Multiple alignment for pF1KB8900
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB8900, 233 aa
#  1    CCDS32549.1 SOX15 gene_id:6665|Hs108|chr17    (233 aa)
#  2    CCDS14669.1 SOX3 gene_id:6658|Hs108|chrX    (446 aa)
#  3    CCDS3239.1 SOX2 gene_id:6657|Hs108|chr3    (317 aa)
#  4    CCDS9523.1 SOX1 gene_id:6656|Hs108|chr13    (391 aa)
#  5    CCDS3094.1 SOX14 gene_id:8403|Hs108|chr3    (240 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    5.3e-63     1644  100.0         1     233
   2    1.4e-15      508   41.4        87     321
   3    2.5e-15      499   43.9        13     221
   4    1.1e-14      495   39.8        10     246
   5    2.3e-14      474   48.1         4     159

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   0  (    1)    MALPGSSQDQAWSLEPPAATAAASSSS----GPQEREGAG----SPAAPG------T---
   1  (    1)    MALPGSSQDQAWSLEPPAATAAASSSS----GPQEREGAG----SPAAPG------T---
   2  (   87)    ...PVGTPTQAAGTGGPAAPGGAGKSSANAAGGANSGGGS----SGGASG------GGGG
   3  (   13)    ...............................GPQQTSGGGGGNSTAAAAGGNQK--N---
   4  (   10)    .............LHSPGGAQAPTNLS----GPAGAGGGG----GGGGGGGGGGGAK---
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   44)    LPLEKVKRPMNAFMVWSSAQRRQMAQQNPKMHNSEISKRLGAQWKLLDEDEKRPFVEEAK
   1  (   44)    LPLEKVKRPMNAFMVWSSAQRRQMAQQNPKMHNSEISKRLGAQWKLLDEDEKRPFVEEAK
   2  (  134)    TDQDRVKRPMNAFMVWSRGQRRKMALENPKMHNSEISKRLGADWKLLTDAEKRPFIDEAK
   3  (   37)    SP-DRVKRPMNAFMVWSRGQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKLLSETEKRPFIDEAK
   4  (   46)    ANQDRVKRPMNAFMVWSRGQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKVMSEAEKRPFIDEAK
   5  (    4)    .PSDHIKRPMNAFMVWSRGQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKLLSEAEKRPYIDEAK

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   0  (  104)    RLRARHLRDYPDYKYRPRRKAKS---------------SGAGP-SRC------GQGRGNL
   1  (  104)    RLRARHLRDYPDYKYRPRRKAKS---------------SGAGP-SRC------GQGRGNL
   2  (  194)    RLRAVHMKEYPDYKYRPRRKTKTLLKKD----------KYSLP-SGL-------LPPGAA
   3  (   96)    RLRALHMKEHPDYKYRPRRKTKT---------------LMKKD-KYT------LPG-GLL
   4  (  106)    RLRALHMKEHPDYKYRPRRKTKTLLKKDKYSLAGGLLAAGAGG-GGAAVAMGVGVGVGAA
   5  (   63)    RLRAQHMKEHPDYKYRPRRKPKNLLKKD----------RYVFPLPYL------GDTDPLK

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   0  (  142)    ASGGPLWGPGYATTQP-SRGFGY-RPPSYS--TAYL--PGSYGSSHCKLEAPSPCSLPQS
   1  (  142)    ASGGPLWGPGYATTQP-SRGFGY-RPPSYS--TAYL--PGSYGSSHCKLEAPSPCSLPQS
   2  (  236)    AAAAAAAAAAAAASSP-V-GVGQ-RLDTYTHVNGWA--NGAYSLVQEQLGYAQPPSM--S
   3  (  133)    APGGNSMASGVGVGAGLGAGVNQ-RMDSYAHMNGWS--NGSYSMMQDQLGYPQH---PGL
   4  (  165)    AVGQRLESPGGAA------GGGYAHVNGWA--NGAY--PGSVAAAAAAAAMMQEAQLAYG
   5  (  107)    AAGLPVGASDGLLSAP-EKARAF-LPPASA--PYSLLDPAQFSSSAIQKMGEVPHTL---

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   0  (  196)    DPRLQGELLPTYTH---YLPPGSPTPYNP---PLAGAPMPLTHL
   1  (  196)    DPRLQGELLPTYTH---YLPPGSPTPYNP---PLAGAPMPLTHL
   2  (  289)    SPPPPPALPPMHRY---DMAGLQYSPMMP---PGAQSYM.....
   3  (  187)    NAHGAAQMQPMHRYDVSALQYNSMTSSQT---YMNGSP......
   4  (  215)    QHPGAGGAHP-HAH------PAHPHPHHPHAHPHNPQPM.....
   5  (    -)    ---.........................................

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