Multiple alignment for pF1KB4393
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB4393, 1390 aa
#  1    CCDS7354.1 POLR3A gene_id:11128|Hs108|chr10    (1390 aa)
#  2    CCDS42706.1 POLR1A gene_id:25885|Hs108|chr2    (1720 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0           9194  100.0         1    1390
   2    1.8e-23     1421   33.6       391    1298

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   0  (    1)    MVKEQFRETDVAKKISHICFGMKSPEEMRQQAHIQVVSKNLYSQDNQHAPLLYGVLDHRM
   1  (    1)    MVKEQFRETDVAKKISHICFGMKSPEEMRQQAHIQVVSKNLYSQDNQHAPLLYGVLDHRM
   2  (    -)    ............................................................

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   0  (   61)    GTSEKDRPCETCGKNLADCLGHYGYIDLELPCFHVGYFRAVIGILQMICKTCCHIMLSQE
   1  (   61)    GTSEKDRPCETCGKNLADCLGHYGYIDLELPCFHVGYFRAVIGILQMICKTCCHIMLSQE
   2  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  121)    EKKQFLDYLKRPGLTYLQKRGLKKKISDKCRKKNICHHCGAFNGTVKKCGLLKIIHEKYK
   1  (  121)    EKKQFLDYLKRPGLTYLQKRGLKKKISDKCRKKNICHHCGAFNGTVKKCGLLKIIHEKYK
   2  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  181)    TNKKVVDPIVSNFLQSFETAIEHNKEVEPLLGRAQENLNPLVVLNLFKRIPAEDVPLLLM
   1  (  181)    TNKKVVDPIVSNFLQSFETAIEHNKEVEPLLGRAQENLNPLVVLNLFKRIPAEDVPLLLM
   2  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  241)    NPEAGKPSDLILTRLLVPPLCIRPSVVSDLKSGTNEDDLTMKLTEIIFLNDVIKKHRISG
   1  (  241)    NPEAGKPSDLILTRLLVPPLCIRPSVVSDLKSGTNEDDLTMKLTEIIFLNDVIKKHRISG
   2  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  301)    AKTQMIMEDWDFLQLQCALYINSELSGIPLNMAPKKWTRGFVQRLKGKQGRFRGNLSGKR
   1  (  301)    AKTQMIMEDWDFLQLQCALYINSELSGIPLNMAPKKWTRGFVQRLKGKQGRFRGNLSGKR
   2  (  391)    .........WIRLQSHVNIVFDSEMDKLMMDKYP-----GIRQILEKKEGLFRKHMMGKR

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   0  (  361)    VDFSGRTVISPDPNLRIDEVAVPVHVAKILTFPEKVNKANINFLRKLVQNGPEVHPGANF
   1  (  361)    VDFSGRTVISPDPNLRIDEVAVPVHVAKILTFPEKVNKANINFLRKLVQNGPEVHPGANF
   2  (  437)    VDYAARSVICPDMYINTNEIGIPMVFATKLTYPQPVTPWNVQELRQAVINGPNVHPGASM

//
                                                                             
   0  (  421)    IQQRHTQMKRF--LKYGNREKMAQEL----------KYGDIVERHLIDGDVVLFNRQPSL
   1  (  421)    IQQRHTQMKRF--LKYGNREKMAQEL----------KYGDIVERHLIDGDVVLFNRQPSL
   2  (  497)    VINEDGSRTALSAVDMTQREAVAKQLLTPATGAPKPQGTKIVCRHVKNGDILLLNRQPTL

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   0  (  469)    HKLSIMAHLARVKPH-RTFRFNECVCTPYNADFDGDEMNLHLPQTEEAKAEALVLMGTKA
   1  (  469)    HKLSIMAHLARVKPH-RTFRFNECVCTPYNADFDGDEMNLHLPQTEEAKAEALVLMGTKA
   2  (  557)    HRPSIQAHRARILPEEKVLRLHYANCKAYNADFDGDEMNAHFPQSELGRAEAYVLACTDQ

//
                                                                             
   0  (  528)    NLVTPRNGEPLIAAIQDFLTGAYLLTLKDTFFDRAKACQIIASILVGKDEKIKVRLPPPT
   1  (  528)    NLVTPRNGEPLIAAIQDFLTGAYLLTLKDTFFDRAKACQIIASILVGKDEKIKVRLPPPT
   2  (  617)    QYLVPKDGQPLAGLIQDHMVSGASMTTRGCFFTREHYMELVYRGLT--DKVGRVKLLSPS

//
                                                                             
   0  (  588)    ILKPVTLWTGKQIFSVILR---PSDDNPVRANLRTK--GKQYC--------GKGED-LCA
   1  (  588)    ILKPVTLWTGKQIFSVILR---PSDDNPVRANLRTK--GKQYC--------GKGED-LCA
   2  (  675)    ILKPFPLWTGKQVVSTLLINIIPEDHIPLNLSGKAKITGKAWVKETPRSVPGFNPDSMC-

//
                                                                             
   0  (  634)    NDSYVTIQNSELMSGSMDKGTLGSGSKNNIFYILLRDWGQNEAADAMSRLARLAPVYLS-
   1  (  634)    NDSYVTIQNSELMSGSMDKGTLGSGSKNNIFYILLRDWGQNEAADAMSRLARLAPVYLS-
   2  (  734)    -ESQVIIREGELLCGVLDKAHYGS-SAYGLVHCCYEIYGGETSGKVLTCLARLFTAYLQL

