Multiple alignment for pF1KB6281
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB6281, 798 aa
#  1    CCDS3429.1 PPARGC1A gene_id:10891|Hs108|chr4    (798 aa)
#  2    CCDS7529.1 PPRC1 gene_id:23082|Hs108|chr10    (1664 aa)
#  3    CCDS73186.1 PPRC1 gene_id:23082|Hs108|chr10    (1400 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    1.7e-190    5401  100.0         1     798
   2    4.4e-19      787   29.8      1047    1664
   3    4.9e-17      666   31.5       898    1400

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   0  (    1)    MAWDMCNQDSESVWSDIECAALVGEDQPLCPDLPELDLSELDVNDLDTDSFLGGLKWCSD
   1  (    1)    MAWDMCNQDSESVWSDIECAALVGEDQPLCPDLPELDLSELDVNDLDTDSFLGGLKWCSD
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................

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   0  (   61)    QSEIISNQYNNEPSNIFEKIDEENEANLLAVLTETLDSLPVDEDGLPSFDALTDGDVTTD
   1  (   61)    QSEIISNQYNNEPSNIFEKIDEENEANLLAVLTETLDSLPVDEDGLPSFDALTDGDVTTD
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  121)    NEASPSSMPDGT---PPPQEAEEPSLLKKLLLAPANTQLSYNECSGLSTQNHAN------
   1  (  121)    NEASPSSMPDGT---PPPQEAEEPSLLKKLLLAPANTQLSYNECSGLSTQNHAN------
   2  ( 1047)    ...APQTEPTKVEVKPVPASPHPKHKVSALVQSPQMKALACVSAEGVTVEEPASERLKPE
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  172)    -HNHRIRTNPAIVKTENSWSNKAKSICQQQKPQRRPCS-ELLKYLTTNDDPPHTKPTENR
   1  (  172)    -HNHRIRTNPAIVKTENSWSNKAKSICQQQKPQRRPCS-ELLKYLTTNDDPPHTKPTENR
   2  ( 1104)    TQETRPREKPPLPATKAVPTPRQSTV--PKLPAVHPARLRKLSFLPT----PRTQGSEDV
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  230)    NSSRDKCTSKKKSHTQSQSQHLQAKPTTLSLPLTPESPNDP-----KGS---PFENKTIE
   1  (  230)    NSSRDKCTSKKKSHTQSQSQHLQAKPTTLSLPLTPESPNDP-----KGS---PFENKTIE
   2  ( 1158)    VQAFISEIGIEASDLSSLLEQFEKSEAKKECP--PPAPADSLAVGNSGGVDIPQEKRPLD
   3  (  898)    ........................QPPSLPLSMGPVLP-DPFT---HYA---PLPSWPCY

//
                                                                             
   0  (  282)    RTLSVELSGTAGLTPPTTPPHKANQDNPFRASPKLKSSCKTV-VPPPSKKPRYSESSGTQ
   1  (  282)    RTLSVELSGTAGLTPPTTPPHKANQDNPFRASPKLKSSCKTV-VPPPSKKPRYSESSGTQ
   2  ( 1216)    RLQAPELANVAGLTPPATPPHQLWK--PLAAVSLLAKA----------KSPKSTAQEGTL
   3  (  927)    PHVSP--SGYPCLPPPPTVPLVSGTPGAYAVPP----TCSVPWAPPPAPVSPYS-STCTY

//
                                                                             
   0  (  341)    GNNSTKKGPEQSELYAQLSKSSVLTGGHEERKTKRPSLRLFGDH----DYCQSINSKTEI
   1  (  341)    GNNSTKKGPEQSELYAQLSKSSVLTGGHEERKTKRPSLRLFGDH----DYCQSINSKTEI
   2  ( 1264)    KPEGVTEAKHPAAVRLQ-------EGVHGPSRVHVGS----GDH----DYC--VRSRTP-
   3  (  980)    GPLGWGPGPQHAPFWSTVPPPP-LPPASIGRAVPQPKMESRGTPAGPPENVLPLSMAPPL

