SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MXF12.P3 (Universal genetic code) : 1378 aa vs library searching gnl:PID:e1308241 library 1318 residues in 1 sequences The best scores are: s-w gnl|PID|e1308241 (1318)4720 >>gnl|PID|e1308241 (1318 aa) Smith-Waterman score: 4720; 53.556% identity in 1434 aa overlap 10 20 30 40 50 60 MXF12. QSMELYSLPSLNISNCVTVKLTERNYILWKSQFESFLSGQGLLGFVNGAVSAPLSTVPGP :: :: . :: :: gnl|PI MGQPLLHQIR-------STKPGS 10 70 80 90 100 110 MXF12. QNNGVTEAVSN-------PE-HQAWLRLDQVVMAWLLGLLSEDILSVVVGSATSHAVWSN .. ::. :: :. ..:: . : :. : .. . .: . : : .. gnl|PI RQ---TES-SNLGFLDPFPRISSVWLSTATLHMR-LFEL-QRRLQNVSKRDKTMDAYLND 20 30 40 50 60 70 120 130 140 150 160 170 MXF12. L--ICDQLASVGSPVAEKIKVFAMVHGLTREYEPLITSLESSLDAFPGPPYEDIVYSLKG : ::::::::::::.::.:.:: ..:: :::::. :..:.:.:. ::: :... .: : gnl|PI LKNICDQLASVGSPVTEKMKIFAALNGLGREYEPIKTTIENSMDTQPGPSLENVIPKLTG 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 MXF12. FDDRLQRYAVTSDVSPHLAFNTFRSSNRGRGQSSGRGGRNRGRGSGNFSTRGRGFHQQFS .::::: : . .::..::: . .:. .: :.. :::. gnl|PI YDDRLQGYLEETTISPYVAFN-ITTSD-----DSYRNSYNRGK----------------- 140 150 160 240 250 260 270 280 290 MXF12. GSSSGDPNTEKPMCQICGKRGHPALQCWHRFDDSYQEESDVAAAAFNALHISEVTDDAGW : . : : : .: : gnl|PI -----D---------VT---------------D--Q-------------HGNE------W 170 300 310 320 330 340 350 MXF12. FPDTGATAHITNNAQRLSQSQPYYGTDTVMASDGNFLPITHIGSAKLPSTSGMLPLKDVL .::..::::.::. . :.:::::.:::..:..:::.::::: ::..: :.:: .:: ::: gnl|PI LPDSAATAHVTNSPRSLQQSQPYHGTDAIMVDDGNYLPITHTGSTNLASSSGTVPLTDVL 180 190 200 210 220 230 360 370 380 390 400 MXF12. 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