//
0 ( 894) NFKGTIEELAPNQYVISGEVAILNSTTIEISELPVRTWTQTYKEQVLEPMLNGTEKTPPL
1 ( 894) NFKGTIEELAPNQYVISGEVAILNSTTIEISELPVRTWTQTYKEQVLEPMLNGTEKTPPL
2 ( 915) NFKGTIQELGQNQYAVSGEIFVVDRNTVEITELPVRTWTQVYKEQVLEPMLNGTDKTPAL
3 ( 910) NFKGTIQELGQNQYAVSGEIFVVDRNTVEITELPVRTWTQVYKEQVLEPMLNGTDKTPAL
//
0 ( 954) ITDYREYHTDTTVKFVVKMTEEKLAEAERVGLHKVFKLQTSLTCNSMVLFDHVGCLKKYD
1 ( 954) ITDYREYHTDTTVKFVVKMTEEKLAEAERVGLHKVFKLQTSLTCNSMVLFDHVGCLKKYD
2 ( 975) ISDYKEYHTDTTVKFVVKMTEEKLAQAEAAGLHKVFKLQTTLTCNSMVLFDHMGCLKKYE
3 ( 970) ISDYKEYHTDTTVKFVVKMTEEKLAQAEAAGLHKVFKLQTTLTCNSMVLFDHMGCLKKYE
//
0 ( 1014) TVLDILRDFFELRLKYYGLRKEWLLGMLGAESAKLNNQARFILEKIDGKIIIENKPKKEL
1 ( 1014) TVLDILRDFFELRLKYYGLRKEWLLGMLGAESAKLNNQARFILEKIDGKIIIENKPKKEL
2 ( 1035) TVQDILKEFFDLRLSYYGLRKEWLVGMLGAESTKLNNQARFILEKIQGKITIENRSKKDL
3 ( 1030) TVQDILKEFFDLRLSYYGLRKEWLVGMLGAESTKLNNQARFILEKIQGKITIENRSKKDL
//
0 ( 1074) IKVLIQRGYDSDPVKAWKEAQQKVPDEEENEESDNEKETEKSDSVTDSGPTFNYLLDMPL
1 ( 1074) IKVLIQRGYDSDPVKAWKEAQQKVPDEEENEESDNEKETEKSDSVTDSGPTFNYLLDMPL
2 ( 1095) IQMLVQRGYESDPVKAWKEAQEKAAEE---DETQNQHDDSSSDSGTPSGPDFNYILNMSL
3 ( 1090) IQMLVQRGYESDPVKAWKEAQEKAAEEDE---TQNQHDDSSSDSGTPSGPDFNYILNMSL
//
0 ( 1134) WYLTKEKKDELCRLRNEKEQELDTLKRKSPSDLWKEDLATFIEELEAVEAKEKQDEQVGL
1 ( 1134) WYLTKEKKDELCRLRNEKEQELDTLKRKSPSDLWKEDLATFIEELEAVEAKEKQDEQVGL
2 ( 1152) WSLTKEKVEELIKQRDAKGREVNDLKRKSPSDLWKEDLAAFVEELDKVESQEREDVLAGM
3 ( 1147) WSLTKEKVEELIKQRDAKGREVNDLKRKSPSDLWKEDLAAFVEELDKVESQEREDVLAGM
//
0 ( 1194) PGKG-----GKAKGKKTQMAEVLPSPRGQRVIPRITIEMKAEAEKKNKKKIK--------
1 ( 1194) PGKG-----GKAKGKKTQMAEVLPSPRGQRVIPRITIEMKAEAEKKNKKKIK--------
2 ( 1212) SGKAIKGKVGKPKVKKLQLEETMPSPYGRRIIPEITA-MKADASKKLLKKKKGDLDTAAV
3 ( 1207) SGKAIKGKVGKPKVKKLQLEETMPSPYGRRIIPEITA-MKADASKKLLKKKKGDLDTAAV
//
0 ( 1241) ----NENTEGSPQEDGVELEGLKQRLE-------KKQKREPGTKTKKQTTLAFKP-IKKG
1 ( 1241) ----NENTEGSPQEDGVELEGLKQRLE-------KKQKREPGTKTKKQTTLAFKP-IKKG
2 ( 1271) KVEFDEEFSGAPVE-GAGEEALTPSVPINKGPKPKREKKEPGTRVRKTPTSSGKPSAKKV
3 ( 1266) KVEFDEEFSGAPVE-GAGEEALTPSVPINKGPKPKREKKEPGTRVRKTPTSSGKPSAKKV
//
0 ( 1289) KKRNPWSDSESDRSSD--ESNFDVPPRETEPRRAAT-KTKFTMDL---------DSDEDF
1 ( 1289) KKRNPWSDSESDRSSD--ESNFDVPPRETEPRRAAT-KTKFTMDL---------DSDEDF
2 ( 1330) KKRNPWSDDESKSESDLEETEPVVIPRDSLLRRAAAERPKYTFDFSEEEDDDADDDDDDN
3 ( 1325) KKRNPWSDDESKSESDLEETEPVVIPRDSLLRRAAAERPKYTFDFSEEEDDDADDDDDDN
//
0 ( 1337) SDFDE--------KTDDED-FVPSDA--------SPPKTKTSPKLSNKELKPQK--SVVS
1 ( 1337) SDFDE--------KTDDED-FVPSDA--------SPPKTKTSPKLSNKELKPQK--SVVS
2 ( 1390) NDLEELKVKASPITNDGEDEFVPSDGLDKDEYTFSPGKSKATPEKSLHDKKSQDFGNLFS
3 ( 1385) NDLEELKVKASPITNDGEDEFVPSDGLDKDEYTFSPGKSKATPEKSLHDKKSQDFGNLFS
//
0 ( 1378) ----DLEADDVKGSVPLSSSPPATHFPDETEI--TNPVPKKNVTVKKTAAKSQSSTSTTG
1 ( 1378) ----DLEADDVKGSVPLSSSPPATHFPDETEI--TNPVPKKNVTVKKTAAKSQSSTSTTG
2 ( 1450) FPSYSQKSEDDSAKFDSNEEDSASVFSPSFGLKQTDKVPSKTV-----AAKKGKPSSDTV
3 ( 1445) FPSYSQKSEDDSAKFDSNEEDSASVFSPSFGLKQTDKVPSKTV-----AAKKGKPSSDTV
//
0 ( 1432) AKKRAAPKGTKRDPALNS------GVSQKPDPAKTKNR--RKRKPSTSDD-SDSNFEKIV
1 ( 1432) AKKRAAPKGTKRDPALNS------GVSQKPDPAKTKNR--RKRKPSTSDD-SDSNFEKIV
2 ( 1505) PKPKRAPKQKKVVEAVNSDSDSEFGIPKKTTTPKGKGRGAKKRKASGSENEGDYNPGRKT
3 ( 1500) PKPKRAPKQKKVVEAVNSDSDSEFGIPKKTTTPKGKGRGAKKRKASGSENEGDYNPGRKT
//
0 ( 1483) SKAVTSKKSKGESDDFHMDFDSAVAPRAKSVRAKKPIKYLEESDEDDLF
1 ( 1483) SKAVTSKKSKGESDDFHMDFDSAVAPRAKSVRAKKPIKYLEESDEDDLF
2 ( 1565) SKT-TSKKPKKTSFDQDSDVD............................
3 ( 1560) SKT-TSKKPKKTSFDQDSDVD............................
//
