# 0 Query: pF1KB9997, 1173 aa
# 1 CCDS110.1 UBE4B gene_id:10277|Hs108|chr1 (1173 aa)
# 2 CCDS41245.1 UBE4B gene_id:10277|Hs108|chr1 (1302 aa)
# 3 CCDS55790.1 UBE4A gene_id:9354|Hs108|chr11 (1066 aa)
# 4 CCDS8396.1 UBE4A gene_id:9354|Hs108|chr11 (1073 aa)
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exp sw-scr id% from to
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1 ( 1) MEELSADEIRRRRLARLAGGQTSQPTTPLTSPQRENPPGPPIAASAPGPSQSLGLNVHNM
2 ( -) ............................................................
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
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2 ( 98) .....................................QSLSRSQSMDIDGVSCEKSMSQV
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
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1 ( 121) DVDSGIENMEVDENDRREKRSLSDKEPSSGPEVSEEQALQLVCKIFRVSWKDRDRDVIFL
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4 ( -) ............................................................
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3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
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1 ( 241) RNLLLNTGSNPGTSPMFCSVASFGASSLSSL-----------------------------
2 ( 241) RNLLLNTGSNPGTSPMFCSVASFGASSLSSLYESSPAPTPSFWSSVPVMGPSLASPSRAA
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
//
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1 ( -) ------------------------------------------------------------
2 ( 301) SQLAVPSTPLSPHSAASGTAAGSQPSSPRYRPYTVTHPWASSGVSILSSSPSPPALASSP
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
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1 ( 272) ----------------------------------------GASGGASNWDSYSDHFTIET
2 ( 361) QAVPASSSRQRPSSTGPPLPPASPSATSRRPSSLRISPSLGASGGASNWDSYSDHFTIET
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
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4 ( 170) ..ERHIFCYLYSCFQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHE
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3 ( 331) GVILSISCLLKTP-GVVENHGYFLNPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLL
4 ( 338) GVILSISCLLKTP-GVVENHGYFLNPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLL
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2 ( 649) -LNGETREAALSYMAAVVNANMKKAQMQTDD------RLVSTDGFMLNFLWVLQQLSTKI
3 ( 390) QLSPETKHCILSWLGNCLHANAGRTKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPF
4 ( 397) QLSPETKHCILSWLGNCLHANAGRTKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPF
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0 ( 573) ------KLETVDPTYIFHPRCRITLPNDETRV--NATMEDVNDWLTELYGDQPPFSEPKF
1 ( 573) ------KLETVDPTYIFHPRCRITLPNDETRV--NATMEDVNDWLTELYGDQPPFSEPKF
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3 ( 450) CKPRSSRLLTFNPTY-----CALKELNDEERKIKNVHMRGL-DKETCLI---PAVQEPKF
4 ( 457) CKPRSSRLLTFNPTY-----CALKELNDEERKIKNVHMRGL-DKETCLI---PAVQEPKF
//
0 ( 625) PTECFFLTLHAHHLSILPSCRRYIRRLRAIRELNRTVEDLKNNESQWKD-----SPLATR
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2 ( 754) PTECFFLTLHAHHLSILPSCRRYIRRLRAIRELNRTVEDLKNNESQWKD-----SPLATR
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0 ( 680) HREMLKRCKTQLKKLVRCKACADAGLLDESFLRRCLNFYGLLIQLLLRIL---DPAYP-D
1 ( 680) HREMLKRCKTQLKKLVRCKACADAGLLDESFLRRCLNFYGLLIQLLLRIL---DPAYP-D
2 ( 809) HREMLKRCKTQLKKLVRCKACADAGLLDESFLRRCLNFYGLLIQLLLRIL---DPAYP-D
3 ( 557) LRE-------QFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIE
4 ( 564) LRE-------QFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIE
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0 ( 736) ITLPLNSDVPKVFAALPEFYVEDVAEFLFFIVQYSPQALYEPCT--QDIVMFLVVMLCNQ
1 ( 736) ITLPLNSDVPKVFAALPEFYVEDVAEFLFFIVQYSPQALYEPCT--QDIVMFLVVMLCNQ
2 ( 865) ITLPLNSDVPKVFAALPEFYVEDVAEFLFFIVQYSPQALYEPCT--QDIVMFLVVMLCNQ
3 ( 610) LTFPL-PDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSI
4 ( 617) LTFPL-PDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSI
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0 ( 794) NYIRNPYLVAKLVEVMFMTNPAVQ----PRTQKFFE---MIENHPLSTKLLVPSLMKFYT
1 ( 794) NYIRNPYLVAKLVEVMFMTNPAVQ----PRTQKFFE---MIENHPLSTKLLVPSLMKFYT
2 ( 923) NYIRNPYLVAKLVEVMFMTNPAVQ----PRTQKFFE---MIENHPLSTKLLVPSLMKFYT
3 ( 669) ERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFQYAPQL-AEALIKVFV
4 ( 676) ERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFQYAPQL-AEALIKVFV
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1 ( 847) DVEHTGATSEFYDKFTIRYHISTIFKSLW---------QNIAHHGTFMEEFNSGKQFVRY
2 ( 976) DVEHTGATSEFYDKFTIRYHISTIFKSLW---------QNIAHHGTFMEEFNSGKQFVRY
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4 ( 735) DIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTDTYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRF
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1 ( 898) INMLINDTTFLLDESLESLKRIHEVQEEMKNKEQWDQLPRDQQQARQSQLAQDERVSRSY
2 ( 1027) INMLINDTTFLLDESLESLKRIHEVQEEMKNKEQWDQLPRDQQQARQSQLAQDERVSRSY
3 ( 788) LNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKI-KIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFH
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1 ( 958) LALATETVDMFHILTKQVQKPFLRPELGPRLAAMLNFNLQQLCGPKCRDLKVENPEKYGF
2 ( 1087) LALATETVDMFHILTKQVQKPFLRPELGPRLAAMLNFNLQQLCGPKCRDLKVENPEKYGF
3 ( 847) NIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKMGALKVKDFSEFDF
4 ( 854) NIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKMGALKVKDFSEFDF
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0 ( 1018) EPKKLLDQLTDIYLQL-DCARFAKAIADDQRSYSKELFEEVISKMRKAGIKSTIAIEKFK
1 ( 1018) EPKKLLDQLTDIYLQL-DCARFAKAIADDQRSYSKELFEEVISKMRKAGIKSTIAIEKFK
2 ( 1147) EPKKLLDQLTDIYLQL-DCARFAKAIADDQRSYSKELFEEVISKMRKAGIKSTIAIEKFK
3 ( 907) KPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKKIN-KPGNMIMAFS
4 ( 914) KPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKKIN-KPGNMIMAFS
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1 ( 1077) LLAEKVEEIVAKNARAEIDYSDAPDEFRDPLMDTLMTDPVRLPSGTI-MDRSIILRHLLN
2 ( 1206) LLAEKVEEIVAKNARAEIDYSDAPDEFRDPLMDTLMTDPVRLPSGTI-MDRSIILRHLLN
3 ( 966) NLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMCDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLS
4 ( 973) NLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMCDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLS
//
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1 ( 1136) SPTDPFNRQTLTESMLEPVPELKEQIQAWMREKQNSDH
2 ( 1265) SPTDPFNRQTLTESMLEPVPELKEQIQAWMREKQNSDH
3 ( 1026) DQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERK....
4 ( 1033) DQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERK....
//
