# 0 Query: pF1KB9741, 517 aa
# 1 CCDS13349.1 RBPJL gene_id:11317|Hs108|chr20 (517 aa)
# 2 CCDS63283.1 RBPJL gene_id:11317|Hs108|chr20 (516 aa)
# 3 CCDS63284.1 RBPJL gene_id:11317|Hs108|chr20 (471 aa)
# 4 CCDS3436.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4 (485 aa)
# 5 CCDS33969.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4 (486 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 3532 100.0 1 517
2 1.6e-218 3513 99.8 1 516
3 1.7e-179 2903 100.0 1 427
4 5e-82 1648 54.8 11 437
5 5e-82 1648 54.8 12 438
//
0 ( 1) MDPAGAADPSVPPNPLTHLSLQDRSEMQLQSEADRRSLPGTWTRSSPEHTTILRGGVRRC
1 ( 1) MDPAGAADPSVPPNPLTHLSLQDRSEMQLQSEADRRSLPGTWTRSSPEHTTILRGGVRRC
2 ( 1) MDPAGAADPSVPPNPLTHLSLQDRSEMQLQSEADRRSLPGTWTRSSPEHTTILRGGVRRC
3 ( 1) MDPAGAADPSVPPNPLTHLSLQDRSEMQLQSEADRRSLPGTWTRSSPEHTTILRGGVRRC
4 ( 11) ..............................................PPPKRLTREAMRNY
5 ( 12) ..............................................PPPKRLTREAMRNY
//
0 ( 61) LQQQCEQTVRILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLSGPGWRVKPGQDQAHQAGETGPTV
1 ( 61) LQQQCEQTVRILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLSGPGWRVKPGQDQAHQAGETGPTV
2 ( 61) LQQQCEQTVRILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLSGPGWRVKPGQDQAHQAGETGPTV
3 ( 61) LQQQCEQTVRILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLSGPGWRVKPGQDQAHQAGETGPTV
4 ( 25) LKERGDQTVLILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQP
5 ( 26) LKERGDQTVLILHAKVAQKSYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQP
//
0 ( 121) CGYMGLDSASGSATETQKLNFEQQPDSREFGCAKTLYISDADKRKHFRLVLRLVLRGGRE
1 ( 121) CGYMGLDSASGSATETQKLNFEQQPDSREFGCAKTLYISDADKRKHFRLVLRLVLRGGRE
2 ( 121) CGYMGLDSASGSATETQKLNFEQQPDSREFGCAKTLYISDADKRKHFRLVLRLVLRGGRE
3 ( 121) CGYMGLDSASGSATETQKLNFEQQPDSREFGCAKTLYISDADKRKHFRLVLRLVLRGGRE
4 ( 85) CAFIGIGN---SDQEMQQLNLE----GKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDD
5 ( 86) CAFIGIGN---SDQEMQQLNLE----GKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDD
//
0 ( 181) LGTFHSRLIKVISKPSQKKQSLKNTDLCISSGSKVSLFNRLRSQTVSTRYLSVEDGAFVA
1 ( 181) LGTFHSRLIKVISKPSQKKQSLKNTDLCISSGSKVSLFNRLRSQTVSTRYLSVEDGAFVA
2 ( 181) LGTFHSRLIKVISKPSQKKQSLKNTDLCISSGSKVSLFNRLRSQTVSTRYLSVEDGAFVA
3 ( 181) LGTFHSRLIKVISKPSQKKQSLKNTDLCISSGSKVSLFNRLRSQTVSTRYLSVEDGAFVA
4 ( 138) IGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHA
5 ( 139) IGVFLSKRIKVISKPSKKKQSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHA
//
0 ( 241) SARQWAAFTLHLADGHSAQGD-FPPREGYVRYGSLVQLVCTVTGITLPPMIIRKVAKQCA
1 ( 241) SARQWAAFTLHLADGHSAQGD-FPPREGYVRYGSLVQLVCTVTGITLPPMIIRKVAKQCA
2 ( 241) SARQWAAFTLHLADGHSAQGD-FPPREGYVRYGSLVQLVCTVTGITLPPMIIRKVAKQCA
3 ( 241) SARQWAAFTLHLADGHSAQGD-FPPREGYVRYGSLVQLVCTVTGITLPPMIIRKVAKQCA
4 ( 198) SSQQWGAFFIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTA
5 ( 199) SSQQWGAFFIHLLDDDESEGEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTA
//
0 ( 300) LLDVDEPISQLHKCAFQFPGSPPGGGGTYLCLATEKVVQFQASPCPKEANRALLNDSSCW
1 ( 300) LLDVDEPISQLHKCAFQFPGSPPGGGGTYLCLATEKVVQFQASPCPKEANRALLNDSSCW
2 ( 300) LLDVDEPISQLHKCAFQFPGSPPGGGGTYLCLATEKVVQFQASPCPKEANRALLNDSSCW
3 ( 300) LLDVDEPISQLHKCAFQFPGSPPGGGGTYLCLATEKVVQFQASPCPKEANRALLNDSSCW
4 ( 258) LLDADDPVSQLHKCAFYLKDTER----MYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASW
5 ( 259) LLDADDPVSQLHKCAFYLKDTER----MYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASW
//
0 ( 360) TIIGTESVEFSFSTSLACTLEPVTPVPLISTLELSGGGDVATLELHGENFHAGLKVWFGD
1 ( 360) TIIGTESVEFSFSTSLACTLEPVTPVPLISTLELSGGGDVATLELHGENFHAGLKVWFGD
2 ( 360) TIIGTESVEFSFSTSLACTLEPVTPVPLISTLELSGGGDVATLELHGENFHAGLKVWFGD
3 ( 360) TIIGTESVEFSFSTSLACTLEPVTPVPLISTLELSGGGDVATLELHGENFHAGLKVWFGD
4 ( 314) TIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGD
5 ( 315) TIISTDKAEYTFYEGMGPVLAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGD
//
0 ( 420) VEAETMYRSPRSLVCVVPDVAAFCSDWRWLRAPITIPMSLVRADGLFYPSAFSFTYTPEY
1 ( 420) VEAETMYRSPRSLVCVVPDVAAFCSDWRWLRAPITIPMSLVRADGLFYPSAFSFTYTPEY
2 ( 420) VEAETMY-SPRSLVCVVPDVAAFCSDWRWLRAPITIPMSLVRADGLFYPSAFSFTYTPEY
3 ( 420) VEAETMYR....................................................
4 ( 374) VEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEP
5 ( 375) VEAETMYRCGESMLCVVPDISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEP
//
0 ( 480) SVRPGHPGVPEPATDADALLESIHQEFTRTNFHLFIQT
1 ( 480) SVRPGHPGVPEPATDADALLESIHQEFTRTNFHLFIQT
2 ( 479) SVRPGHPGVPEPATDADALLESIHQEFTRTNFHLFIQT
3 ( -) ......................................
4 ( 434) GPRP..................................
5 ( 435) GPRP..................................
//