# 0 Query: pF1KB5799, 834 aa
# 1 CCDS4720.1 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6 (834 aa)
# 2 CCDS34410.1 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6 (835 aa)
# 3 CCDS34409.2 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6 (822 aa)
# 4 CCDS34195.1 MSH3 gene_id:4437|Hs108|chr5 (1137 aa)
# 5 CCDS58709.1 MSH2 gene_id:4436|Hs108|chr2 (868 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 5468 100.0 1 834
2 0 5456 99.9 1 835
3 9.8e-204 5148 94.4 1 822
4 5.3e-27 649 27.8 547 1135
5 3.7e-25 581 23.4 95 780
//
0 ( 1) MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
1 ( 1) MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
2 ( 1) MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
3 ( 1) MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 61) LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
1 ( 61) LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
2 ( 61) LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
3 ( 61) LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
4 ( -) ............................................................
5 ( 95) VGVGYVDSIQRKLGLC-EFPDNDQFSNLEALLIQIGPKECVLPGGETAGD---MGKLRQI
//
0 ( 121) EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQ---RLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIP-FDC
1 ( 121) EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQ---RLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIP-FDC
2 ( 121) EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQ---RLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIP-FDC
3 ( 121) EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQ---RLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIP-FDC
4 ( -) ............................................................
5 ( 151) IQRGGI--LITERKKADFSTKDIYQDLNRLLKGKKG---EQMN--------SAVLPEMEN
//
0 ( 177) LLT-----------------VRALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHL
1 ( 177) LLT-----------------VRALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHL
2 ( 177) LLT-----------------VRALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHL
3 ( 177) LLTPPGDLRFTPIPLLIPSQVRALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHL
4 ( -) ............................................................
5 ( 198) QVA-----------------VSSLSAVIKFL-------ELLSDDSNFGQFELTTFDFSQY
//
0 ( 220) VNIDQDTYSVLQIFKSESHPSVYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTH
1 ( 220) VNIDQDTYSVLQIFKSESHPSVYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTH
2 ( 220) VNIDQDTYSVLQIFKSESHPSVYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTH
3 ( 237) VNIDQDTYSVLQIFKSESHPSVYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTH
4 ( 547) .....................ILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLL
5 ( 234) MKLDIAAVRALNLFQGSVEDT-----TGSQ---SLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLM
//
0 ( 280) DLGELSSRLDVIQFFLLPQNLDMAQMLHR-LLGHIKNVPLILKRM-KLSHTKVSDWQ--V
1 ( 280) DLGELSSRLDVIQFFLLPQNLDMAQMLHR-LLGHIKNVPLILKRM-KLSHTKVSDWQ--V
2 ( 280) DLGELSSRLDVIQFFLLPQNLDMAQMLHR-LLGHIKNVPLILKRM-KLSHTKVSDWQ--V
3 ( 297) DLGELSSRLDVIQFFLLPQNLDMAQMLHR-LLGHIKNVPLILKRM-KLSHTKVSDWQ--V
4 ( 586) KLREINARLDAVSEVLHSES----SVFGQ-IENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFL
5 ( 286) DKNRIEERLNLVEAFV--EDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKF-QRQAANLQDCY--R
//
0 ( 336) LYK------TVYSA----LGLRDACRSLPQSIQLFRDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFE
1 ( 336) LYK------TVYSA----LGLRDACRSLPQSIQLFRDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFE
2 ( 336) LYK------TVYSA----LGLRDACRSLPQSIQLFRDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFE
3 ( 353) LYK------TVYSA----LGLRDACRSLPQSIQLFRDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFE
4 ( 641) IVK------TLYHLKSEFQAIIPAVNSHIQS-DLLRTVILEIPELLSPVEHYL-KILNEQ
5 ( 341) LYQGINQLPNVIQA----LEKHEG-KHQKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKFQEMIETTLDMD
//
0 ( 386) GSLAENRFTVLPNID--PEIDEKKRRLMG-----LPSFLTEVARKELENLDSRIPSCSVI
1 ( 386) GSLAENRFTVLPNID--PEIDEKKRRLMG-----LPSFLTEVARKELENLDSRIPSCSVI
