# 0 Query: pF1KB6010, 1231 aa
# 1 CCDS14607.1 STAG2 gene_id:10735|Hs108|chrX (1231 aa)
# 2 CCDS43990.1 STAG2 gene_id:10735|Hs108|chrX (1268 aa)
# 3 CCDS3090.1 STAG1 gene_id:10274|Hs108|chr3 (1258 aa)
# 4 CCDS75642.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7 (1226 aa)
# 5 CCDS34703.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7 (1225 aa)
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exp sw-scr id% from to
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3 0 5782 70.1 1 1258
4 7e-209 3757 51.0 49 1223
5 8e-209 3764 51.0 49 1222
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2 ( 1) MIAAPEIPTDFNLLQESETHFSSDTDFEDIEGKNQ-KQGK-GK---TCKKGKKGPAEKGK
3 ( 1) MITS-ELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSR
4 ( 49) .......................DTDFEDSLNRNV-KKRA-AK-----RPPKTTPVAK--
5 ( 49) .......................DTDFEDSLNRNV-KKRA-AK-----RPPKTTPVAK--
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1 ( 56) GGNGGGKPPSGPNRMNGH-HQQNGV-ENMMLFEVVKMGKSAMQSVVDDWIESYKHDRDIA
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4 ( 77) ------HPKKGSRVVHRHSRKQSEP-PANDLFNAVKAAKSDMQSLVDEWLDSYKQDQDAG
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3 ( 177) NFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNV
4 ( 190) SFCEFVRTLVCQCQYSLLYDGFPMDDLISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTSLVKV
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3 ( 237) ALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIF
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0 ( 294) VHRYRDAIAEIRAICIEEIGIWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTMHDKQGEVRLKCLTALQG
1 ( 294) VHRYRDAIAEIRAICIEEIGIWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTMHDKQGEVRLKCLTALQG
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3 ( 297) VHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQS
4 ( 310) VHRYRDVLPEIRAICIEEIGCWMQSYSTSFLTDSYLKYIGWTLHDKHREVRLKCVKALKG
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0 ( 354) LYYNKELNSKLELFTSRFKDRIVSMTLDKEYDVAVQAIKLLTLVLQSSEEVLTAEDCENV
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2 ( 354) LYYNKELNSKLELFTSRFKDRIVSMTLDKEYDVAVQAIKLLTLVLQSSEEVLTAEDCENV
3 ( 357) LYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENV
4 ( 370) LYGNRDLTTRLELFTSRFKDRMVSMVMDREYDVAVEAVRLLILILKNMEGVLTDADCESV
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0 ( 414) YHLVYSAHRPVAVAAGEFLYKKLFSRRDPE-EDGMMK-RRGRQGPNAN--LVKTLVFFFL
1 ( 414) YHLVYSAHRPVAVAAGEFLYKKLFSRRDPE-EDGMMK-RRGRQGPNAN--LVKTLVFFFL
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3 ( 417) YHLVYSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAK-RRGRNSPNGN--LIRMLVLFFL
4 ( 430) YPVVYASHRGLASAAGEFLYWKLFY---PECEIRMMGGREQRQSPGAQRTFFQLLLSFFV
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0 ( 470) ESELHEHAAYLVDSMWDCATELLKDWECMNSLLLEEPLSGEEALTDRQESALIEIMLCTI
1 ( 470) ESELHEHAAYLVDSMWDCATELLKDWECMNSLLLEEPLSGEEALTDRQESALIEIMLCTI
2 ( 470) ESELHEHAAYLVDSMWDCATELLKDWECMNSLLLEEPLSGEEALTDRQESALIEIMLCTI
3 ( 474) ESELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTI
