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The Kazusa Metabolomics Portal

 

PowerGet

PowerGetは、クロマトグラフィー-精密質量分析データを解析するためのツールです。

本ツールは、これまでPowerSuiteと呼ばれていました。一般公開に伴い、PowerGetに改名しました。また、バッチ処理が可能となり、アダクト判定やアラインメント精度などが向上した後継バージョンPowerGetBatchも公開されています。

このツールが最適化されている実験装置は、ThermoFisher社の精密質量分析器フーリエ変換イオンサイクロトロン型質量分析装置(LTQ-FT)や、オービトラップ型質量分析装置(LTQ-Orbitrap)を、液体クロマトグラフィー(LC)に接続した機器構成です。ですが、入力データの形式やPowerGetのパラメーター調整を行うことで、Waters社のUPLC-Q-TOF-MS等、他の機器由来のデータにも利用することができます。分析の生データは、MassBaseデータベース等からも入手することができます。

PowerGetは、PowerFTとPowerMatchという、二つのモジュールから構成されており、それぞれ以下の機能を提供しています。

PowerFT:

個々のクロマトグラフィー-精密質量分析のデータから、ピークを検出して特徴付けを行うモジュールです。

  • 全化合物ピークを精密質量で検出します。
  • 13C炭素同位体が含まれるピークをグルーピングし、 13C/12C比を自動計算します。これにより分子に含まれる炭素原子の数を推定することが可能です。
  • 溶出時間と溶出パターンが一致している化合物ピークをグルーピングし、その質量差分からイオン化状態(アダクトイオン)を自動的に推定します。これにより、化合物の本来の質量値を推定することができます。また、多価イオンの可能性も推測できます。
  • 上記のデータを考慮し、MFSearcher機能を使って高速に組成式の推定を行います。各種化合物データベースへの検索も可能です。

 

PowerMatch:

PowerFTで解析した複数のサンプルデータを読み込んで、サンプル間でのピークのアラインメントを行うモジュールです。

ピークのアラインメントとは、異なるサンプル間で、同一の化合物と予想されるピーク同士を対応付けることです。アラインメントをすることで、サンプル間でのメタボロームの比較解析がはじめて可能となります。また、繰り返し分析したデータをアラインメントすることで、再現性の高いピーク がどれかを判別することができます。繰り返し分析により、ピークの質量値の精度やMS/MSフラグメントの再現性が上がり、化合物の推定(アノテーション)がしやすくなります。

  • MS/MSデータを持つピークは、MS/MSフラグメントパターンの類似性を考慮したアラインメントが可能です。
  • イオン化状態を考慮することで、ポジティブモードで取得したデータとネガティブモードのデータをアラインメントすることが可能です。
  • 質量値、溶出時間、MS/MSデータ、クロマトグラム上の位置等のデータを確認しながら、アラインメント結果を編集・修正することができます。
  • アラインメントで集計された平均質量値を用いて、組成式推定・データベース検索を行うことが可能です。
  • アラインメントで得られた集計ピーク情報を用いて、他のサンプルと再度アラインメントをすることができます。
  • 選択したピークについての情報を、統合メタボロームデータフォーマット(TogoMD)で一括出力することができます。

ダウンロード :

PowerGet 3.5.8 (4.66 MB)

サンプルデータ (344 MB)
コスモスの花(3連)、葉(3連)、モック(3連)のアラインメント結果です。PowerMatchで読み込むことが可能です。

上記をクリックした後、ダウンロードが開始されるまで数秒~数十秒かかります。しばらくそのままお待ちください。

動作環境:

PowerGetの動作には、Java ランタイム環境(1.6以上)がセットアップされた以下のWindows OSが必要です。

OS: Windows XP / Vista / 7 (32 bit, 64 bit)

マニュアル:

オンラインマニュアル(準備中)

旧バージョンマニュアル:

引用:

PowerGetについて論文等に記載される場合は、以下の論文またはURLをご利用ください。

論文

Sakurai N, Ara T, Enomoto M, Motegi T, Morishita Y, Kurabayashi A, Iijima Y, Ogata Y, Nakajima D, Suzuki H, and Shibata D (2014)
Tools and Databases of the KOMICS web portal for preprocessing, mining, and dissemination of metabolomics data.
BioMed Research International, 2014: 194812

URL

英語サイト: http://www.kazusa.or.jp/komics/software/PowerGet
日本語サイト:http://www.kazusa.or.jp/komics/software/PowerGet/ja/
※必ず上記のURLをご使用ください。ブラウザのアドレスバーに現在表示されているURLは変更されることがあるため、使用しないでください。

お問い合わせ:

こちらまでメールでお寄せください。

櫻井 望, E-mail: sakurai AT kazusa.or.jp (ATは半角の@に直してください)

ライセンス:

本ソフトウェアはアカデミックフリーです。商用利用は認めておりません。