SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MZA15.12 (Universal genetic code) : 732 aa
 vs  library
 searching gnl:PID:e1251776 library

   1082 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
gnl|PID|e1251776                                   (1082)1806

>>gnl|PID|e1251776                                   (1082 aa)
Smith-Waterman score: 1806;   44.195% identity in 801 aa overlap

gnl|PI MASSSADNLTDKNIVFRKLKSKSENKVCFDCSAKNPTWASVTYGIFLCIDCSATHRNLGV
               10        20        30        40        50        60

gnl|PI HISFVRSTNLDSWSPEQLRTMMFGGNNRAQVFFKQHGWTDGGKIEAKYTSRAADLYRQIL
               70        80        90       100       110       120

gnl|PI AKEVAKAIAEETNSGLLSSPVATSQLPEVSNGVSSYSVKEELPLSKHEATSATSSPKASN
              130       140       150       160       170       180

gnl|PI TVVPSTFKKPIGAKRTGKTGGLGARKLTTKPKDNLYEQKPEEVAPVIPAVSSTNNGESKS
              190       200       210       220       230       240

gnl|PI SAGSSFASRFEYNDDLQSGGQSVGGTQVLNHVAPPKSSSFFSDFGMDSSFPKKSSSNSSK
              250       260       270       280       290       300

                                                                   
MZA15.                                                   MAEF--SDPP
                                                          :.:   :  
gnl|PI SQVEESDEARKKFTNAKSISSAQYFGDQNKNADLESKATLQKFAGSASISSADFYGHDQD
              310       320       330       340       350       360

       10              20        30        40          50          
MZA15. PSNL--SSS---HKLT-KPNQTLDESSPTAPIRDLVTNSL-SLSSPI-RQIQ--ALSPA-
        ::.  ..:   ..:. . .:  : ::  . :   . ..: .:.: :  .::   :    
gnl|PI DSNIDITASDLINRLSFQAQQ--DLSS-LVNIAGETKKKLGTLASGIFSDIQDRMLEKKV
              370       380          390       400       410       

              60            70        80              90           
MZA15. ------KPDGSS---SSPP-DKTLNFNPEENRD-VN-P----DESSSSPSD--KTLIAPP
             : .. :   :::  :.. . . ..:.: :. :    :  ::: ::  ... .::
gnl|PI RKKLCRKTSNESLALSSPNRDRSDDDDNNNNHDSVSIPPPIYDGYSSSSSDESQSVPSPP
       420       430       440       450       460       470       

     100                110           120            130           
MZA15. A---------QISPVSNNNH-LR-ITNT--SDSYL---YRP--PRRYIEYESDDDELN--
                 :: :. :... :  : .   .:. :    ::  :     . ::::. :  
gnl|PI INLDHDDDECQI-PIRNTSQALDDIDDDIWGDDDLPETRRPWTPNVSPGFGSDDDDDNDD
       480        490       500       510       520       530      

        140       150           160       170       180       190  
MZA15. ---KMEPTKPLQLSWWYP-RIEP---TGVGAGLYNSGNTCFIASVLQCFTHTVPLIDSLR
          : :: : :    .:  : ::   :::::::.: ::.::. ::.::::::::::.:: 
gnl|PI DNSKNEPRKSL----FYGFRQEPEPVTGVGAGLWNLGNSCFLNSVFQCFTHTVPLIESLL
        540           550       560       570       580       590  

            200       210       220       230       240       250  
MZA15. SFMYGNPCNCGNEKFCVMQALRDHIELALRSSGYGINIDRFRDNLTYFSSDFMINHQEDA
       :: :  ::.:::: :::..:.: ::: :::     :    : :::.::: ::.  .::::
gnl|PI SFRYEVPCHCGNEFFCVIRAIRYHIEAALRPERCPIAPYFFFDNLNYFSPDFQRYQQEDA
            600       610       620       630       640       650  

