# 0 Query: pF1KE9645, 2492 aa
# 1 CCDS14434.1 ATRX gene_id:546|Hs108|chrX (2492 aa)
# 2 CCDS14435.1 ATRX gene_id:546|Hs108|chrX (2454 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 16258 100.0 1 2492
2 0 15919 98.5 1 2454
//
0 ( 1) MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETSSPPRLAMNQNTDKISGSGSNSDMMENS
1 ( 1) MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETSSPPRLAMNQNTDKISGSGSNSDMMENS
2 ( 1) MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETSSPPRLAMNQNTDKISGSGSNSDMMENS
//
0 ( 61) KEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSIVTKYVESDDEKPLDDETVNEDASNENSENDITMQS
1 ( 61) KEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSIVTKYVESDDEKPLDDETVNEDASNENSENDITMQS
2 ( 61) KEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSIVTKYVESDDEKPLDDETVNEDASNENSENDITMQS
//
0 ( 121) LPKGTVIVQPEPVLNEDKDDFKGPEFRSRSKMKTENLKKRGEDGLHGIVSCTACGQQVNH
1 ( 121) LPKGTVIVQPEPVLNEDKDDFKGPEFRSRSKMKTENLKKRGEDGLHGIVSCTACGQQVNH
2 ( 121) LPK--------------------------------------EDGLHGIVSCTACGQQVNH
//
0 ( 181) FQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFC
1 ( 181) FQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFC
2 ( 143) FQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFC
//
0 ( 241) KKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKV
1 ( 241) KKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKV
2 ( 203) KKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKV
//
0 ( 301) DSEKSNKVYEHTSRFSPKKTSSNCNGEEKKLDDSCSGSVTYSYSALIVPKEMIKKAKKLI
1 ( 301) DSEKSNKVYEHTSRFSPKKTSSNCNGEEKKLDDSCSGSVTYSYSALIVPKEMIKKAKKLI
2 ( 263) DSEKSNKVYEHTSRFSPKKTSSNCNGEEKKLDDSCSGSVTYSYSALIVPKEMIKKAKKLI
//
0 ( 361) ETTANMNSSYVKFLKQATDNSEISSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHLALEEDLNSEFRAM
1 ( 361) ETTANMNSSYVKFLKQATDNSEISSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHLALEEDLNSEFRAM
2 ( 323) ETTANMNSSYVKFLKQATDNSEISSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHLALEEDLNSEFRAM
//
0 ( 421) DAVNKEKNTKEHKVIDAKFETKARKGEKPCALEKKDISKSEAKLSRKQVDSEHMHQNVPT
1 ( 421) DAVNKEKNTKEHKVIDAKFETKARKGEKPCALEKKDISKSEAKLSRKQVDSEHMHQNVPT
2 ( 383) DAVNKEKNTKEHKVIDAKFETKARKGEKPCALEKKDISKSEAKLSRKQVDSEHMHQNVPT
//
0 ( 481) EEQRTNKSTGGEHKKSDRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQS
1 ( 481) EEQRTNKSTGGEHKKSDRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQS
2 ( 443) EEQRTNKSTGGEHKKSDRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQS
//
0 ( 541) SVDHQGDGSSGTEQEVESSSVKLNISSKDNRGGIKSKTTAKVTKELYVKLTPVSLSNSPI
1 ( 541) SVDHQGDGSSGTEQEVESSSVKLNISSKDNRGGIKSKTTAKVTKELYVKLTPVSLSNSPI
2 ( 503) SVDHQGDGSSGTEQEVESSSVKLNISSKDNRGGIKSKTTAKVTKELYVKLTPVSLSNSPI
//
0 ( 601) KGADCQEVPQDKDGYKSCGLNPKLEKCGLGQENSDNEHLVENEVSLLLEESDLRRSPRVK
1 ( 601) KGADCQEVPQDKDGYKSCGLNPKLEKCGLGQENSDNEHLVENEVSLLLEESDLRRSPRVK
2 ( 563) KGADCQEVPQDKDGYKSCGLNPKLEKCGLGQENSDNEHLVENEVSLLLEESDLRRSPRVK
//
0 ( 661) TTPLRRPTETNPVTSNSDEECNETVKEKQKLSVPVRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSK
1 ( 661) TTPLRRPTETNPVTSNSDEECNETVKEKQKLSVPVRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSK
2 ( 623) TTPLRRPTETNPVTSNSDEECNETVKEKQKLSVPVRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSK
//
0 ( 721) QSETVDQNSDSDEMLAILKEVSRMSHSSSSDTDINEIHTNHKTLYDLKTQAGKDDKGKRK
1 ( 721) QSETVDQNSDSDEMLAILKEVSRMSHSSSSDTDINEIHTNHKTLYDLKTQAGKDDKGKRK
2 ( 683) QSETVDQNSDSDEMLAILKEVSRMSHSSSSDTDINEIHTNHKTLYDLKTQAGKDDKGKRK
//
0 ( 781) RKSSTSGSDFDTKKGKSAKSSIISKKKRQTQSESSNYDSELEKEIKSMSKIGAARTTKKR
1 ( 781) RKSSTSGSDFDTKKGKSAKSSIISKKKRQTQSESSNYDSELEKEIKSMSKIGAARTTKKR
2 ( 743) RKSSTSGSDFDTKKGKSAKSSIISKKKRQTQSESSNYDSELEKEIKSMSKIGAARTTKKR
//
0 ( 841) IPNTKDFDSSEDEKHSKKGMDNQGHKNLKTSQEGSSDDAERKQERETFSSAEGTVDKDTT
1 ( 841) IPNTKDFDSSEDEKHSKKGMDNQGHKNLKTSQEGSSDDAERKQERETFSSAEGTVDKDTT
2 ( 803) IPNTKDFDSSEDEKHSKKGMDNQGHKNLKTSQEGSSDDAERKQERETFSSAEGTVDKDTT
//
0 ( 901) IMELRDRLPKKQQASASTDGVDKLSGKEESFTSLEVRKVAETKEKSKHLKTKTCKKVQDG
1 ( 901) IMELRDRLPKKQQASASTDGVDKLSGKEESFTSLEVRKVAETKEKSKHLKTKTCKKVQDG
2 ( 863) IMELRDRLPKKQQASASTDGVDKLSGKEESFTSLEVRKVAETKEKSKHLKTKTCKKVQDG
//
0 ( 961) LSDIAEKFLKKDQSDETSEDDKKQSKKGTEEKKKPSDFKKKVIKMEQQYESSSDGTEKLP
1 ( 961) LSDIAEKFLKKDQSDETSEDDKKQSKKGTEEKKKPSDFKKKVIKMEQQYESSSDGTEKLP
2 ( 923) LSDIAEKFLKKDQSDETSEDDKKQSKKGTEEKKKPSDFKKKVIKMEQQYESSSDGTEKLP
//
0 ( 1021) EREEICHFPKGIKQIKNGTTDGEKKSKKIRDKTSKKKDELSDYAEKSTGKGDSCDSSEDK
1 ( 1021) EREEICHFPKGIKQIKNGTTDGEKKSKKIRDKTSKKKDELSDYAEKSTGKGDSCDSSEDK
2 ( 983) EREEICHFPKGIKQIKNGTTDGEKKSKKIRDKTSKKKDELSDYAEKSTGKGDSCDSSEDK
//
0 ( 1081) KSKNGAYGREKKRCKLLGKSSRKRQDCSSSDTEKYSMKEDGCNSSDKRLKRIELRERRNL
1 ( 1081) KSKNGAYGREKKRCKLLGKSSRKRQDCSSSDTEKYSMKEDGCNSSDKRLKRIELRERRNL
2 ( 1043) KSKNGAYGREKKRCKLLGKSSRKRQDCSSSDTEKYSMKEDGCNSSDKRLKRIELRERRNL
//
0 ( 1141) SSKRNTKEIQSGSSSSDAEESSEDNKKKKQRTSSKKKAVIVKEKKRNSLRTSTKRKQADI
1 ( 1141) SSKRNTKEIQSGSSSSDAEESSEDNKKKKQRTSSKKKAVIVKEKKRNSLRTSTKRKQADI
2 ( 1103) SSKRNTKEIQSGSSSSDAEESSEDNKKKKQRTSSKKKAVIVKEKKRNSLRTSTKRKQADI
