Multiple alignment for pF1KE1305
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE1305, 1360 aa
#  1    CCDS1836.1 MSH6 gene_id:2956|Hs108|chr2    (1360 aa)
#  2    CCDS62906.1 MSH6 gene_id:2956|Hs108|chr2    (1230 aa)
#  3    CCDS62907.1 MSH6 gene_id:2956|Hs108|chr2    (1058 aa)
#  4    CCDS34195.1 MSH3 gene_id:4437|Hs108|chr5    (1137 aa)
#  5    CCDS58709.1 MSH2 gene_id:4436|Hs108|chr2    (868 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
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   5    8e-20        833   27.8        63     787

//
                                                                             
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   2  (    1)    MSRQSTLYSFFPKSPALSDANKASARASREGGRAAAAPGASPSPGGDAAWSEAGPGPRPL
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   1  (   61)    ARSASPPKAKNLNGGLRRSVAPAAPTSCDFSPGDLVWAKMEGYPWWPCLVYNHPFDGTFI
   2  (   61)    ARSASPPKAKNLNGGLRRSV----------------------------------------
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   2  (    -)    ------------------------------------------------------------
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   1  (  181)    EALNKDKIKRLELAVCDEPSEPEEEEEMEVGTTYVTDKSEEDNEIESEEEVQPKTQGSRR
   2  (   81)    ------------------------------GTTYVTDKSEEDNEIESEEEVQPKTQGSRR
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   1  (  241)    SSRQIKKRRVISDSESDIGGSDVEFKPDTKEEGSSDEISSGVGDSESEGLNSPVKVARKR
   2  (  111)    SSRQIKKRRVISDSESDIGGSDVEFKPDTKEEGSSDEISSGVGDSESEGLNSPVKVARKR
   3  (    -)    ............................................................
   4  (   85)    .......RRKKRPLEND-GPVKKKVKKVQQKEGGSDLGMSG--NSE------PKKCLRTR
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   1  (  301)    KRMVTGNGSLKRKSSRKETPSATKQATSISSETKNTLRAFSAPQNSESQAHVSGGGDDSS
   2  (  171)    KRMVTGNGSLKRKSSRKETPSATKQATSISSETKNTLRAFSAPQNSESQAHVSGGGDDSS
   3  (    1)    ..MVTGNGSLKRKSSRKETPSATKQATSISSETKNTLRAFSAPQNSESQAHVSGGGDDSS
   4  (  129)    N-VSKSLEKLKEFCCDSALPQSRVQTESLQERFAVLPKCTDFDDISLLHAKNAVSSEDSK
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  361)    RPTVWYHETLEWLKEEKRRDEHRRRPDHPDFDASTLYVPEDFLNSC-TPGMRKWWQIKSQ
   1  (  361)    RPTVWYHETLEWLKEEKRRDEHRRRPDHPDFDASTLYVPEDFLNSC-TPGMRKWWQIKSQ
   2  (  231)    RPTVWYHETLEWLKEEKRRDEHRRRPDHPDFDASTLYVPEDFLNSC-TPGMRKWWQIKSQ
   3  (   59)    RPTVWYHETLEWLKEEKRRDEHRRRPDHPDFDASTLYVPEDFLNSC-TPGMRKWWQIKSQ
   4  (  188)    RQINQKDTTLFDLSQFGSSNT-----SHENLQKTASKSANKRSKSIYTPLELQYIEMKQQ
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  420)    NFDLVICYKVGKFYELYHMDALIGVSELGLV-FMKGNWAHSGFPEIAFGRYSDSLVQKGY
   1  (  420)    NFDLVICYKVGKFYELYHMDALIGVSELGLV-FMKGNWAHSGFPEIAFGRYSDSLVQKGY
   2  (  290)    NFDLVICYKVGKFYELYHMDALIGVSELGLV-FMKGNWAHSGFPEIAFGRYSDSLVQKGY
   3  (  118)    NFDLVICYKVGKFYELYHMDALIGVSELGLV-FMKGNWAHSGFPEIAFGRYSDSLVQKGY
   4  (  243)    HKDAVLCVECGYKYRFFGEDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAKGY
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  479)    KVARVEQTETPEMM---EARC----RKMAHISKYDRVVRREICRIITKGTQTYSVLEGDP
   1  (  479)    KVARVEQTETPEMM---EARC----RKMAHISKYDRVVRREICRIITKGTQTYSVLEGDP
   2  (  349)    KVARVEQTETPEMM---EARC----RKMAHISKYDRVVRREICRIITKGTQTYSVLEGDP
   3  (  177)    KVARVEQTETPEMM---EARC----RKMAHISKYDRVVRREICRIITKGTQTYSVLEGDP
   4  (  303)    KVGVVKQTETAALKAIGDNRSSLFSRKLTALYTKSTLIGEDVNPLI-KLDDAVNVDEI-M
   5  (   63)    .................................................SQFEDILFGNN

