# 0 Query: pF1KSDA0126, 1073 aa
# 1 CCDS8396.1 UBE4A gene_id:9354|Hs108|chr11 (1073 aa)
# 2 CCDS55790.1 UBE4A gene_id:9354|Hs108|chr11 (1066 aa)
# 3 CCDS110.1 UBE4B gene_id:10277|Hs108|chr1 (1173 aa)
# 4 CCDS41245.1 UBE4B gene_id:10277|Hs108|chr1 (1302 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 7071 99.9 1 1073
2 0 6995 99.2 1 1066
3 5.8e-43 1058 27.4 294 1169
4 6.4e-43 1058 27.4 423 1298
//
0 ( 1) MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQSDELPASPDDSDNSVSESLDE
1 ( 1) MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQSDELPASPDDSDNSVSESLDE
2 ( 1) MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQSDELPASPDDSDNSVSESLDE
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
//
0 ( 61) FDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMA
1 ( 61) FDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMA
2 ( 61) FDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMA
3 ( -) ............................................................
4 ( -) ............................................................
//
0 ( 121) VELEDQDWLDMSNVEQALFARLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSC
1 ( 121) VELEDQDWLDMSNVEQALFARLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSC
2 ( 121) VELEDQDWLDMSNVEQALFARLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSC
3 ( 294) .................................................ETDMLNYLIEC
4 ( 423) .................................................ETDMLNYLIEC
//
*
0 ( 181) FQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTLEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGA
1 ( 181) FQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGA
2 ( 181) FQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGA
3 ( 305) FDRVGIEEKKAPKMCSQPAV---SQLLSNIRSQCISHTALVLQGSLTQPRSLQQPSFLVP
4 ( 434) FDRVGIEEKKAPKMCSQPAV---SQLLSNIRSQCISHTALVLQGSLTQPRSLQQPSFLVP
//
0 ( 241) REYMNKIYFEDVTEFLEEVIEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIK----DLELCQIL
1 ( 241) REYMNKIYFEDVTEFLEEVIEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIK----DLELCQIL
2 ( 241) -------HFEDVTEFLEEVIEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIK----DLELCQIL
3 ( 362) YMLCRNLPY----GFIQELVRTTHQDEEV--FKQIFIPILQGLALAAKECSLDSDYFKYP
4 ( 491) YMLCRNLPY----GFIQELVRTTHQDEEV--FKQIFIPILQGLALAAKECSLDSDYFKYP
//
0 ( 297) LYAYLDIL-LYFTRQKDMAKVF--VEYIQPKD--PTNGQMYQK-TLLGVILSISCLLKTP
1 ( 297) LYAYLDIL-LYFTRQKDMAKVF--VEYIQPKD--PTNGQMYQK-TLLGVILSISCLLKTP
2 ( 290) LYAYLDIL-LYFTRQKDMAKVF--VEYIQPKD--PTNGQMYQK-TLLGVILSISCLLKTP
3 ( 416) LMALGELCETKFGKTHPVCNLVASLRLWLPKSLSPGCGRELQRLSYLGAFFSFSVFAEDD
4 ( 545) LMALGELCETKFGKTHPVCNLVASLRLWLPKSLSPGCGRELQRLSYLGAFFSFSVFAEDD
//
0 ( 351) -GVVENHGYFLNPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSW
1 ( 351) -GVVENHGYFLNPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSW
2 ( 344) -GVVENHGYFLNPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSW
3 ( 476) VKVVEK--YFSGPA-ITLENTRVVSQSLQHYLELGRQELFKILHSIL-LNGETREAALSY
4 ( 605) VKVVEK--YFSGPA-ITLENTRVVSQSLQHYLELGRQELFKILHSIL-LNGETREAALSY
//
0 ( 410) LGNCLHANAGRTKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNP
1 ( 410) LGNCLHANAGRTKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNP
2 ( 403) LGNCLHANAGRTKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNP
3 ( 532) MAAVVNANMKKAQMQTDD------RLVSTDGFMLNFLWVLQQLSTKI------KLETVDP
4 ( 661) MAAVVNANMKKAQMQTDD------RLVSTDGFMLNFLWVLQQLSTKI------KLETVDP
//
0 ( 470) TY-----CALKELNDEERKIKNVHMRGL-DKETCLI---PAVQEPKFPQNYNLVT---EN
1 ( 470) TY-----CALKELNDEERKIKNVHMRGL-DKETCLI---PAVQEPKFPQNYNLVT---EN
2 ( 463) TY-----CALKELNDEERKIKNVHMRGL-DKETCLI---PAVQEPKFPQNYNLVT---EN
3 ( 580) TYIFHPRCRITLPNDETR--VNATMEDVNDWLTELYGDQPPFSEPKFPTECFFLTLHAHH
4 ( 709) TYIFHPRCRITLPNDETR--VNATMEDVNDWLTELYGDQPPFSEPKFPTECFFLTLHAHH
//
0 ( 518) LA-LTEYTLYLGFHRLHDQMVKINQNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADNLRE-------QFE
1 ( 518) LA-LTEYTLYLGFHRLHDQMVKINQNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADNLRE-------QFE