2 ( 386) GSLAENRFTVLPNID--PEIDEKKRRLMG-----LPSFLTEVARKELENLDSRIPSCSVI
3 ( 403) GSLAENRFTVLPNID--PEIDEKKRRLMG-----LPSFLTEVARKELENLDSRIPSCSVI
4 ( 693) AAKVGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQG-----V---IDEI-RMHLQEIRKILKNPSAQ
5 ( 396) -QVENHEFLVKPSFD--PNLSEL-REIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSA
//
0 ( 439) YIPLIG--FLLSIPR-----LPS-MVEASDFE-INGLDFMFLSEEKLHYRSARTKELDAL
1 ( 439) YIPLIG--FLLSIPR-----LPS-MVEASDFE-INGLDFMFLSEEKLHYRSARTKELDAL
2 ( 439) YIPLIG--FLLSIPR-----LPS-MVEASDFE-INGLDFMFLSEEKLHYRSARTKELDAL
3 ( 456) YIPLIG--FLLSIPR-----LPS-MVEASDFE-INGLDFMFLSEEKLHYRSARTKELDAL
4 ( 744) YVTVSGQEFMIEIKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLV---
5 ( 452) QF---G--YYFRVTC-----KEE-KVLRNNKN-FSTVD---IQKNGVKFTNSKLTSLNEE
//
0 ( 490) LGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALA--SAARDYGYSRP
1 ( 490) LGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALA--SAARDYGYSRP
2 ( 490) LGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALA--SAARDYGYSRP
3 ( 507) LGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALA--SAARDYGYSRP
4 ( 801) ---LDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKA-----VHHLAT-VDCIFSLA--KVAKQGDYCRP
5 ( 497) YTKNKTEYEEAQDAIVKEIVNISSGYVEPMQTLNDVLAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRP
//
0 ( 548) RYSPQVLG-VRIQNGRHPLMELC---AR-TFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSIYL
1 ( 548) RYSPQVLG-VRIQNGRHPLMELC---AR-TFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSIYL
2 ( 548) RYSPQVLG-VRIQNGRHPLMELC---AR-TFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSIYL
3 ( 565) RYSPQVLG-VRIQNGRHPLMELC---AR-TFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSIYL
4 ( 850) TVQEER-K-IVIKNGRHPVIDVLLGEQD-QYVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYI
5 ( 557) AILEKGQGRIILKASRHACVEVQ---DEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYI
//
0 ( 603) KQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQ-VAKAVNN
1 ( 603) KQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQ-VAKAVNN
2 ( 603) KQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQQVAKAVNN
3 ( 620) KQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQQVAKAVNN
4 ( 907) KQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGQSTFMEELTD-TAEIIRK
5 ( 614) RQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEVSIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLE-TASILRS
//
0 ( 662) ATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLAR-GPTCPHIFVATNFLSLVQLQL---
1 ( 662) ATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLAR-GPTCPHIFVATNFLSLVQLQL---
2 ( 663) ATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLAR-GPTCPHIFVATNFLSLVQLQL---
3 ( 680) ATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLAR-GPTCPHIFVATNFLSLVQLQL---
4 ( 966) ATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFI-R-DVKSLTLFV-THYPPVCELEKNYS
5 ( 673) ATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWAISEYIATKIGAFC--MF-ATHFHELTALA----
//
0 ( 718) -----LPQGPLVQY----LTMETCEDGNDLV-FFYQVCEGVAKASHASHTAAQAGLPDKL
1 ( 718) -----LPQGPLVQY----LTMETCEDGNDLV-FFYQVCEGVAKASHASHTAAQAGLPDKL
2 ( 719) -----LPQGPLVQY----LTMETCEDGNDLV-FFYQVCEGVAKASHASHTAAQAGLPDKL
3 ( 736) -----LPQGPLVQY----LTMETCEDGNDLV-FFYQV-----------------------
4 ( 1023) HQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGAAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEI
5 ( 726) ------NQIPTVNN----LHVTALTTEETLT-MLYQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHV
//
0 ( 768) VARG----KEVSDLIRSGKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMS
1 ( 768) VARG----KEVSDLIRSGKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMS
2 ( 769) VARG----KEVSDLIRSGKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMS
3 ( 763) -----------SDLIRSGKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMS
4 ( 1083) LKKAAHKSKELEGLINTKR--KRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSL.....
5 ( 775) IECA----KQ..................................................
//
0 ( 824) QEVLPAATSIL
1 ( 824) QEVLPAATSIL
2 ( 825) QEVLPAATSIL
3 ( 812) QEVLPAATSIL
4 ( -) ...........
5 ( -) ...........
//