//
                                                                             
   0  (  532)    SENYSKYLLSLKEKEEDSSGHTRA---YGVCFVDTSLGKFFIGQFSDDRHCSRFRTLVAH
   1  (  532)    SENYSKYLLSLKEKEEDSSGHTRA---YGVCFVDTSLGKFFIGQFSDDRHCSRFRTLVAH
   2  (  402)    SENYSKYLLSLKEKEEDSSGHTRA---YGVCFVDTSLGKFFIGQFSDDRHCSRFRTLVAH
   3  (  230)    SENYSKYLLSLKEKEEDSSGHTRA---YGVCFVDTSLGKFFIGQFSDDRHCSRFRTLVAH
   4  (  361)    TDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETRMSS
   5  (   74)    DMSASIGVVGVKMSAVDGQ---RQ---VGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEALLIQ

//
                                                                             
   0  (  589)    YPPVQVLFEKGNLSKETKTILKSSLSCSLQEGLIP----GSQFWDASKTLRTLLEEEYFR
   1  (  589)    YPPVQVLFEKGNLSKETKTILKSSLSCSLQEGLIP----GSQFWDASKTLRTLLEEEYFR
   2  (  459)    YPPVQVLFEKGNLSKETKTILKSSLSCSLQEGLIP----GSQFWDASKTLRTLLEEEYFR
   3  (  287)    YPPVQVLFEKGNLSKETKTILKSSLSCSLQEGLIP----GSQFWDASKTLRTLLEEEYFR
   4  (  421)    LQPVELLLPSA-LSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTE---FY
   5  (  128)    IGPKECVLPGGETAGDM-----GKLRQIIQRGGIL----ITERKKADFSTKDIYQD----

//
                                                                             
   0  (  645)    EKLSDGIGVMLPQVLKGMTSESDSIGLTPGEKSELALSALGGCVFYLKKCLIDQELLSM-
   1  (  645)    EKLSDGIGVMLPQVLKGMTSESDSIGLTPGEKSELALSALGGCVFYLKKCLIDQELLSM-
   2  (  515)    EKLSDGIGVMLPQVLKGMTSESDSIGLTPGEKSELALSALGGCVFYLKKCLIDQELLSM-
   3  (  343)    EKLSDGIGVMLPQVLKGMTSESDSIGLTPGEKSELALSALGGCVFYLKKCLIDQELLSM-
   4  (  477)    AK--DTVDIKGSQIISGI------VNL---EKP--VICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKP-
   5  (  175)    ----------LNRLLKGKKGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFL-------ELLSDD