2 ( 511) LA-LTEYTLYLGFHRLHDQMVKINQNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADNLRE-------QFE
3 ( 638) LSILPSCRRYIRRLRAIRELNRTVEDLKNNESQWKD-----SPLATRHREMLKRCKTQLK
4 ( 767) LSILPSCRRYIRRLRAIRELNRTVEDLKNNESQWKD-----SPLATRHREMLKRCKTQLK
//
0 ( 570) RLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELTFPL-PDGYSSL
1 ( 570) RLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELTFPL-PDGYSSL
2 ( 563) RLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELTFPL-PDGYSSL
3 ( 693) KLVRCKACADAGLLDESFLRRCLNFYG----LLIQLLLRILDPAYPDITLPLNSDVPKVF
4 ( 822) KLVRCKACADAGLLDESFLRRCLNFYG----LLIQLLLRILDPAYPDITLPLNSDVPKVF
//
0 ( 629) AYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLA
1 ( 629) AYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLA
2 ( 622) AYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLA
3 ( 749) AALPEFYVEDVAEFLFFIVQYSPQALYEPCT--QDIVMFLVVMLCNQNYIRNPYLVAKLV
4 ( 878) AALPEFYVEDVAEFLFFIVQYSPQALYEPCT--QDIVMFLVVMLCNQNYIRNPYLVAKLV
//
0 ( 689) EVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFQYAPQL-AEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQ
1 ( 689) EVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFQYAPQL-AEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQ
2 ( 682) EVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFQYAPQL-AEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQ
3 ( 807) EVMFMTNPAVQ----PRTQKFFE---MIENHPLSTKLLVPSLMKFYTDVEHTGATSEFYD
4 ( 936) EVMFMTNPAVQ----PRTQKFFE---MIENHPLSTKLLVPSLMKFYTDVEHTGATSEFYD
//
0 ( 748) KFNYRRPMYPILRYMWGTDTYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLD
1 ( 748) KFNYRRPMYPILRYMWGTDTYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLD
2 ( 741) KFNYRRPMYPILRYMWGTDTYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLD
3 ( 860) KFTIRYHISTIFKSLW---------QNIAHHGTFMEEFNSGKQFVRYINMLINDTTFLLD
4 ( 989) KFTIRYHISTIFKSLW---------QNIAHHGTFMEEFNSGKQFVRYINMLINDTTFLLD
//
0 ( 808) EAIQYLSKI-KIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAF
1 ( 808) EAIQYLSKI-KIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAF
2 ( 801) EAIQYLSKI-KIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAF
3 ( 911) ESLESLKRIHEVQEEMKNKEQWDQLPRDQQQARQSQLAQDERVSRSYLALATETVDMFHI
4 ( 1040) ESLESLKRIHEVQEEMKNKEQWDQLPRDQQQARQSQLAQDERVSRSYLALATETVDMFHI
//
0 ( 867) LTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKMGALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIY
1 ( 867) LTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKMGALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIY
2 ( 860) LTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKMGALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIY
3 ( 971) LTKQVQKPFLRPELGPRLAAMLNFNLQQLCGPKCRDLKVENPEKYGFEPKKLLDQLTDIY
4 ( 1100) LTKQVQKPFLRPELGPRLAAMLNFNLQQLCGPKCRDLKVENPEKYGFEPKKLLDQLTDIY
//
0 ( 927) LNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKKIN-KPGNMIMAFSNLAERIKSLADLQ
1 ( 927) LNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKKIN-KPGNMIMAFSNLAERIKSLADLQ
2 ( 920) LNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKKIN-KPGNMIMAFSNLAERIKSLADLQ
3 ( 1031) LQL-DCARFAKAIADDQRSYSKELFEEVISKMRKAGIKSTIAIEKFKLLAEKVEEIVAKN
4 ( 1160) LQL-DCARFAKAIADDQRSYSKELFEEVISKMRKAGIKSTIAIEKFKLLAEKVEEIVAKN
//
0 ( 986) QQEEETYADACDEFLDPIMSTLMCDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTM
1 ( 986) QQEEETYADACDEFLDPIMSTLMCDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTM
2 ( 979) QQEEETYADACDEFLDPIMSTLMCDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTM
3 ( 1090) ARAEIDYSDAPDEFRDPLMDTLMTDPVRLPSGTI-MDRSIILRHLLNSPTDPFNRQTLTE
4 ( 1219) ARAEIDYSDAPDEFRDPLMDTLMTDPVRLPSGTI-MDRSIILRHLLNSPTDPFNRQTLTE
//
0 ( 1046) DQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE
1 ( 1046) DQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE
2 ( 1039) DQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE
3 ( 1149) SMLEPVPELKEQIQAWMREKQ.......
4 ( 1278) SMLEPVPELKEQIQAWMREKQ.......
//
