KOMICS

The Kazusa Metabolomics Portal

 

DESCRIPTION

SpiceHit is a peak detection and identification tool for capillary electrophoresis - mass spectrometry, specifically designed for high-throughput analyses with selected ion monitoring (SIM) method. The peaks are detected and quantified from the electropherogram data provided as comma separated vector (CSV) format or the binary files generated by ChemStation (Agilent technologies, Palo, Alto, CA), and identified by comparing the standard compound library which is also prepared by SpiceHit. The peak information is exported as CSV files or Microsoft Excel files. SpiceHit stands for "SIM based Peak Identification tool for Capillary Electrophoresis - mass spectrometory in a HIgh-Throughput manner."

ダウンロード :

SpiceHit ver 2.2 (zip圧縮形式 13.4 MB) * サンプルデータとマニュアルは同梱されています。

サンプルデータ (zip圧縮形式 827 kB)

マニュアル(英語版) (PDF形式 1.35 MB)

* 上記のリンクをクリックしてからダウンロードが開始されるまで、最大で90秒かかる場合があります(ダウンロードファイルのセキュリティーチェックの関係です)。クリックした後は、しばらくお待ちください。

動作環境:

SpiceHitは以下の環境で動作確認を行っています。動作には、Javaランタイム環境1.6以上が必要です。

OS: Windows XP / Vista / 7 (32 bit, 64 bit)
Software: Java Runtime Environment (JRE 1.6.0_32)

引用:

SpiceHitについて論文等に記載される場合は、以下の論文またはURLをご利用ください。

論文

Sakurai N, Ara T, Enomoto M, Motegi T, Morishita Y, Kurabayashi A, Iijima Y, Ogata Y, Nakajima D, Suzuki H, and Shibata D (2014)
Tools and Databases of the KOMICS web portal for preprocessing, mining, and dissemination of metabolomics data.
BioMed Research International, 2014: 194812

URL

http://www.kazusa.or.jp/komics/software/SpiceHit
※必ず上記のURLをご使用ください。ブラウザのアドレスバーに現在表示されているURLは変更されることがあるため、使用しないでください。

お問い合わせ:

Nozomu Sakurai, e-mail: sakurai AT kazusa.or.jp

ライセンス:

This software is academic free, and is not allowed to use for commercial purpose.