//
                                                                             
   0  (  704)    ANFEEYIPLDSDTVSTTRSGAIFTKAYQRMVLDAVTLNNLEIFLNGTNGSTEGT--LLER
   1  (  704)    ANFEEYIPLDSDTVSTTRSGAIFTKAYQRMVLDAVTLNNLEIFLNGTNGSTEGT--LLER
   2  (  574)    ANFEEYIPLDSDTVSTTRSGAIFTKAYQRMVLDAVTLNNLEIFLNGTNGSTEGT--LLER
   3  (  402)    ANFEEYIPLDSDTVSTTRSGAIFTKAYQRMVLDAVTLNNLEIFLNGTNGSTEGT--LLER
   4  (  523)    ENFKQ-----------------LSSKMEFMTINGTTLRNLEILQNQTDMKTKGS--LLWV
   5  (  218)    SNFGQFELTTFD----------FS---QYMKLDIAAVRALNLF-QGSVEDTTGSQSLAAL

//
                                                                             
   0  (  762)    VDTCHTPFGKRLLKQWLCAPLCNHYAINDRLDAIEDLMVVPDKI-SEVVE--LLKKLPDL
   1  (  762)    VDTCHTPFGKRLLKQWLCAPLCNHYAINDRLDAIEDLMVVPDKI-SEVVE--LLKKLPDL
   2  (  632)    VDTCHTPFGKRLLKQWLCAPLCNHYAINDRLDAIEDLMVVPDKI-SEVVE--LLKKLPDL
   3  (  460)    VDTCHTPFGKRLLKQWLCAPLCNHYAINDRLDAIEDLMVVPDKI-SEVVE--LLKKLPDL
   4  (  564)    LDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREINARLDAVSEVLHSESSVFGQIEN--HLRKLPDI
   5  (  264)    LNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAF-VEDAEL-RQTLQEDLLRRFPDL

//
                                                                             
   0  (  819)    ERLLSKIHNVGSPLKS--------QNHPDS-RAIMYEETTYSKKKIIDFLSALEGFKV-M
   1  (  819)    ERLLSKIHNVGSPLKS--------QNHPDS-RAIMYEETTYSKKKIIDFLSALEGFKV-M
   2  (  689)    ERLLSKIHNVGSPLKS--------QNHPDS-RAIMYEETTYSKKKIIDFLSALEGFKV-M
   3  (  517)    ERLLSKIHNVGSPLKS--------QNHPDS-RAIMYEETTYSKKKIIDFLSALEGFKV-M
   4  (  622)    ERGLCSIYH--KKCST--------QEF------FLIVKTLYHLKS--EFQA---------
   5  (  322)    NRLAKKFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPNVIQALEKHEGKHQKLLLAVFVTPLTDLRSDF

//
                                                                             
   0  (  869)    CKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEGRFPDLTVELNRWDTAFDHEKARKTGLIT
   1  (  869)    CKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEGRFPDLTVELNRWDTAFDHEKARKTGLIT
   2  (  739)    CKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEGRFPDLTVELNRWDTAFDHEKARKTGLIT
   3  (  567)    CKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEGRFPDLTVELNRWDTAFDHEKARKTGLIT
   4  (  655)    -----IIPAVNSHIQSDLLRTVI-LE-------IPELLSPVEHYLKILN-EQAAKVGDKT
   5  (  382)    SKFQEMIETTLD------MDQVENHEFLVKPSFDPNLS-ELR--EIMNDLEKKMQSTLIS

//
                                                                             
   0  (  929)    PKAGFDSDYDQALADIRENE-QSLLE----YLEKQRNRIGCRTIVYWGIGRNRYQLEIPE
   1  (  929)    PKAGFDSDYDQALADIRENE-QSLLE----YLEKQRNRIGCRTIVYWGIGRNRYQLEIPE
   2  (  799)    PKAGFDSDYDQALADIRENE-QSLLE----YLEKQRNRIGCRTIVYWGIGRNRYQLEIPE
   3  (  627)    PKAGFDSDYDQALADIRENE-QSLLE----YLEKQRNRIGCRTIVYWGIGRNRYQLEIPE
   4  (  701)    EL--FKDLSDFPLIKKRKDEIQGVIDEIRMHLQEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMIEI-K
   5  (  433)    --AARDLGLDPG-KQIKLDS-SAQFG----YYF----RVTCKE---EKVLRNN------K

