# 0 Query: pF1KB0431, 476 aa
# 1 CCDS9543.1 UPF3A gene_id:65110|Hs108|chr13 (476 aa)
# 2 CCDS9544.1 UPF3A gene_id:65110|Hs108|chr13 (443 aa)
# 3 CCDS14587.1 UPF3B gene_id:65109|Hs108|chrX (470 aa)
# 4 CCDS14588.1 UPF3B gene_id:65109|Hs108|chrX (483 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 2.5e-93 3186 100.0 1 476
2 6.1e-58 2900 93.1 1 443
3 7.9e-35 1336 46.3 3 459
4 5.3e-28 1300 45.1 3 472
//
0 ( 1) MRSEKEGAGGLRAAVAARGPSGREKLSALEVQFHRDSQQQEAETPPTSSSGCGGGA----
1 ( 1) MRSEKEGAGGLRAAVAARGPSGREKLSALEVQFHRDSQQQEAETPPTSSSGCGGGA----
2 ( 1) MRSEKEGAGGLRAAVAARGPSGREKLSALEVQFHRDSQQQEAETPPTSSSGCGGGA----
3 ( 3) .............................EEKEHRPKEKRVTLLTPAGATGSGGGTSGDS
4 ( 3) .............................EEKEHRPKEKRVTLLTPAGATGSGGGTSGDS
//
0 ( 57) --GKPRE----EKRTALSKVVIRRLPPGLTKEQLEEQLRPLPAHDYFEFFAADLSLYPHL
1 ( 57) --GKPRE----EKRTALSKVVIRRLPPGLTKEQLEEQLRPLPAHDYFEFFAADLSLYPHL
2 ( 57) --GKPRE----EKRTALSKVVIRRLPPGLTKEQLEEQLRPLPAHDYFEFFAADLSLYPHL
3 ( 34) SKGEDKQDRNKEKKEALSKVVIRRLPPTLTKEQLQEHLQPMPEHDYFEFFSNDTSLYPHM
4 ( 34) SKGEDKQDRNKEKKEALSKVVIRRLPPTLTKEQLQEHLQPMPEHDYFEFFSNDTSLYPHM
//
0 ( 111) YSRAYINFRNPDDILLFRDRFDGYIFLDSKGLEYPAVVEFAPFQKIAKKKLRKKDAKTGS
1 ( 111) YSRAYINFRNPDDILLFRDRFDGYIFLDSKGLEYPAVVEFAPFQKIAKKKLRKKDAKTGS
2 ( 111) YSRAYINFRNPDDILLFRDRFDGYIFLDSK------------------------------
3 ( 94) YARAYINFKNQEDIILFRDRFDGYVFLDNKGQEYPAIVEFAPFQKAAKKKTKKRDTKVGT
4 ( 94) YARAYINFKNQEDIILFRDRFDGYVFLDNKGQEYPAIVEFAPFQKAAKKKTKKRDTKVGT
//
0 ( 171) IEDDPEYKKFLETYCVEEEKTSANPETLLGEMEAKTRELIARRTTPLLEYIKNRKLEKQR
1 ( 171) IEDDPEYKKFLETYCVEEEKTSANPETLLGEMEAKTRELIARRTTPLLEYIKNRKLEKQR
2 ( 141) ---DPEYKKFLETYCVEEEKTSANPETLLGEMEAKTRELIARRTTPLLEYIKNRKLEKQR
3 ( 154) IDDDPEYRKFLESYATDNEKMTSTPETLLEEIEAKNRELIAKKTTPLLSFLKN----KQR
4 ( 154) IDDDPEYRKFLESYATDNEKMTSTPETLLEEIEAKNRELIAKKTTPLLSFLKN----KQR
//
0 ( 231) IREEKREERRRRELEKKRLREEEKRRRREEERCKKKETDKQKKIA--------EKEVRIK
1 ( 231) IREEKREERRRRELEKKRLREEEKRRRREEERCKKKETDKQKKIA--------EKEVRIK
2 ( 198) IREEKREERRRRELEKKRLREEEKRRRREEERCKKKETDKQKKIA--------EKEVRIK
3 ( 210) MREEKREERRRREIERKRQREEERRKWKEEEKRKRKDIEKLKKIDRIPERDKLKDEPKIK
4 ( 210) MREEKREERRRREIERKRQREEERRKWKEEEKRKRKDIEKLKKIDRIPERDKLKDEPKIK
//
0 ( 283) -------------LLKKPEKGEEPTTEKPKERGEEIDTGGGKQESCAPGAVVKARPMEGS
1 ( 283) -------------LLKKPEKGEEPTTEKPKERGEEIDTGGGKQESCAPGAVVKARPMEGS
2 ( 250) -------------LLKKPEKGEEPTTEKPKERGEEIDTGGGKQESCAPGAVVKARPMEGS
3 ( 270) -------------LLKKPEKGDEKELDK-REKAKKLDKENLSDERASGQSCTLPKRSDSE
4 ( 270) VHRFLLQAVNQKNLLKKPEKGDEKELDK-REKAKKLDKENLSDERASGQSCTLPKRSDSE
//
0 ( 330) L--EEPQET-SHSGSD--KEHRDVERSQEQ---ESEAQRYHVDDGRRHRAHHEPERLSRR
1 ( 330) L--EEPQET-SHSGSD--KEHRDVERSQEQ---ESEAQRYHVDDGRRHRAHHEPERLSRR
2 ( 297) L--EEPQET-SHSGSD--KEHRDVERSQEQ---ESEAQRYHVDDGRRHRAHHEPERLSRR
3 ( 316) LKDEKPKRPEDESGRDYREREREYERDQERILRERERLKRQEEERRRQKERYEKEKTFKR
4 ( 329) LKDEKPKRPEDESGRDYREREREYERDQERILRERERLKRQEEERRRQKERYEKEKTFKR
//
0 ( 382) SEDEQRWGKGPGQDRGKKGSQDSGAPGEAMERLGRAQRCDDSP-APRKERLANKDRPALQ
1 ( 382) SEDEQRWGKGPGQDRGKKGSQDSGAPGEAMERLGRAQRCDDSP-APRKERLANKDRPALQ
2 ( 349) SEDEQRWGKGPGQDRGKKGSQDSGAPGEAMERLGRAQRCDDSP-APRKERLANKDRPALQ
3 ( 376) KEEEMKKEKDTLRDKGKKA--------ESTESIGSSEKTEKKEEVVKRDRIRNKDRPAMQ
4 ( 389) KEEEMKKEKDTLRDKGKKA--------ESTESIGSSEKTEKKEEVVKRDRIRNKDRPAMQ
//
0 ( 441) LYDPGARFRARECGGNRRICKAEGSGTGPEKREEAE
1 ( 441) LYDPGARFRARECGGNRRICKAEGSGTGPEKREEAE
2 ( 408) LYDPGARFRARECGGNRRICKAEGSGTGPEKREEAE
3 ( 428) LYQPGARSRNRLCPPDD---STKSGDSAAERKQES.
4 ( 441) LYQPGARSRNRLCPPDD---STKSGDSAAERKQES.
//