4 ( 487) ESELHDHAAYLVDSLWDCAGARLKDWEGLTSLLLEK----DQNLGDVQESTLIEILVSSA
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2 ( 530) RQAAECHPPVGRGTGKRVLTAKEKKTQLDDRTKITELFAVALPQLLAKYSVDAEKVTNLL
3 ( 534) RQAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLL
4 ( 543) RQASEGHPPVGRVTGRKGLTSKERKTQADDRVKLTEHLIPLLPQLLAKFSADAEKVTPLL
5 ( 543) RQASEGHPPVGRVTGRKGLTSKERKTQADDRVKLTEHLIPLLPQLLAKFSADAEKVTPLL
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0 ( 590) QLPQYFDLEIYTTGRLEKHLDALLRQIRNIVEKHTDTDVLEACSKTYHALCNEEFTIFNR
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3 ( 594) QIPQYFDLEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNR
4 ( 603) QLLSCFDLHIYCTGRLEKHLELFLQQLQEVVVKHAEPAVLEAGAHALYLLCNPEFTFFSR
5 ( 603) QLLSCFDLHIYCTGRLEKHLELFLQQLQEVVVKHAEPAVLEAGAHALYLLCNPEFTFFSR
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0 ( 650) VDISRSQLIDELADKFNRLLEDFLQEGEEPDEDDAYQVLSTLKRITAFHNAHDLSKWDLF
1 ( 650) VDISRSQLIDELADKFNRLLEDFLQEGEEPDEDDAYQVLSTLKRITAFHNAHDLSKWDLF
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3 ( 654) VDIARSQLIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLF
4 ( 663) ADFARSQLVDLLTDRFQQELEELLQSSFL-DEDEVYNLAATLKRLSAFYNTHDLTRWELY
5 ( 663) ADFARSQLVDLLTDRFQQELEELLQSSFL-DEDEVYNLAATLKRLSAFYNTHDLTRWELY
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2 ( 710) ACNYKLLKTGIENGDMPEQIVIHALQCTHYVILWQLAKITESSSTKEDLLRLKKQMRVFC
3 ( 714) GNCYRLLKTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFL
4 ( 722) EPCCQLLQKAVDTGEVPHQVILPALTLVYFSILWTLTHISKSDASQKQLSSLRDRMVAFC
5 ( 722) EPCCQLLQKAVDTGEVPHQVILPALTLVYFSILWTLTHISKSDASQKQLSSLRDRMVAFC
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0 ( 770) QICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFI
1 ( 770) QICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFI
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3 ( 774) AVCQQCLSNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFV
4 ( 782) ELCQSCLSDVDTEIQEQAFVLLSDLLLIFSPQMIVGGRDFLRPLVFFPEATLQSELASFL
5 ( 782) ELCQSCLSDVDTEIQEQAFVLLSDLLLIFSPQMIVGGRDFLRPLVFFPEATLQSELASFL
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0 ( 830) LDHVFIEQDDDNNSADGQQEDEASKIEALHKRRNLLAAFCKLIVYTVVEMNTAADIFKQY
1 ( 830) LDHVFIEQDDDNNSADGQQEDEASKIEALHKRRNLLAAFCKLIVYTVVEMNTAADIFKQY
2 ( 830) LDHVFIEQDDDNNSADGQQEDEASKIEALHKRRNLLAAFCKLIVYTVVEMNTAADIFKQY
3 ( 834) MDHVFIDQDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHY
4 ( 842) MDHVFI-QPGDLGSGDSQ-EDHL-QIERLHQRRRLLAGFCKLLLYGVLEMDAASDVFKHY
5 ( 842) MDHVFI-QPGDLGSGDSQ-EDHL-QIERLHQRRRLLAGFCKLLLYGVLEMDAASDVFKHY
//
0 ( 890) MKYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSSTFSGIK
1 ( 890) MKYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSSTFSGIK
2 ( 890) MKYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSSTFSGIK
3 ( 894) MKYYNDYGDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIK
4 ( 899) NKFYNDYGDIIKETLTRARQIDRSHCSRILLLSLKQLYTELLQEHGPQGLNELPAFIEMR
5 ( 899) NKFYNDYGDIIKETLTRARQIDRSHCSRILLLSLKQLYTELLQEHGPQGLNELPAFIEMR
//
0 ( 950) ELARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSK
1 ( 950) ELARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSK
2 ( 950) ELARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSK
3 ( 954) ELARRFALTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSK
4 ( 959) DLARRFALSFGPQQLQNRDLVVMLHKEGIQFSLSELPPAGSSNQPPNLAFLELLSEFSPR
5 ( 959) DLARRFALSFGPQQLQNRDLVVMLHKEGIQFSLSELPPAGSSNQPPNLAFLELLSEFSPR
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0 ( 1010) LLRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISS-RGS
1 ( 1010) LLRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISS-RGS
2 ( 1010) LLRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISS-RGS
3 ( 1014) LLRQDKKTVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTS
4 ( 1019) LFHQDKQLLLSYLEKCLQ-HVSQAPGHPWGPVTTYCHSL------------SPVEN-TAE
5 ( 1019) LFHQDKQLLLSYLEKCLQ-HVSQAPGHPWGPVTTYCHSL------------SPVEN-TAE
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0 ( 1069) TVRSKKSKPSTGKRKVVEGMQLSLTEESSSSDSMWLSREQTL-HTPVMMQTPQLTSTIM-
1 ( 1069) TVRSKKSKPSTGKRKVVEGMQLSLTEESSSSDSMWLSREQTL-HTPVMMQTPQLTSTIM-
2 ( 1069) TVRSKKSKPSTGKRKVVEGMQLSLTEESSSSDSMWLSREQTL-HTPVMMQTPQLTSTIM-
3 ( 1074) SVRNKKGRPPLHKKRV----------EDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVL-
4 ( 1065) T--SPQVLPSS-KRRRVEGPAKPNREDVSSS------QEESL-QLNSIPPTPTLTSTAVK
5 ( 1065) T--SPQVLPSS-KRRRVEGPAKPNREDVSSS------QEESL-QLNSIPPTPTLTSTAVK
//
0 ( 1127) -REP----KR------LRPED------S-------------------FMSVYP-------
1 ( 1127) -REP----KR------LRPED------S-------------------FMSVYP-------
2 ( 1127) -REP----KR------LRPED------S-------------------FMSVYP-------
3 ( 1123) -REN----SRPMGDQIQEPESEHGSEPD-------------------FLHNPQ-------
4 ( 1115) SRQPLWGLKE------MEEED------GSELDFAQGSQPVAGTERSRFLGPQY-------
5 ( 1115) SRQPLWGLKE------MEEED------GSELD---------------FAQGQPVAGTERS
//
0 ( 1144) --MQTEHHQT-P-L--DYN-------------------------------------RRGT
1 ( 1144) --MQTEHHQT-P-L--DYN-------------------------------------RRGT
2 ( 1144) --MQTEHHQT-P-L--DYNTQVTWMLAQRQQEEARQQQERAAMSYVKLRTNLQHAIRRGT
3 ( 1152) --MQISWLGQ-P-KLEDLN-------------------------------------RKDR
4 ( 1156) --FQTPHNPSGPGL--GNQ-------------------------------------LMRL
5 ( 1148) RFLGPQYFQT-P-H--NPS-------------------------------------GPGL
//
0 ( 1161) -------S-----------------LMEDDEEPIVEDVMMSSEGRIE-DLN---------
1 ( 1161) -------S-----------------LMEDDEEPIVEDVMMSSEGRIE-DLN---------
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3 ( 1171) -------TGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLE-DMN---------
4 ( 1175) -------S-----------------LMEEDEEEELEIQDESNEERQDTDMQASSYSSTSE
5 ( 1167) GNQLMRLS-----------------LMEEDEEEELEIQDESNEERQDTDMQASSYSSTSE
//
0 ( 1187) EGMDF-DTMDIDLPPSKNRRERTELKPDFFDPASIM-DESVLGVSMF
1 ( 1187) EGMDF-DTMDIDLPPSKNRRERTELKPDFFDPASIM-DESVLGVSMF
2 ( 1224) EGMDF-DTMDIDLPPSKNRRERTELKPDFFDPASIM-DESVL.....
3 ( 1214) EEFE--DTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
4 ( 1211) RGLDLLDSTELDI-.................................
5 ( 1210) RGLDLLDSTELDI-.................................
//