//
0 ( 1201) TSSSSSDIEDDDQNSIGEGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEALSKSVPVTVDD
1 ( 1201) TSSSSSDIEDDDQNSIGEGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEALSKSVPVTVDD
2 ( 1163) TSSSSSDIEDDDQNSIGEGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEALSKSVPVTVDD
//
0 ( 1261) DDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKNQV
1 ( 1261) DDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKNQV
2 ( 1223) DDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKNQV
//
0 ( 1321) NSESDSDSEESKKPRYRHRLLRHKLTVSDGESGEEKKTKPKEHKEVKGRNRRKVSSEDSE
1 ( 1321) NSESDSDSEESKKPRYRHRLLRHKLTVSDGESGEEKKTKPKEHKEVKGRNRRKVSSEDSE
2 ( 1283) NSESDSDSEESKKPRYRHRLLRHKLTVSDGESGEEKKTKPKEHKEVKGRNRRKVSSEDSE
//
0 ( 1381) DSDFQESGVSEEVSESEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQKKKRRRIKVQEDSSSENKS
1 ( 1381) DSDFQESGVSEEVSESEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQKKKRRRIKVQEDSSSENKS
2 ( 1343) DSDFQESGVSEEVSESEDEQRPRTRSAKKAELEENQRSYKQKKKRRRIKVQEDSSSENKS
//
0 ( 1441) NSEEEEEEKEEEEEEEEEEEEEEEDENDDSKSPGKGRKKIRKILKDDKLRTETQNALKEE
1 ( 1441) NSEEEEEEKEEEEEEEEEEEEEEEDENDDSKSPGKGRKKIRKILKDDKLRTETQNALKEE
2 ( 1403) NSEEEEEEKEEEEEEEEEEEEEEEDENDDSKSPGKGRKKIRKILKDDKLRTETQNALKEE
//
0 ( 1501) EERRKRIAEREREREKLREVIEIEDASPTKCPITTKLVLDEDEETKEPLVQVHRNMVIKL
1 ( 1501) EERRKRIAEREREREKLREVIEIEDASPTKCPITTKLVLDEDEETKEPLVQVHRNMVIKL
2 ( 1463) EERRKRIAEREREREKLREVIEIEDASPTKCPITTKLVLDEDEETKEPLVQVHRNMVIKL
//
0 ( 1561) KPHQVDGVQFMWDCCCESVKKTKKSPGSGCILAHCMGLGKTLQVVSFLHTVLLCDKLDFS
1 ( 1561) KPHQVDGVQFMWDCCCESVKKTKKSPGSGCILAHCMGLGKTLQVVSFLHTVLLCDKLDFS
2 ( 1523) KPHQVDGVQFMWDCCCESVKKTKKSPGSGCILAHCMGLGKTLQVVSFLHTVLLCDKLDFS
//
0 ( 1621) TALVVCPLNTALNWMNEFEKWQEGLKDDEKLEVSELATVKRPQERSYMLQRWQEDGGVMI
1 ( 1621) TALVVCPLNTALNWMNEFEKWQEGLKDDEKLEVSELATVKRPQERSYMLQRWQEDGGVMI
2 ( 1583) TALVVCPLNTALNWMNEFEKWQEGLKDDEKLEVSELATVKRPQERSYMLQRWQEDGGVMI
//
0 ( 1681) IGYEMYRNLAQGRNVKSRKLKEIFNKALVDPGPDFVVCDEGHILKNEASAVSKAMNSIRS
1 ( 1681) IGYEMYRNLAQGRNVKSRKLKEIFNKALVDPGPDFVVCDEGHILKNEASAVSKAMNSIRS
2 ( 1643) IGYEMYRNLAQGRNVKSRKLKEIFNKALVDPGPDFVVCDEGHILKNEASAVSKAMNSIRS
//
0 ( 1741) RRRIILTGTPLQNNLIEYHCMVNFIKENLLGSIKEFRNRFINPIQNGQCADSTMVDVRVM
1 ( 1741) RRRIILTGTPLQNNLIEYHCMVNFIKENLLGSIKEFRNRFINPIQNGQCADSTMVDVRVM
2 ( 1703) RRRIILTGTPLQNNLIEYHCMVNFIKENLLGSIKEFRNRFINPIQNGQCADSTMVDVRVM
//
0 ( 1801) KKRAHILYEMLAGCVQRKDYTALTKFLPPKHEYVLAVRMTSIQCKLYQYYLDHLTGVGNN
