SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MXF12.P1 (Universal genetic code) : 738 aa
 vs  library
 searching gnl:PID:e249980 library

    803 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
gnl|PID|e249980                                    (803)1750

>>gnl|PID|e249980                                    (803 aa)
Smith-Waterman score: 1750;   41.096% identity in 730 aa overlap

gnl|PI MRILIQEMLIRTLFFFYLIISSLEFTPENNYLINCGSFNDTSIDDRIFLADNLNSTVLST
               10        20        30        40        50        60

gnl|PI PETIFANSSNSNSVLDLYKSARIFNGSSQYNFSINKKGWHWIRLHFFPFPISNEKFNLSS
               70        80        90       100       110       120

                                    10         20        30        
MXF12.                      IPESSSLIKEFIVPVNQT-LDLTFTPSPNSLAFVNGIEI
                            .:    ..::: . ::.. : : :::: :::::.::.:.
gnl|PI AKFSVFAQNFTLLKDFQPLNNVP----VVKEFSLNVNSNNLLLKFTPSRNSLAFLNGLEV
              130       140           150       160       170      

       40        50        60        70        80        90        
MXF12. ISMPDRFYSKGGFDDVVRNVGRDVDFEIDNSTAFETVYRVNVGGKVVGDVGDSGMFRRWL
       ::.::..     :     ..: . ..:  :  :.::: :::.:. .:..  :. . : ::
gnl|PI ISLPDELIP---F-----SIGNQ-NLE-KN--ALETVVRVNMGNVTVSS-KDDPLGRIWL
        180               190           200       210        220   

      100       110        120          130        140       150   
MXF12. SDEGFLLGINSGAIPNITGVK-INYT---DKTPAYVAPEDVYTT-CRLMGNKDSPELNLN
       :: ..: ..:   .  ..... .:::   .:.   ..: .:: :  .: .  : :  : .
gnl|PI SDYNYLSNVN--LVVFVSNIHLVNYTKGEEKVSENIGPSSVYGTGTKLHSVFD-P--NTQ
           230         240       250       260       270           

           160       170        180       190       200       210  
MXF12. FNLTWLFEVDAGFAYIVRLHFCET-QPEVNKTGDRVFSIFFGYQLAMREMDVFRLSGGFR
       .: ::::.::.::.:..:.:::.  .:  :  ..  :..:.. .........   ::.  
gnl|PI INATWLFNVDSGFGYFIRFHFCNLLNPIPN--NNFFFNVFLNSEFVVKDLNL-STSGA--
      280       290       300         310       320        330     

            220       230       240         250       260       270
MXF12. LPMYLDFKVLVDADGTSQRPSLRVDLTP--YKEDYPTYYDAILSGVEILKLSNSDGNLAG
        ::: :  :.:    :.  :..:... :   ...::   :.::.:.::.:.:.:::.::.
gnl|PI -PMYKDV-VVV----TNVVPQIRISVGPSNVRNSYP---DGILNGLEIMKISTSDGSLAA
             340           350       360          370       380    

              280       290       300        310       320         
MXF12. LNPIPQLSPPPQSITPLKGKGKSSHVLPIIIAV-VGSAVALAFFVLVVVLVVMKRKKKSN
       ..   .. :  .: . ::       :  ::... .:  ..: . :..::.. ..:.:.  
gnl|PI VDA--DF-PSSSSSSKLK-------VW-IIVSLAIG--ISLILVVFTVVFL-FRRRKR--
             390              400          410       420           

     330       340       350       360        370       380        
MXF12. ESSVDTTNKPSTNSSWGPLLHGTGSTNTKSASSLP-SDLCRRFSIYEIKSATNDFEEKLI
       .  . .:  :.         : :   ...: : .  : .  :: .  .. ::..: :. .
gnl|PI HVMIHST--PD---------HLTEEDDSNS-SIFSRSKIGYRFPLAVVQEATDNFSENRV
      430                  440        450       460       470      

      390       400        410         420       430       440     
MXF12. IGVGGFGSVYKGRI-DGGATLVAVKR-LEITSN-QGAKEFDTELEMLSKLRHVHLVSLIG
       ::.::::.:::: . ::  : ::::: .  .:. :: .:: ::.:.::..:: :::::::
gnl|PI IGIGGFGKVYKGVFKDG--TKVAVKRGISCSSSKQGLSEFRTEVELLSQFRHRHLVSLIG
        480       490         500       510       520       530    

         450       460       470       480       490       500     
MXF12. YCDDDNEMVLVYEYMPHGTLKDHLFRRDKASDPPLSWKRRLEICIGAARGLQYLHTGAKY
       :::. :::...::.: .:::.:::.  ::   : :.:..:.:::::.:.::.:::::.  
gnl|PI YCDEKNEMIIIYEFMENGTLRDHLYGSDK---PKLNWRKRVEICIGSAKGLHYLHTGTMK
          540       550       560          570       580       590 

         510       520       530       540       550       560     
MXF12. TIIHRDIKTTNILLDENFVAKVSDFGLSRVGPTSASQTHVSTVVKGTFGYLDPEYYRRQI
        :::::.:..:::::::..:::.:::.:..::   .::::::.:::.::::::::   : 
gnl|PI RIIHRDVKSANILLDENLMAKVADFGVSKTGPDHFDQTHVSTAVKGSFGYLDPEYLTMQK
             600       610       620       630       640       650 

         570       580       590       600        610       620    
MXF12. LTEKSDVYSFGVVLLEVLCCRPIRMQSVPPEQADLIRW-VKSNFNKRTVDQIIDSDLTAD
       :::::::::::::.::.:  ::.   : : :...:..: .: .   :  ..:.:::.. .
gnl|PI LTEKSDVYSFGVVMLEILTGRPVIDPSKPREMVNLVEWAMKCS---RKGEEIVDSDIVNE
             660       670       680       690          700        

          630       640       650       660       670        680   
MXF12. ITSTSMEKFCEIAIRCVQDRGMERPPMNDVVWALEFALQLHETAKKKNDNVESL-DLMPS
       .   :. :: : : .:. .::..:: :.::.: :: :::: .  .:.:.. : . :.  .
gnl|PI VRPESLIKFQETAEKCLAERGVDRPTMGDVLWNLECALQL-QGKQKENEQPEEMRDVSAT
      710       720       730       740        750       760       

             690           700        710       720       730      
MXF12. GEV--GTTTD----GEDDLFSRTTGHVG-KSTTTDDSVLVVGDERSGSSWGVFSEINEPK
        :.  :. .:    . . .::. .   : .:                             
gnl|PI -EISLGSMADLAAVSMSKVFSELVKAQGTRSEFGSAP                       
        770       780       790       800                          

         
MXF12. AR

Library scan:  0:00:00  total CPU time:  0:00:00