#  0    Query: pF1KB5901, 500 aa
#  1    CCDS3437.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4    (500 aa)
#  2    CCDS43219.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4    (487 aa)
#  3    CCDS3436.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4    (485 aa)
#  4    CCDS33969.1 RBPJ gene_id:3516|Hs108|chr4    (486 aa)
#  5    CCDS63283.1 RBPJL gene_id:11317|Hs108|chr20    (516 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    4.2e-206    3389  100.0         1     500
   2    2.8e-197    3248  100.0         7     487
   3    8.9e-197    3240  100.0         6     485
   4    8.9e-197    3240  100.0         7     486
   5    4.8e-96     1634   54.4        39     482

//
                                                                             
   0  (    1)    MDHTEGSPAEEPPAHAPSPGKFGERPPPKRLT--REAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQK
   1  (    1)    MDHTEGSPAEEPPAHAPSPGKFGERPPPKRLT--REAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQK
   2  (    7)    ...................GKFGERPPPKRLT--REAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQK
   3  (    6)    ....................KFGERPPPKRLT--REAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQK
   4  (    7)    ....................KFGERPPPKRLT--REAMRNYLKERGDQTVLILHAKVAQK
   5  (   39)    ..................PGTW-TRSSPEHTTILRGGVRRCLQQQCEQTVRILHAKVAQK

//
                                                                             
   0  (   59)    SYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGN---SDQEMQQL
   1  (   59)    SYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGN---SDQEMQQL
   2  (   46)    SYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGN---SDQEMQQL
   3  (   44)    SYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGN---SDQEMQQL
   4  (   45)    SYGNEKRFFCPPPCVYLMGSGWKKKKEQMERDGCSEQESQPCAFIGIGN---SDQEMQQL
   5  (   80)    SYGNEKRFFCPPPCVYLSGPGWRVKPGQDQAHQAGETGPTVCGYMGLDSASGSATETQKL

//
                                                                             
   0  (  116)    NLE----GKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKK
   1  (  116)    NLE----GKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKK
   2  (  103)    NLE----GKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKK
   3  (  101)    NLE----GKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKK
   4  (  102)    NLE----GKNYCTAKTLYISDSDKRKHFMLSVKMFYGNSDDIGVFLSKRIKVISKPSKKK
   5  (  140)    NFEQQPDSREFGCAKTLYISDADKRKHFRLVLRLVLRGGRELGTFHSRLIKVISKPSQKK

//
                                                                             
   0  (  172)    QSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFFIHLLDDDESE
   1  (  172)    QSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFFIHLLDDDESE
   2  (  159)    QSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFFIHLLDDDESE
   3  (  157)    QSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFFIHLLDDDESE
   4  (  158)    QSLKNADLCIASGTKVALFNRLRSQTVSTRYLHVEGGNFHASSQQWGAFFIHLLDDDESE
   5  (  200)    QSLKNTDLCISSGSKVSLFNRLRSQTVSTRYLSVEDGAFVASARQWAAFTLHLADGHSAQ

//
                                                                             
   0  (  232)    GEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLK
   1  (  232)    GEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLK
   2  (  219)    GEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLK
   3  (  217)    GEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLK
   4  (  218)    GEEFTVRDGYIHYGQTVKLVCSVTGMALPRLIIRKVDKQTALLDADDPVSQLHKCAFYLK
   5  (  260)    GD-FPPREGYVRYGSLVQLVCTVTGITLPPMIIRKVAKQCALLDVDEPISQLHKCAFQFP

//
                                                                             
   0  (  292)    DTER----MYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPV
   1  (  292)    DTER----MYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPV
   2  (  279)    DTER----MYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPV
   3  (  277)    DTER----MYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPV
   4  (  278)    DTER----MYLCLSQERIIQFQATPCPKEPNKEMINDGASWTIISTDKAEYTFYEGMGPV
   5  (  319)    GSPPGGGGTYLCLATEKVVQFQASPCPKEANRALLNDSSCWTIIGTESVEFSFSTSLACT

//
                                                                             
   0  (  348)    LAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPD
   1  (  348)    LAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPD
   2  (  335)    LAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPD
   3  (  333)    LAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPD
   4  (  334)    LAPVTPVPVVESLQLNGGGDVAMLELTGQNFTPNLRVWFGDVEAETMYRCGESMLCVVPD
   5  (  379)    LEPVTPVPLISTLELSGGGDVATLELHGENFHAGLKVWFGDVEAETMYS-PRSLVCVVPD

//
                                                                             
   0  (  408)    ISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQ
   1  (  408)    ISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQ
   2  (  395)    ISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQ
   3  (  393)    ISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQ
   4  (  394)    ISAFREGWRWVRQPVQVPVTLVRNDGIIYSTSLTFTYTPEPGPRPHCSAAGAILRANSSQ
   5  (  438)    VAAFCSDWRWLRAPITIPMSLVRADGLFYPSAFSFTYTPEYSVRP...............

//
                                                  
   0  (  468)    VPPNESNTNSEGSYTNASTNSTSVTSSTATVVS
   1  (  468)    VPPNESNTNSEGSYTNASTNSTSVTSSTATVVS
   2  (  455)    VPPNESNTNSEGSYTNASTNSTSVTSSTATVVS
   3  (  453)    VPPNESNTNSEGSYTNASTNSTSVTSSTATVVS
   4  (  454)    VPPNESNTNSEGSYTNASTNSTSVTSSTATVVS
   5  (    -)    .................................

//