Manual PowerGet PowerFT MainWorkFlow MSMSPreparation
(→データの確認) |
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− | == MS/MS Preparationツールの起動 == | + | == 対応付けの方法 == |
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+ | === MS/MS Preparationツールの起動 === | ||
メイン画面<span class="km_menu">Analysis</span>から、<span class="km_menu">MS/MS Preparation</span>を選択してください。MS/MS Viewウィンドウがひらきます。 | メイン画面<span class="km_menu">Analysis</span>から、<span class="km_menu">MS/MS Preparation</span>を選択してください。MS/MS Viewウィンドウがひらきます。 | ||
− | == ファイルの選択 == | + | === ファイルの選択 === |
ツールのFileメニューSelect Full MS Fileで、Full MSファイルを選択します。同様に、FileメニューSelect MS2 Fileで、MS/MSデータのファイルを選択します。 | ツールのFileメニューSelect Full MS Fileで、Full MSファイルを選択します。同様に、FileメニューSelect MS2 Fileで、MS/MSデータのファイルを選択します。 | ||
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処理が終わると、ツール画面左のリストに数字が表示されます。また、もとのFull MSファイルあったフォルダに、'''MSMS.txt'''という名前の新たなファイルが作成されています。 | 処理が終わると、ツール画面左のリストに数字が表示されます。また、もとのFull MSファイルあったフォルダに、'''MSMS.txt'''という名前の新たなファイルが作成されています。 | ||
− | == データの確認 == | + | === データの確認 === |
リスト中の表示は、次のことを示しています。 | リスト中の表示は、次のことを示しています。 | ||
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リストの行をクリックすると、右のグラフにデータが表示されます。いくつか行をクリックしてみて、期待通りのデータであるかをご確認ください。 | リストの行をクリックすると、右のグラフにデータが表示されます。いくつか行をクリックしてみて、期待通りのデータであるかをご確認ください。 | ||
− | == 対応付けしたデータ == | + | === 対応付けしたデータ === |
Full MS、MS/MSファイルと同じフォルダに、MSMS.txtというファイルが作成されています。このデータが、解析ステップ4で使用するデータです。 | Full MS、MS/MSファイルと同じフォルダに、MSMS.txtというファイルが作成されています。このデータが、解析ステップ4で使用するデータです。 | ||
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== その他のツール機能 == | == その他のツール機能 == | ||
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+ | === 作成したMSMS.txtデータを開く=== | ||
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+ | 一度作成したMSMS.txtデータを開いて閲覧できます。操作手順としては新規作成と大差ありませんが、MSMS.txtファイルが上書きされないという利点はあります。 | ||
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+ | 操作は少し変則的です。まず、ツールのFileメニューのSelect Full MS Fileから、Full MSデータを選択してください。この後、FileメニューのOpen MS/MS Fileで、MSMS.txtファイルを選択してください。データが読み込まれます。 | ||
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+ | === MS/MSデータを閲覧する === | ||
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PowerFTの入力フォーマットでは、FullMSスキャンに続くMS/MSスキャンは連続番号になるように定義されています。このため、たとえば1回のFull MSスキャンの次に3回のMS/MSスキャンがあるとすると、以下のようなスキャン番号付けになります。 | PowerFTの入力フォーマットでは、FullMSスキャンに続くMS/MSスキャンは連続番号になるように定義されています。このため、たとえば1回のFull MSスキャンの次に3回のMS/MSスキャンがあるとすると、以下のようなスキャン番号付けになります。 | ||
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この数字の意味は、 | この数字の意味は、 | ||
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2013年1月17日 (木) 02:27時点における版
MS/MSデータの対応付け
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PowerFTの入力データフォーマットでは、得られたMS/MSスキャンのデータが、どのFullMSスキャンのどのイオンに由来したものであるかが記載されていません。その対応付けを行います。
対応付けの方法
MS/MS Preparationツールの起動
メイン画面
から、 を選択してください。MS/MS Viewウィンドウがひらきます。ファイルの選択
ツールのFileメニューSelect Full MS Fileで、Full MSファイルを選択します。同様に、FileメニューSelect MS2 Fileで、MS/MSデータのファイルを選択します。
Full MSファイルとMS/MSファイルは、同じフォルダ(ホームディレクトリ)に入れておいてください。
対応付けの実行
ツールのRunメニューからStart Processing Nowを選択すると、対応付けの処理が始まります。
処理が終わると、ツール画面左のリストに数字が表示されます。また、もとのFull MSファイルあったフォルダに、MSMS.txtという名前の新たなファイルが作成されています。
データの確認
リスト中の表示は、次のことを示しています。
Full MSのスキャン番号 - MS/MSのスキャン番号 - 溶出時間(min)
リストの行をクリックすると、右のグラフにデータが表示されます。いくつか行をクリックしてみて、期待通りのデータであるかをご確認ください。
対応付けしたデータ
Full MS、MS/MSファイルと同じフォルダに、MSMS.txtというファイルが作成されています。このデータが、解析ステップ4で使用するデータです。
その他のツール機能
作成したMSMS.txtデータを開く
一度作成したMSMS.txtデータを開いて閲覧できます。操作手順としては新規作成と大差ありませんが、MSMS.txtファイルが上書きされないという利点はあります。
操作は少し変則的です。まず、ツールのFileメニューのSelect Full MS Fileから、Full MSデータを選択してください。この後、FileメニューのOpen MS/MS Fileで、MSMS.txtファイルを選択してください。データが読み込まれます。
MS/MSデータを閲覧する
PowerFTの入力フォーマットでは、FullMSスキャンに続くMS/MSスキャンは連続番号になるように定義されています。このため、たとえば1回のFull MSスキャンの次に3回のMS/MSスキャンがあるとすると、以下のようなスキャン番号付けになります。
1 - 2 1 - 3 1 - 4 5 - 6 5 - 7 ...
多くの場合ここで問題になることはありませんが、データのクロップなどを行っている場合などは、対応がうまくつかない場合があります。「何かおかしいな」と思ったら、リストを見て対応付けが正しく行われているかどうかご確認ください。
リストの行をクリックすると、右のグラフにデータが表示されます。ここでは、Full MSとMS/MSが重ねて表示されています。
この数字の意味は、