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   0  (  693)    NRGFSIGIGD--VTPGQGLLKAKY--ELLNAGYKKCDEYI---EALN----TGKLQQQPG
   1  (  693)    NRGFSIGIGD--VTPGQGLLKAKY--ELLNAGYKKCDEYI---EALN----TGKLQQQPG
   2  (  792)    YRGFTLGVEDILVKPKADVKRQRIIEESTHCGPQAVRAALNLPEAASYDEVRGKWQDAHL

//
                                                                             
   0  (  742)    CTAEETLEALILK---ELSVIRDHAGSACL-----RELDKSNSPLTMALCGSKGSFINIS
   1  (  742)    CTAEETLEALILK---ELSVIRDHAGSACL-----RELDKSNSPLTMALCGSKGSFINIS
   2  (  852)    GKDQRDFNMIDLKFKEEVNHYSNEINKACMPFGLHRQFPE-NSLQMMVQSGAKGSTVNTM

//
                                                                             
   0  (  794)    QMIACVGQQAISGSRVPDGFENRSLPHFEKHSKLPAAKGFVANSFYSGLTPTEFFFHTMA
   1  (  794)    QMIACVGQQAISGSRVPDGFENRSLPHFEKHSKLPAAKGFVANSFYSGLTPTEFFFHTMA
   2  (  911)    QISCLLGQIELEGRRPPLMASGKSLPCFEPYEFTPRAGGFVTGRFLTGIKPPEFFFHCMA

//
                                                                             
   0  (  854)    GREGLVDTAVKTAETGYMQRRLVKSLEDLCSQYDLTVRSSTGDIIQFIYGGDGLDPAAME
   1  (  854)    GREGLVDTAVKTAETGYMQRRLVKSLEDLCSQYDLTVRSSTGDIIQFIYGGDGLDPAAME
   2  (  971)    GREGLVDTAVKTSRSGYLQRCIIKHLEGLVVQYDLTVRDSDGSVVQFLYGEDGLDIPKTQ

//
                                                                             
   0  (  914)    GKDEPLEFKRVLDNIKAVFPCP--------SEP--ALSKNELILTTES-----IMKKSEF
   1  (  914)    GKDEPLEFKRVLDNIKAVFPCP--------SEP--ALSKNELILTTES-----IMKKSEF
   2  ( 1031)    FL-QPKQFPFLASNYEVIMKSQHLHEVLSRADPKKALHHFRAIKKWQSKHPNTLLRRGAF

//
                                                                             
   0  (  959)    LCCQDSFLQEIKKFIK-----------GVSEKIK-------KTRDKYGINDNGTTEPRV-
   1  (  959)    LCCQDSFLQEIKKFIK-----------GVSEKIK-------KTRDKYGINDNGTTEPRV-
   2  ( 1090)    LSYSQK-IQEAVKALKLESENRNGRSPGTQEMLRMWYELDEESRRKYQKKAAACPDPSLS

//
                                                                             
   0  ( 1000)    -----LY----------QLDRITP---TQVEKFLETCR---D--------KYMRAQMEPG
   1  ( 1000)    -----LY----------QLDRITP---TQVEKFLETCR---D--------KYMRAQMEPG
   2  ( 1149)    VWRPDIYFASVSETFETKVDDYSQEWAAQTEKSYEKSELSLDRLRTLLQLKWQRSLCEPG

//
                                                                             
   0  ( 1031)    SAVGALCAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITLGVPRIKEIIN-ASKAISTPIITAQ-
   1  ( 1031)    SAVGALCAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITLGVPRIKEIIN-ASKAISTPIITAQ-
   2  ( 1209)    EAVGLLAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGRGEMNVTLGIPRLREILMVASANIKTPMMSVPV

//
                                                                             
   0  ( 1089)    LDKDDDADYARLVKGRIEKTLLGEISEYIEEVFLPDDCFILVKLSLERIRLLRLEVNAET
   1  ( 1089)    LDKDDDADYARLVKGRIEKTLLGEISEYIEEVFLPDDCFILVKLSLERIRLLRLEVNAET
   2  ( 1269)    LNTKKALKRVKSLKKQLTRVCLGEVLQKID..............................

//
                                                                             
   0  ( 1149)    VRYSICTSKLRVKPGDVAVHGEAVVCVTPRENSKSSMYYVLQFLKEDLPKVVVQGIPEVS
   1  ( 1149)    VRYSICTSKLRVKPGDVAVHGEAVVCVTPRENSKSSMYYVLQFLKEDLPKVVVQGIPEVS
   2  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1209)    RAVIHIDEQSGKEKYKLLVEGDNLRAVMATHGVKGTRTTSNNTYEVEKTLGIEAARTTII
   1  ( 1209)    RAVIHIDEQSGKEKYKLLVEGDNLRAVMATHGVKGTRTTSNNTYEVEKTLGIEAARTTII
   2  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1269)    NEIQYTMVNHGMSIDRRHVMLLSDLMTYKGEVLGITRFGLAKMKESVLMLASFEKTADHL
   1  ( 1269)    NEIQYTMVNHGMSIDRRHVMLLSDLMTYKGEVLGITRFGLAKMKESVLMLASFEKTADHL
   2  (    -)    ............................................................

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   0  ( 1329)    FDAAYFGQKDSVCGVSECIIMGIPMNIGTGLFKLLHKADRDPNPPKRPLIFDTNEFHIPL
   1  ( 1329)    FDAAYFGQKDSVCGVSECIIMGIPMNIGTGLFKLLHKADRDPNPPKRPLIFDTNEFHIPL
   2  (    -)    ............................................................

//
                   
   0  ( 1389)    VT
   1  ( 1389)    VT
   2  (    -)    ..

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