//
                                                                             
   0  (  984)    NFTTRNLPEEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKLANLINAEERRDVSLKDCMRR---LFYNF
   1  (  984)    NFTTRNLPEEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKLANLINAEERRDVSLKDCMRR---LFYNF
   2  (  854)    NFTTRNLPEEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKLANLINAEERRDVSLKDCMRR---LFYNF
   3  (  682)    NFTTRNLPEEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKLANLINAEERRDVSLKDCMRR---LFYNF
   4  (  758)    NSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFI---VENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKF
   5  (  472)    NFSTVDIQ-----KNGVKFTNSKLTSLNEEYTKNKTEYEEAQDAIVKEIV--------NI

//
                                                                             
   0  ( 1041)    DKNY-KDWQSAVECIAVLDVLLCLANYSRGGDGPMCRPVILLPEDTPPFLELKGSRHPCI
   1  ( 1041)    DKNY-KDWQSAVECIAVLDVLLCLANYSRGGDGPMCRPVILLPEDTPPFLELKGSRHPCI
   2  (  911)    DKNY-KDWQSAVECIAVLDVLLCLANYSRGGDGPMCRPVILLPEDTPPFLELKGSRHPCI
   3  (  739)    DKNY-KDWQSAVECIAVLDVLLCLANYSRGGDGPMCRPVILLPEDTPPFLELKGSRHPCI
   4  (  815)    SEHY-HSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTV--QEERK--IVIKNGRHPVI
   5  (  519)    SSGYVEPMQTLNDVLAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAIL--EKGQGRIILKASRHACV

//
                                                                             
   0  ( 1100)    TKTFFG--DD--FIPNDILIGCEEEEQENGKAYCVLVTGPNMGGKSTLMRQAGLLAVMAQ
   1  ( 1100)    TKTFFG--DD--FIPNDILIGCEEEEQENGKAYCVLVTGPNMGGKSTLMRQAGLLAVMAQ
   2  (  970)    TKTFFG--DD--FIPNDILIGCEEEEQENGKAYCVLVTGPNMGGKSTLMRQAGLLAVMAQ
   3  (  798)    TKTFFG--DD--FIPNDILIGCEEEEQENGKAYCVLVTGPNMGGKSTLMRQAGLLAVMAQ
   4  (  868)    D-VLLGEQDQ--YVPNNTDLS-EDSER------VMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQ
   5  (  577)    E---VQ--DEIAFIPNDVYF-------EKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQ

//
                                                                             
   0  ( 1156)    MGCYVPAEVCRLTPIDRVFTRLGASDRIMSGESTFFVELSETASILMHATAHSLVLVDEL
   1  ( 1156)    MGCYVPAEVCRLTPIDRVFTRLGASDRIMSGESTFFVELSETASILMHATAHSLVLVDEL
   2  ( 1026)    MGCYVPAEVCRLTPIDRVFTRLGASDRIMSGESTFFVELSETASILMHATAHSLVLVDEL
   3  (  854)    MGCYVPAEVCRLTPIDRVFTRLGASDRIMSGESTFFVELSETASILMHATAHSLVLVDEL
   4  (  918)    IGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGQSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDEL
   5  (  625)    IGCFVPCESAEVSIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDEL

//
                                                                             
   0  ( 1216)    GRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYHSLVE---DYSQNVAVRLGHMACMV-
   1  ( 1216)    GRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYHSLVE---DYSQNVAVRLGHMACMV-
   2  ( 1086)    GRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYHSLVE---DYSQNVAVRLGHMACMV-
   3  (  914)    GRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYHSLVE---DYSQNVAVRLGHMACMV-
   4  (  978)    GRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNY--HMGFLVS
   5  (  685)    GRGTSTYDGFGLAWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTA---LANQIPTVNNLHVTALT-

//
                                                                             
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