Manual MSGet
MSGet マニュアル
|
はじめに
MSGetは、Xcaliburソフトウェア(ThermoFishger社)で出力された.rawファイルから、全MSデータおよびPDAデータをテキスト形式で出力することができるソフトウェアです。XcaliburはThermoFisher社製の質量分析装置の標準制御ソフトです。
使用制限
MSGetは、Xcalibur (ThermoFisher社)がインストールされた質量分析装置の制御用のPC上のみで使用することができます。
動作環境
以下のOS環境で動作を確認しています。
Winodws XP
インストールと起動
プログラム本体は[#tmp|こちらのページ]からダウンロードできます。
ダウンロードしたzip圧縮ファイルを解凍(展開)します。
出来上がった「MSGet_VC.exe」をダブルクリックすると、ソフトウェアが起動します。
アンインストール
解凍してできたファイルを全て削除してください。
本ソフトウェアは、システムレジストリへの書き込みなどは一切行いません。
使い方
メイン画面
起動直後のウィンドウ状態は右図です。
ボタン:
RAWファイル選択ダイアログを表示します。
ボタンまたは右上の ボタン:
MSGetを終了します。
RAWファイルを選択後、ウィンドウは右図の様になります。
「Filters」欄:
分析時に設定されたフィルタが表示されます。出力させたいフィルタを選択します(複数選択可)。
※ControllerTypeでPDAが選択されている場合、Filters欄は無効になります。
「Retention time」欄:
出力する時間範囲の始まり(Start)と終わり(End)を指定します(単位は分)。
「Threshold」欄:
出力する最小シグナル値を指定します。指定数値未満のシグナルは出力されません。
「ControlType」:
出力データのコントローラータイプ(MSかPDA)を指定します。
※プルダウンにはRAWファイルに含まれる全コントローラータイプが表示されますが、MSGetではMSとPDAのみサポートしています。
ボタン:
上記の条件に従って、データを処理し、出力します。
処理の流れ
起動後
ボタンを押して.rawファイルを選択したのち、各種条件を指定して、 ボタンを押します。出力ファイルは、選択した.rawファイルが存在するフォルダに生成されます。出力ファイルについて
出力ファイルは選択した.rawファイルが存在するのと同じフォルダに生成されます。
ファイル名
MSデータの場合
選択したフィルタの数とThresholdの値に応じて、下記の通り自動的に名前が付けられます。
表中の【例】は「SAMPLE01.raw」という名の.rawファイルを処理した場合を示します。
フィルタ | Threshold | ファイル名の付き方 |
---|---|---|
単一選択 | 0 | 元のファイル名(.rawより前の部分)の後ろにフィルタの名前が括弧書きで加わり、拡張子が「.raw」から「.txt」に変わります。フィルタ名に含まれるスペースは、アンダースコア「_」に置き換えられます。 【例】「ITMS + c EST d Full ms2」というフィルタが選択されていた場合、 |
0以外 | 上記のファイル名(拡張子以外の部分)の最後に、「_Th」に加えてThresholdの値が加わります。 【例】「ITMS + c EST d Full ms2」というフィルタ、 |
|
複数選択 | 0 | |
0以外 |
PDAデータの場合
ファイルフォーマット
開発者
MSGetの開発には以下の方々にご協力をいただきました。
- 茂木岳 様
- 田中健一 様 (元 奈良先端大学)
- 尾形善之 様 (現 大阪府立大学准教授)
- 金谷重彦 様 (奈良先端大学教授)