1 ( 1801) KKRAHILYEMLAGCVQRKDYTALTKFLPPKHEYVLAVRMTSIQCKLYQYYLDHLTGVGNN
2 ( 1763) KKRAHILYEMLAGCVQRKDYTALTKFLPPKHEYVLAVRMTSIQCKLYQYYLDHLTGVGNN
//
0 ( 1861) SEGGRGKAGAKLFQDFQMLSRIWTHPWCLQLDYISKENKGYFDEDSMDEFIASDSDETSM
1 ( 1861) SEGGRGKAGAKLFQDFQMLSRIWTHPWCLQLDYISKENKGYFDEDSMDEFIASDSDETSM
2 ( 1823) SEGGRGKAGAKLFQDFQMLSRIWTHPWCLQLDYISKENKGYFDEDSMDEFIASDSDETSM
//
0 ( 1921) SLSSDDYTKKKKKGKKGKKDSSSSGSGSDNDVEVIKVWNSRSRGGGEGNVDETGNNPSVS
1 ( 1921) SLSSDDYTKKKKKGKKGKKDSSSSGSGSDNDVEVIKVWNSRSRGGGEGNVDETGNNPSVS
2 ( 1883) SLSSDDYTKKKKKGKKGKKDSSSSGSGSDNDVEVIKVWNSRSRGGGEGNVDETGNNPSVS
//
0 ( 1981) LKLEESKATSSSNPSSPAPDWYKDFVTDADAEVLEHSGKMVLLFEILRMAEEIGDKVLVF
1 ( 1981) LKLEESKATSSSNPSSPAPDWYKDFVTDADAEVLEHSGKMVLLFEILRMAEEIGDKVLVF
2 ( 1943) LKLEESKATSSSNPSSPAPDWYKDFVTDADAEVLEHSGKMVLLFEILRMAEEIGDKVLVF
//
0 ( 2041) SQSLISLDLIEDFLELASREKTEDKDKPLIYKGEGKWLRNIDYYRLDGSTTAQSRKKWAE
1 ( 2041) SQSLISLDLIEDFLELASREKTEDKDKPLIYKGEGKWLRNIDYYRLDGSTTAQSRKKWAE
2 ( 2003) SQSLISLDLIEDFLELASREKTEDKDKPLIYKGEGKWLRNIDYYRLDGSTTAQSRKKWAE
//
0 ( 2101) EFNDETNVRGRLFIISTKAGSLGINLVAANRVIIFDASWNPSYDIQSIFRVYRFGQTKPV
1 ( 2101) EFNDETNVRGRLFIISTKAGSLGINLVAANRVIIFDASWNPSYDIQSIFRVYRFGQTKPV
2 ( 2063) EFNDETNVRGRLFIISTKAGSLGINLVAANRVIIFDASWNPSYDIQSIFRVYRFGQTKPV
//
0 ( 2161) YVYRFLAQGTMEDKIYDRQVTKQSLSFRVVDQQQVERHFTMNELTELYTFEPDLLDDPNS
1 ( 2161) YVYRFLAQGTMEDKIYDRQVTKQSLSFRVVDQQQVERHFTMNELTELYTFEPDLLDDPNS
2 ( 2123) YVYRFLAQGTMEDKIYDRQVTKQSLSFRVVDQQQVERHFTMNELTELYTFEPDLLDDPNS
//
0 ( 2221) EKKKKRDTPMLPKDTILAELLQIHKEHIVGYHEHDSLLDHKEEEELTEEERKAAWAEYEA
1 ( 2221) EKKKKRDTPMLPKDTILAELLQIHKEHIVGYHEHDSLLDHKEEEELTEEERKAAWAEYEA
2 ( 2183) EKKKKRDTPMLPKDTILAELLQIHKEHIVGYHEHDSLLDHKEEEELTEEERKAAWAEYEA
//
0 ( 2281) EKKGLTMRFNIPTGTNLPPVSFNSQTPYIPFNLGALSAMSNQQLEDLINQGREKVVEATN
1 ( 2281) EKKGLTMRFNIPTGTNLPPVSFNSQTPYIPFNLGALSAMSNQQLEDLINQGREKVVEATN
2 ( 2243) EKKGLTMRFNIPTGTNLPPVSFNSQTPYIPFNLGALSAMSNQQLEDLINQGREKVVEATN
//
0 ( 2341) SVTAVRIQPLEDIISAVWKENMNLSEAQVQALALSRQASQELDVKRREAIYNDVLTKQQM
1 ( 2341) SVTAVRIQPLEDIISAVWKENMNLSEAQVQALALSRQASQELDVKRREAIYNDVLTKQQM
2 ( 2303) SVTAVRIQPLEDIISAVWKENMNLSEAQVQALALSRQASQELDVKRREAIYNDVLTKQQM
//
0 ( 2401) LISCVQRILMNRRLQQQYNQQQQQQMTYQQATLGHLMMPKPPNLIMNPSNYQQIDMRGMY
1 ( 2401) LISCVQRILMNRRLQQQYNQQQQQQMTYQQATLGHLMMPKPPNLIMNPSNYQQIDMRGMY
2 ( 2363) LISCVQRILMNRRLQQQYNQQQQQQMTYQQATLGHLMMPKPPNLIMNPSNYQQIDMRGMY
//
0 ( 2461) QPVAGGMQPPPLQRAPPPMRSKNPGPSQGKSM
1 ( 2461) QPVAGGMQPPPLQRAPPPMRSKNPGPSQGKSM
2 ( 2423) QPVAGGMQPPPLQRAPPPMRSKNPGPSQGKSM
//