            260       270        280       290       300       310 
MZA15. HEFLQSFLDKLERCCLDPKNQL-GSVSSQDLNIVDNVFGGGLMSTLCCCNCNSVSNTFEP
       :::::.::.::: :  : .... :...:::      ::.: :.: : ::::. ::.:.: 
gnl|PI HEFLQAFLEKLEICGSD-RTSFRGDITSQD------VFSGRLISGLRCCNCDYVSETYEK
            660        670       680             690       700     

             320       330       340       350       360       370 
MZA15. SLGWSLEIEDVNTLWKALESFTCVEKLEDQLTCDNCKEKVTKEKQLRFDKLPPVATFHLK
       :.: :::::::.:: .:::::: ::::..:::::::.:::.::::: .:::: :::::::
gnl|PI SVGLSLEIEDVDTLGSALESFTRVEKLDEQLTCDNCNEKVSKEKQLLLDKLPLVATFHLK
         710       720       730       740       750       760     

             380       390       400       410       420       430 
MZA15. RFTNDGVTMEKIFDHIEFPLELDLSPFMSSNHDPEVSTRYHLYAFVEHIGIRATFGHYSS
       :: :.:. ::::. :...:::.::.:.: . .. ::::.:::::.:::.:  ...:::::
gnl|PI RFKNNGLYMEKIYKHVKIPLEIDLQPYMRNIQENEVSTKYHLYALVEHFGYSVAYGHYSS
         770       780       790       800       810       820     

             440       450       460       470       480       490 
MZA15. YVRSAPETWHNFDDSKVTRISEERVLSRPAYILFYAREGTPWFSSTFEQLKTVFEATPLH
       ::::::. ::.:::::::::.:. :::. .:::::::::: ::::..:... . ::. :.
gnl|PI YVRSAPKIWHHFDDSKVTRIDEDMVLSQDSYILFYAREGTRWFSSVYEEMQPLVEASLLN
         830       840       850       860       870       880     

                500              510       520       530       540 
MZA15. FSPVSVLD---N-------SYESVDNSSKACNDSVGVSIPDVKWPDSCCQEPKEEVFHSA
        :: ::::   :       :::. :..:: : ::.::    ::  ..  .  ...:: ::
gnl|PI SSPKSVLDSSTNGECLSEISYENGDKASKPC-DSAGVCNQHVKTKEDFVSLSNDDVFLSA
         890       900       910        920       930       940    

               550       560        570       580       590        
MZA15. ESSNNEDS--SAMIDALGSPQ-SEKPFAETSQQTEPESCPTENKAYIDKSEKPFAETSQP
       :::..:.:  . ..: : .:. : .: .:     : .:: . ..: : ...  :      
gnl|PI ESSSGEESPMGELLDPL-DPDDSYSPCTEK----ESDSCLAIERATI-RDD--F------
          950       960        970           980          990      

      600       610       620       630       640       650        
MZA15. KEPKPFADRASIDAPLLKVQNQDISPKRKAGERATLGGPKLKYQKPNSHQKRQGTFQIQR
            :        :::  :::         : .: ..:::        :.:  ::..: 
gnl|PI -----F--------PLLLDQNQ---------ESST-SSPKL--------QER--TFEMQL
                                   1000               1010         

      660         670        680       690       700       710     
MZA15. AHLQ--TKKQEESRKTKRPLFR-SNVAASAPDPKYKNHALSYLNRAQTPRARKLAN-ALS
        ...  ::.::     :.::   ::.: :  . ..   . . : .  .::::.: . :.:
gnl|PI LQMEETTKSQEP---WKQPLSSISNIADSM-EAEF---VYGDLMKKPSPRARELLDQAIS
      1020         1030      1040          1050      1060      1070

            720       730  
MZA15. D--SPTKKKKSSNMRRSIKL
          :: :: :..        
gnl|PI TNGSPPKKLKTT        
             1080          

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