//
                                                                             
   0  (  397)    LINI---SQELQDSRQLENKDV--SSDWQGQICSSTD-SDQ-----CYLRETLEASKQVS
   1  (  397)    LINI---SQELQDSRQLENKDV--SSDWQGQICSSTD-SDQ-----CYLRETLEASKQVS
   2  ( 1306)    -------PKKMP---ALVIPEV--GSRWN--VKRHQDITIK-----PVL--SLGPAAPPP
   3  ( 1039)    SLGLPGHGAPQTEPTKVEVKPVPASPHPKHKVSALVQ-SPQMKALACVSAEGVTVEE---

//
                                                                             
   0  (  446)    PC--STRKQLQDQEIRAELNKHFGHPSQAV---FDDEADKTGELRDSDFSNEQFSKLPMF
   1  (  446)    PC--STRKQLQDQEIRAELNKHFGHPSQAV---FDDEADKTGELRDSDFSNEQFSKLPMF
   2  ( 1345)    PCIAASREPL-DHRTSSEQ----ADPSAPC---LAPSSLLSPEA--SPCRNDMNTRTPPE
   3  ( 1095)    PA--SERLKPETQETRPR-EKPPLPATKAVPTPRQSTVPKLPAVHPARLRKLSFLPTPRT

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   0  (  501)    INSGLAMDGLFDDSEDESDKLSYPWDGTQSYSLFNVSPSCSSFNSPCRDSVSPPKSLFSQ
   1  (  501)    INSGLAMDGLFDDSEDESDKLSYPWDGTQSYSLFNVSPSCSSFNSPCRDSVSPPKSLFSQ
   2  ( 1395)    PSAKQRSMRCYRKACRSASPSSQGWQGRRGRNSRSVS-SGSNRTSEASSSSSSSSS----
   3  ( 1152)    QGSEDVVQAFISEIGIEASDLS---------SLLE------QFEKSEAKKECPPPA----

//
                                                                             
   0  (  561)    RPQRMRSRSRSFSRHRSCSRSPYSRSRSRSPGSRSSSRSCYYYESSHYRHRTHRNSPLYV
   1  (  561)    RPQRMRSRSRSFSRHRSCSRSPYSRSRSRSPGSRSSSRSCYYYESSHYRHRTHRNSPLYV
   2  ( 1450)    ---SSRSRSRSLS-------PPHKRWRRSSCSSSGRSRRCSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
   3  ( 1193)    -PADSLAVGNSGS---SCSSSGRSR-RCSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSRSRSRSPSP---

//
                                                                             
   0  (  621)    RSRSRSPYSRRPRYDSYEEYQHERLKREEYRREYEKRESERAKQRER--QRQKAIEERRV
   1  (  621)    RSRSRSPYSRRPRYDSYEEYQHERLKREEYRREYEKRESERAKQRER--QRQKAIEERRV
   2  ( 1500)    RSRSRSPSPRR---------------RSDRRRRYSSYRSHDHYQRQRVLQKERAIEERRV
   3  ( 1245)    RRRS----DRRRRYSSYRSHDH-------YQR-----------QRVL--QKERAIEERRV

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   0  (  679)    IYVGKIRPDTTRTELRDRFEVFGEIEECTVNLRDDGDSYGFITYRYTCDAFAALENGYTL
   1  (  679)    IYVGKIRPDTTRTELRDRFEVFGEIEECTVNLRDDGDSYGFITYRYTCDAFAALENGYTL
   2  ( 1545)    VFIGKIPGRMTRSELKQRFSVFGEIEECTIHFRVQGDNYGFVTYRYAEEAFAAIESGHKL
   3  ( 1281)    VFIGKIPGRMTRSELKQRFSVFGEIEECTIHFRVQGDNYGFVTYRYAEEAFAAIESGHKL

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   0  (  739)    RRSNETDFELYFCGRKQFFKSNYADLDSNSDDFDPASTKSKYDSLDFDSLLKEAQRSLRR
   1  (  739)    RRSNETDFELYFCGRKQFFKSNYADLDSNSDDFDPASTKSKYDSLDFDSLLKEAQRSLRR
   2  ( 1605)    RQADEQPFDLCFGGRRQFCKRSYSDLDSNREDFDPAPVKSKFDSLDFDTLLKQAQKNLRR
   3  ( 1341)    RQADEQPFDLCFGGRRQFCKRSYSDLDSNREDFDPAPVKSKFDSLDFDTLLKQAQKNLRR

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   0  (    -)    
   1  (    -)    
   2  (    -)    
   3  (    -)    

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