Manual PowerGet PowerFT Menu Main
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イオン付加体の種類とその質量値を設定します。データベース検索に使用するマス値(Search mass, 正味のマス値)が、検出されたマス値からどのように算出されるかを定義します。 | イオン付加体の種類とその質量値を設定します。データベース検索に使用するマス値(Search mass, 正味のマス値)が、検出されたマス値からどのように算出されるかを定義します。 | ||
− | 例えば[M + H]+イオンの場合、正味のマス値は検出されたm/ | + | 例えば[M + H]+イオンの場合、正味のマス値は検出されたm/zよりもHが一つ少なく、e(電子)が一つ多いものとして定義します。また右の図では[M + NH4]+の例を示しています。 |
設定を変更した場合は、必ずSaveボタンを押してください。また、この設定を用いてAdduct Ionsの設定を行う場合は、PowerFTを再起動してください。 | 設定を変更した場合は、必ずSaveボタンを押してください。また、この設定を用いてAdduct Ionsの設定を行う場合は、PowerFTを再起動してください。 | ||
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+ | 13Cアイソトープピークの検出やイオン付加体の推定は、溶出時間が近くピーク形状が似ているピーク間での、m/zの差分から判断されます。この設定画面では、そのm/zの差分値と判断条件を設定します。 | ||
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+ | Detection conditions(判断条件)の欄では、ピーク強度やm/zの大小で、親(Base)となるピークと、子(Target)となるピークが一意に決まる条件を設定します。 | ||
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+ | Definition of the ionization modes(イオン化モードの定義)の欄では、BaseとTargetそれぞれで、そのイオン化モード(イオン付加体の種類)を設定します。 | ||
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+ | 設定の変更を行った場合は必ずSaveボタンを押して設定を確定してください。またこの設定を用いて解析を行う際は、必ずPowerFTを再起動してください。 | ||
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== Help == | == Help == |
2013年1月16日 (水) 07:49時点における版
メニューの詳細 - メイン画面
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File
Open Home Directory
解析データがあるトップ階層のフォルダ(ホームディレクトリ)を選択して、新たな解析をスタートしたり、既存の解析データを開きます。
Exit
PowerFTを終了します。
Recently Opened Directory
最近使ったホームディレクトリを選択できます。
Analysis
PowerFTの解析の中心となる機能が、順番に沿って並べてられています。
MS Correction by IS
ポストカラムインジェクションにより導入された内部標準(IS)のピークを用いて、スキャンポイントごとにのm/zの補正を行います。補正の必要がないデータは、この処理をする必要はありません。
ここで作成したデータは、Peak Assignment機能で使用します。
MSMS Preparation
Full MSファイルとMS/MSファイルを用いて、親イオンと娘イオンとの対応関係のデータを作成します。MS/MSファイルが存在しないデータでは実行する必要はありません。
ここで作成したデータは、Peak Assignment機能で使用します。
Full MSファイルとして、必ず内標補正をしていないファイルを使用してください。
Peak Detection
独自のピーク形状評価アルゴリズムを用いてピークを検出します。
Full MSファイルとして、必ず内標補正をしていないファイルを使用してください。
Peak Selection
ピークの形状や強度をもとに、有効ピークを選別します。
Peak Characterization
溶出時間が近くピーク形状が似ているピークを探し、デコンボリューションを行います。その後、13Cアイソトープピークの検出、イオン付加体の推定、多価体ピークやゴーストピークの推定などを行います。
Peak Assignment
全ピークについて、精密質量の算出、13C/12C比の算出、代表MS/MSデータの付加を行います。また、全ピークに対し、組成式演算やデータベース検索を行いながら、ピークのアノテーション作業を行うことができます。
TIPS 繰り返し分析やコントロールとの比較データが存在する場合は、ここで単独の分析データごとにアノテーションをするよりも、PowerMatchでアラインメントをした後にアノテーションすることをお勧めします。ピークの再現性などをみることで、どのピークに注目したら良いかがわかりやすく、作業がしやすいためです。
Setting
13Cアイソトープピークやイオン付加体の種類を判別するための設定を行います。
注意! このSettingメニューで設定した内容は、新規解析データに使用されるデフォルトの設定として、PowerGet起動ファイルと同フォルダにある「config」フォルダ中の「ionizationMode.ini」に保存されます。 PowerFTで解析を開始すると、このデフォルト設定ファイルが、それぞれの解析ホームディレクトリ中にコピーされ、その解析独自の設定として使用されます。すでに解析を始めたデータに対して設定値を変更したい場合は、このSettingメニューからではなく、各解析ステップでの設定画面から変更・保存するようにしてください。
Ionization Modes
イオン付加体の種類とその質量値を設定します。データベース検索に使用するマス値(Search mass, 正味のマス値)が、検出されたマス値からどのように算出されるかを定義します。
例えば[M + H]+イオンの場合、正味のマス値は検出されたm/zよりもHが一つ少なく、e(電子)が一つ多いものとして定義します。また右の図では[M + NH4]+の例を示しています。
設定を変更した場合は、必ずSaveボタンを押してください。また、この設定を用いてAdduct Ionsの設定を行う場合は、PowerFTを再起動してください。
Adduct Ions
13Cアイソトープピークの検出やイオン付加体の推定は、溶出時間が近くピーク形状が似ているピーク間での、m/zの差分から判断されます。この設定画面では、そのm/zの差分値と判断条件を設定します。
Detection conditions(判断条件)の欄では、ピーク強度やm/zの大小で、親(Base)となるピークと、子(Target)となるピークが一意に決まる条件を設定します。
Definition of the ionization modes(イオン化モードの定義)の欄では、BaseとTargetそれぞれで、そのイオン化モード(イオン付加体の種類)を設定します。 As Defaultは、Peak Assignmentの行程で設定するデフォルトのイオン化モードを指します。また、Never Searchは現在意味を持たず、As Defaultと同じ動作となります。
設定の変更を行った場合は必ずSaveボタンを押して設定を確定してください。またこの設定を用いて解析を行う際は、必ずPowerFTを再起動してください。