Manual MSGet

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【例】「ITMS + c EST d Full ms2」というフィルタ、<br/>
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Thresholdに「3000」が指定されていた場合、<br/>
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SAMPLE01(ITMS_+_c_EST_d_Full_ms2)_Th3000.txt
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2013年2月20日 (水) 05:37時点における版

MSGet マニュアル

目次

はじめに

MSGetは、Xcaliburソフトウェア(ThermoFishger社)で出力された.rawファイルから、全MSデータおよびPDAデータをテキスト形式で出力することができるソフトウェアです。XcaliburはThermoFisher社製の質量分析装置の標準制御ソフトです。


使用制限

MSGetは、Xcalibur (ThermoFisher社)がインストールされた質量分析装置の制御用のPC上のみで使用することができます。

動作環境

以下のOS環境で動作を確認しています。

Winodws XP

インストールと起動

プログラム本体は[#tmp|こちらのページ]からダウンロードできます。

ダウンロードしたzip圧縮ファイルを解凍(展開)します。

出来上がった「MSGet_VC.exe」をダブルクリックすると、ソフトウェアが起動します。


アンインストール

解凍してできたファイルを全て削除してください。

本ソフトウェアは、システムレジストリへの書き込みなどは一切行いません。

使い方

メイン画面

起動直後のウィンドウ状態は右図です。


MSGet Manual MainWindow1.png

Browseボタン

 RAWファイル選択ダイアログを表示します。

Exitボタンまたは右上の×ボタン

 MSGetを終了します。



RAWファイルを選択後、ウィンドウは右図の様になります。


MSGet Manual MainWindow2.png

「Filters」欄

 分析時に設定されたフィルタが表示されます。出力させたいフィルタを選択します(複数選択可)。
 ※ControllerTypeでPDAが選択されている場合、Filters欄は無効になります。

「Retention time」欄

 出力する時間範囲の始まり(Start)と終わり(End)を指定します(単位は分)。

「Threshold」欄

 出力する最小シグナル値を指定します。指定数値未満のシグナルは出力されません。

「ControlType」

 出力データのコントローラータイプ(MSかPDA)を指定します。
 ※プルダウンにはRAWファイルに含まれる全コントローラータイプが表示されますが、MSGetではMSとPDAのみサポートしています。

Outputボタン

 上記の条件に従って、データを処理し、出力します。


処理の流れ

起動後Browseボタンを押して.rawファイルを選択したのち、各種条件を指定して、Outputボタンを押します。出力ファイルは、選択した.rawファイルが存在するフォルダに生成されます。

出力ファイルについて

出力ファイルは選択した.rawファイルが存在するのと同じフォルダに生成されます。

ファイル名

MSデータの場合

選択したフィルタの数とThresholdの値に応じて、下記の通り自動的に名前が付けられます。

表中の【例】は「SAMPLE01.raw」という名の.rawファイルを処理した場合を示します。


フィルタ Threshold ファイル名の付き方
単一選択 0 元のファイル名(.rawより前の部分)の後ろにフィルタの名前が括弧書きで加わり、拡張子が「.raw」から「.txt」に変わります。フィルタ名に含まれるスペースは、アンダースコア「_」に置き換えられます。

【例】「ITMS + c EST d Full ms2」というフィルタが選択されていた場合、

SAMPLE01(ITMS_+_c_EST_d_Full_ms2).txt
0以外 上記のファイル名(拡張子以外の部分)の最後に、「_Th」に加えてThresholdの値が加わります。

【例】「ITMS + c EST d Full ms2」というフィルタ、
Thresholdに「3000」が指定されていた場合、
SAMPLE01(ITMS_+_c_EST_d_Full_ms2)_Th3000.txt

複数選択 0
0以外

PDAデータの場合

ファイルフォーマット

開発者

MSGetの開発には以下の方々にご協力をいただきました。

  • 茂木岳 様
  • 田中健一 様 (元 奈良先端大学)
  • 尾形善之 様 (現 大阪府立大学准教授)
  • 金谷重彦 様 (奈良先端大学教授)
個人用ツール
名前空間
変種
操作
案内
ツールボックス