Multiple alignment for pF1KB8899
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB8899, 233 aa
#  1    CCDS5407.1 HOXA6 gene_id:3203|Hs108|chr7    (233 aa)
#  2    CCDS11531.1 HOXB6 gene_id:3216|Hs108|chr17    (224 aa)
#  3    CCDS41792.1 HOXC6 gene_id:3223|Hs108|chr12    (153 aa)
#  4    CCDS8871.1 HOXC6 gene_id:3223|Hs108|chr12    (235 aa)
#  5    CCDS5406.1 HOXA5 gene_id:3202|Hs108|chr7    (270 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    1.5e-82     1616  100.0         1     233
   2    1.4e-26      815   57.2         1     224
   3    1.5e-22      513   67.2        21     133
   4    2.1e-22      696   49.8         1     215
   5    1.4e-19      462   45.3        71     256

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   0  (    1)    MSSYFVNPTFPGSLPSGQDSFLGQLPLYQAGY-DALRPFPASYGASSLP-DKTYTSPCFY
   1  (    1)    MSSYFVNPTFPGSLPSGQDSFLGQLPLYQAGY-DALRPFPASYGASSLP-DKTYTSPCFY
   2  (    1)    MSSYFVNSTFPVTLASGQESFLGQLPLYSSGYADPLRHYPAPYGPGPGQ-DKGFATSSYY
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    1)    MNSYFTNPSLSCHLAGGQD-VLPNVALNSTAY-DPVRHF-STYGAAVAQ-NRIYSTPFYS
   5  (   71)    ....................................RSYAAS--ASAAPAEPRYSQPATS

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   0  (   59)    QQSNSV--LACNRASY-EYG-ASCFYSDKDL----SGASP-SGS---GKQRGPGDYLHFS
   1  (   59)    QQSNSV--LACNRASY-EYG-ASCFYSDKDL----SGASP-SGS---GKQRGPGDYLHFS
   2  (   60)    PPAGG----GYGRAAPCDYGPAPAFYREKE-----SACAL-SGA---DEQ--PP----FH
   3  (    -)    ............................................................
   4  (   57)    PQENVV--FSSSRGPY-DYG-SNSFYQEKDM----LS------N---CRQNTLGHNTQTS
   5  (   93)    THSPQPDPLPCSAVAP-SPG-SDSHHGGKNSLSNSSGASADAGSTHISSREGVGTA---S

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   0  (  107)    PEQQYKPDSSSGQGKALHDEGADRKYTSPVYPWMQRMNSCAGAVYGSHGRRGRQTYTRYQ
   1  (  107)    PEQQYKPDSSSGQGKALHDEGADRKYTSPVYPWMQRMNSCAGAVYGSHGRRGRQTYTRYQ
   2  (  101)    PEPR-KSDCA--QDKSVFGETEEQKCSTPVYPWMQRMNSCNSSSFGPSGRRGRQTYTRYQ
   3  (   21)    .......DFSSEQGRT---APQDQKASIQIYPWMQRMNSHSGVGYGADRRRGRQIYSRYQ
   4  (  100)    IAQ----DFSSEQGRTAPQ---DQKASIQIYPWMQRMNSHSGVGYGADRRRGRQIYSRYQ
   5  (  148)    GAEEDAP-ASSEQASAQSEPSPAPPAQPQIYPWMRKLHISHDNIGGPEGKRARTAYTRYQ

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   0  (  167)    TLELEKEFHFNRYLTRRRRIEIANALCLTERQIKIWFQNRRMKWKKENKLINSTQPSGED
   1  (  167)    TLELEKEFHFNRYLTRRRRIEIANALCLTERQIKIWFQNRRMKWKKENKLINSTQPSGED
   2  (  158)    TLELEKEFHYNRYLTRRRRIEIAHALCLTERQIKIWFQNRRMKWKKESKLLSASQLSAEE
   3  (   71)    TLELEKEFHFNRYLTRRRRIEIANALCLTERQIKIWFQNRRMKWKKESNLTSTLSGGGGG
   4  (  153)    TLELEKEFHFNRYLTRRRRIEIANALCLTERQIKIWFQNRRMKWKKESNLTSTLSGGGGG
   5  (  207)    TLELEKEFHFNRYLTRRRRIEIAHALCLSERQIKIWFQNRRMKWKKDNKL..........

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   0  (  227)    SEAKAGE
   1  (  227)    SEAKAGE
   2  (  218)    EEEKQAE
   3  (  131)    ATA....
   4  (  213)    ATA....
   5  (    -)    .......

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