# 0 Query: pF1KB5787, 829 aa
# 1 CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 (829 aa)
# 2 CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 (784 aa)
# 3 CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 (882 aa)
# 4 CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (875 aa)
# 5 CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (906 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 5560 100.0 1 829
2 0 5098 100.0 1 760
3 4.6e-180 3073 54.9 20 882
4 4.5e-85 2195 46.2 99 875
5 4.6e-85 2195 46.2 130 906
//
0 ( 1) MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKV-FMGCP
1 ( 1) MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKV-FMGCP
2 ( 1) MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKV-FMGCP
3 ( 20) .................WL-CQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFEDCT
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 60) G-QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNP--------------------------
1 ( 60) G-QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNP--------------------------
2 ( 60) G-QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNP--------------------------
3 ( 62) GRQRTAYFSLDTR-FKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNTVG
4 ( 99) ....................ESVKESAEVEE-----------------------------
5 ( 130) ....................ESVKESAEVEE-----------------------------
//
0 ( 93) ------------------LKIFP---SKRI--LRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLN
1 ( 93) ------------------LKIFP---SKRI--LRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLN
2 ( 93) ------------------LKIFP---SKRI--LRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLN
3 ( 121) HHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPN--SSPG--LRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLV
4 ( 110) -------------------IVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELV
5 ( 141) -------------------IVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELV
//
0 ( 130) QLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVS
1 ( 130) QLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVS
2 ( 130) QLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVS
3 ( 177) QIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVS
4 ( 151) RIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVD
5 ( 182) RIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVD
//
0 ( 190) ENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTY
1 ( 190) ENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTY
2 ( 190) ENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTY
3 ( 237) SNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTY
4 ( 211) INGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDP-NAL
5 ( 242) INGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDP-NAL
//
0 ( 250) NGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGD---
1 ( 250) NGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGD---
2 ( 250) NGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGD---
3 ( 297) NAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGE---
4 ( 270) NGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTY
5 ( 301) NGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTY
//
0 ( 307) GSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATY
1 ( 307) GSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATY
2 ( 307) GSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATY
3 ( 354) GLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVY
4 ( 330) GLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVY
5 ( 361) GLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVY
//
0 ( 367) LIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPF---VLKLPTS
1 ( 367) LIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPF---VLKLPTS
2 ( 367) LIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPF---VLKLPTS
3 ( 414) TILN-DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPF---EVSLTTS
4 ( 390) RISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQS
5 ( 421) RISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQS
//
0 ( 424) TATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQK-ISYRILRD
1 ( 424) TATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQK-ISYRILRD
2 ( 424) TATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQK-ISYRILRD
3 ( 470) TATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQK-ITYRIWRD
4 ( 450) TATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDR-YMQQNIRYTKLSD
5 ( 481) TATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDR-YMQQNIRYTKLSD
//
0 ( 482) PAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDV
1 ( 482) PAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDV
2 ( 482) PAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDV
3 ( 529) TANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDV
4 ( 509) PANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPN-VKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDI
5 ( 540) PANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPN-VKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDI
//
0 ( 542) NDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNIT--DKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIY---WTAEVN
1 ( 542) NDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNIT--DKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIY---WTAEVN
2 ( 542) NDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNIT--DKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIY---WTAEVN
3 ( 589) NDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINII--DADLPPNTSPFTAELTHGASAN---WTIQYN
4 ( 568) NDNAPQVLPQEAETC-ETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTI-TR
5 ( 599) NDNAPQVLPQEAETC-ETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTI-TR
//
0 ( 597) EEG-DTVVLSLK-KFLKQDTYDVHLSLSDHGN--KEQLTVIRATVCDCHGH-----VETC
1 ( 597) EEG-DTVVLSLK-KFLKQDTYDVHLSLSDHGN--KEQLTVIRATVCDCHGH-----VETC
2 ( 597) EEG-DTVVLSLK-KFLKQDTYDVHLSLSDHGN--KEQLTVIRATVCDCHGH-----VETC
3 ( 644) DPTQESIILKPK-MALEVGDYKINLKLMDNQN--KDQVTTLEVSVCDCEGA-----AGVC
4 ( 626) LNG-DFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRI
5 ( 657) LNG-DFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRI
//
0 ( 648) --PGPWKG-GFILP----VLGAVLALLFLLLVLLLLVR---KKRKIKEPLLLPEDDTRDN
1 ( 648) --PGPWKG-GFILP----VLGAVLALLFLLLVLLLLVR---KKRKIKEPLLLPEDDTRDN
2 ( 648) --PGPWKG-GFILP----VLGAVLALLFLLLVLLLLVR---KKRKIKEPLLLPEDDTRDN
3 ( 696) RKAQPVEA-GLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLR---RRAVVKEPLLPPEDDTRDN
4 ( 685) --VGAGLGTGAIIA----ILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDN
5 ( 716) --VGAGLGTGAIIA----ILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDN
//
0 ( 698) VFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVL-----RNDVAPTIIPTPMYRPRPA--N
1 ( 698) VFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVL-----RNDVAPTIIPTPMYRPRPA--N
2 ( 698) VFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVL-----RNDVAPTIIPTPMYRPRPA--N
3 ( 752) VYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVT------RNDVAPTLMSVPRYLPRPA--N
4 ( 739) ILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERP-IHAEPQYPVRSAAPH
5 ( 770) ILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERP-IHAEPQYPVRSAAPH
//
0 ( 751) PDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLN
1 ( 751) PDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLN
2 ( 751) PDEIGNFIIE..................................................
3 ( 804) PDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLN
4 ( 798) PGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLN
5 ( 829) PGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLN
//
0 ( 811) EWGSRFKKLADMYGGGEDD
1 ( 811) EWGSRFKKLADMYGGGEDD
2 ( -) ...................
3 ( 864) EWGNRFKKLADMYGGGEDD
4 ( 858) DWGPRFKKLADMYGGGDD.
5 ( 889) DWGPRFKKLADMYGGGDD.
//