SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MYH9.10 (Universal genetic code) : 995 aa vs library searching gi:3860271 library 868 residues in 1 sequences The best scores are: s-w gi|3860271 (868)2015 >>gi|3860271 (868 aa) Smith-Waterman score: 2015; 37.896% identity in 884 aa overlap 10 20 30 40 50 60 MYH9.1 MTNCVPLSFVQSCVGHRGAARFFHSRLYKNRLDKDVYLCNNLINAYLETGDSVSARKVFD 70 80 90 100 110 120 MYH9.1 EMPLRNCVSWACIVSGYSRNGEHKEALVFLRDMVKEGIFSNQYAFVSVLRACQEIGSVGI gi|386 MRFTTTIWR 130 140 150 160 170 MYH9.1 LFGRQIHGLMFKLSYAVDAVVSNVLISMYWKCIGSVG----Y-ALCAFGDIEVKNSVSWN :.. :: ..:.. . .: :.:.:. : : : .. :. gi|386 PPSLENFKPKFRI-YA-NGVAQ---VRIY--CFGTVSSSRLYNAHNLFDKSPGRDRESYI 10 20 30 40 50 60 180 190 200 210 220 230 MYH9.1 SIISVYSQAGDQRSAFRIFSSMQYDGSRPTEYTFGSLVTTACSLTEPDVRLL-EQIMCTI :.. .:. : . : :.: ... : . :.:.. .. .: : .:. .:. : gi|386 SLLFGFSRDGRTQEAKRLFLNIHRLGMEMDCSIFSSVLKVSATLC--D-ELFGRQLHCQC 70 80 90 100 110 240 250 260 270 280 290 MYH9.1 QKSGLLTDLFVGSGLVSAFAKSGS-LSYARKVFNQMETRNAVTLNGLMVGLVRQKWGEEA : :.: :. ::..::... : :: .. .::::..:. ::.:: . :. : .:.. ..:. gi|386 IKFGFLDDVSVGTSLVDTYMK-GSNFKDGRKVFDEMKERNVVTWTTLISGYARNSMNDEV 120 130 140 150 160 170 300 310 320 330 340 350 MYH9.1 TKLFMDMNSMIDVSPESYVILLSSFPEYSLAEE-VGLKKGREVHGHVITTGLVDFMVGIG ::: :.. ..:.:.. . ... :::: :: .: .:: :. .:: : . .. gi|386 LTLFMRMQNE-GTQPNSFT-FAAALG--VLAEEGVG-GRGLQVHTVVVKNGL-DKTIPVS 180 190 200 210 220 230 360 370 380 390 400 410 MYH9.1 NGLVNMYAKCGSIADARRVFYFMTD-KDSVSWNSMITGLDQNGCFIEAVERYKSMRRHDI :.:.:.: :::.. :: ... :. :. :.:::::.: :: .::. . ::: . . gi|386 NSLINLYLKCGNVRKAR-ILFDKTEVKSVVTWNSMISGYAANGLDLEALGMFYSMRLNYV 240 250 260 270 280 290 420 430 440 450 460 MYH9.1 -LP-GSFTLISSLSSCASLKWAKLGQQIHGESLKLGIDLNVSVSNALMTLYAE-TGYLNE : .::. . .: ::.:: .. .:.: .: :. .. .. .:::. :.. :..:. gi|386 RLSESSFASVIKL--CANLKELRFTEQLHCSVVKYGFLFDQNIRTALMVAYSKCTAMLDA 300 310 320 330 340 470 480 490 500 510 520 MYH9.1 CRKIFSSMPE-HDQVSWNSIIGALARSERSLPEAVVCFLNAQRAGQKLNRITFSSVLSAV : .:. . . :::...:... ... . ::: : . .: : . :..:.: .:.:. gi|386 LR-LFKEIGCVGNVVSWTAMISGFLQNDGK-EEAVDLFSEMKRKGVRPNEFTYSVILTAL 350 360 370 380 390 400 530 540 550 560 570 580 MYH9.1 SSLSFGELGKQIHGLALKNNIADEATTENALIACYGKCGEMDGCEKIFSRMAERRDNVTW .: .: .:. ..:.: .:. .::. : : :... :.:: . .. : :.: gi|386 PVISPSE----VHAQVVKTNYERSSTVGTALLDAYVKLGKVEEAAKVFSGIDDK-DIVAW 410 420 430 440 450 460 590 600 610 620 630 640 MYH9.1 NSMISGYIHN-ELLAKALDLVWFMLQTGQRLDSFMYATVLSAFASV-ATLERGMEVHACS ..:..:: .. : : :. . . . : . . : ....:.. :.. :.. .: . :. . gi|386 SAMLAGYAQTGETEA-AIKMFGELTKGGIKPNEFTFSSILNVCAATNASMGQGKQFHGFA 470 480 490 500 510 520 650 660 670 680 690 700 MYH9.1 VRACLESDVVVGSALVDMYSKCGRLDYALRFFNTMPVRNSYSWNSMISGYARHGQGEEAL ... :.:.. :.:::. ::.: : .. : . :. . .. ::::::::::.:::. .:: gi|386 IKSRLDSSLCVSSALLTMYAKKGNIESAEEVFKRQREKDLVSWNSMISGYAQHGQAMKAL 530 540 550 560 570 580 710 720 730 740 750 760 MYH9.1 KLFETMKLDGQTPPDHVTFVGVLSACSHAGLLEEGFKHFESM-SDSYGLAPRIEHFSCMA .:. :: .. : :::.::..::.::::.::: :.:. : : .:: :: :::. gi|386 DVFKEMK-KRKVKMDGVTFIGVFAACTHAGLVEEGEKYFDIMVRDCK-IAPTKEHNSCMV 590 600 610 620 630 770 780 790 800 810 820 MYH9.1 DVLGRAGELDKLEDFIEKMPMKP-NVLIWRTVLGACCRANGRKAELGKKAAEMLFQLEPE :. .:::.:.: ::.:: .: . ::::.:.:: :.. .:.:::. ::: .. ..:: gi|386 DLYSRAGQLEKAMKVIENMP-NPAGSTIWRTILAAC-RVH-KKTELGRLAAEKIIAMKPE 640 650 660 670 680 690 830 840 850 860 870 880 MYH9.1 NAVNYVLLGNMYAAGGRWEDLVKARKKMKDADVKKEAGYSWVTMKDGVHMFVAGDKSHPD ... ::::.:::: .: :.. .:.:: :.. .:::: ::::. .:. .. :.:::.::: gi|386 DSAAYVLLSNMYAESGDWQERAKVRKLMNERNVKKEPGYSWIEVKNKTYSFLAGDRSHPL 700 710 720 730 740 750 890 900 910 920 930 940 MYH9.1 ADVIYKKLKELNRKMRDAGYVPQTGFALYDLEQENKEEILSYHSEKLAVAF-VLAAQRSS : :: ::..:. ...: :: :.:...: :...:.:: .:. :::.::.:: ..:. ..: gi|386 KDQIYMKLEDLSTRLKDLGYEPDTSYVLQDIDDEHKEAVLAQHSERLAIAFGLIATPKGS 760 770 780 790 800 810 950 960 970 980 990 MYH9.1 TLPIRIMKNLRVCGDCHSAFKYISKIEGRQIILRDSNRFHHFQ-DGACSCSDFW :. :.:::::::::: ..: :.::: :.:..:::::::::. ::.:::.::: gi|386 --PLLIIKNLRVCGDCHLVIKLIAKIEEREIVVRDSNRFHHFSSDGVCSCGDFW 820 830 840 850 860 Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:01