SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MUA2.13 (Universal genetic code) : 1054 aa vs library searching t1g114 library 1029 residues in 1 sequences The best scores are: s-w T1G114, 1029 bases, D52 checksum. (1029)2026 >>T1G114, 1029 bases, D52 checksum. (1029 aa) Smith-Waterman score: 2026; 36.076% identity in 1106 aa overlap T1G114 MEFPGSSNQHLGRDRFNGEVGCGNNCSQTGEEFSNEFLRDFGAQRRLQHGGVNRNVEGNY 10 20 30 40 50 60 10 20 30 MUA2.1 MDSG-SVNSSVTSLVSSLNDE--PHRVKFLCSFLGSILPRPQ .::. : .: . ....: :. .:.:::: : :: :: T1G114 NNRHLVYEDFNRILGLQRVDSNMSEDSPRKMFQTAISDVYLPEVLKLLCSFGGRILQRPG 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 MUA2.1 DGKLRYVGGETRIVSVNRDIRYEELMSKMRELYDGAAVLKYQQPDEDLDALVSVVNDDDV ::::::.::::::.:. . . .::: : : . ..::: : ::::::.:: .:.:. T1G114 DGKLRYIGGETRIISIRKHVGLNELMHKTYALCNHPHTIKYQLPGEDLDALISVCSDEDL 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 MUA2.1 TNMMEEYDKLGSGDGFTRLRIFLFSTPEQDGSLHYVERDDQRESERRYVDALN-NLIEGT .:.:::.. . : :.:.:: .: ..: : . . :: . .: : . : T1G114 LHMIEEYQEAETKAGSQRIRVFL--VPSTESS----E-SPKIFHERNM--NINRNTNQQT 190 200 210 220 230 160 170 180 190 200 210 MUA2.1 DFRKLQQYPDSPRFN-LVDDFSMVEPMLNQLSIETGGGSQRGNEIPTAQYSNLHQLRIPR :. . : : .. .: .:: : : : : ..: : :. :.:..: .. : T1G114 DIDHYQ-YVSA--LNGIVD----VSP---QKS--SSG--QSGTS-QTTQFGNASEFS-PT 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 MUA2.1 VGSGQMLAQRYGEVEGTWSPFYSPRHHGHHDPRTFQEFPSSPSSARYRMPYGEIPDKGLD : . :. :: .:. ..: ::.. : . ..: . :: .:: ... T1G114 F----HLRDSPTSVH-TW------EHKDSNSP-TFMK-PYGNTNAVHFMPKMQIPRNSFG 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 MUA2.1 RM-PEEYVRPQASHHPFYEHQ-AHIPDSVVWVPAGAMPPESKGGF--PGNVLHGGPGGYE .. : : .: :: :. :. : :: : ...:: : : ..: T1G114 QQSP-----P-TS--PFSVHKRANT-D----VPYFA----DQNGFFDP--YL-AAP---- 330 340 350 340 350 360 370 380 390 MUA2.1 GGNGCENCRVPYHRNHQLLEQSNIGNNGFPPVHCAHCPPNRESFLLNTDPKPTHHG-AYP : : ..:. ..: .. .. : :. : : : : : :: :: T1G114 --N------FP-QQNRFFFE-TTTQKQKHPEVNL-H--DRRPS----DDIYP--HGQAY- 360 370 380 390 400 410 420 430 440 MUA2.1 NETFGPDRGWMVQQQVNP-NPPRIEEGRSHISNVGRPNDHYT--PDYPV--SNYPLGQRA .: .. :. .. : . :.... .:.:.: : . .: : . . .: . . T1G114 ---IGAEK--MTLKK-NALSDPQLHD-ESQINN-GL--EAFTKQP-WKILRKNLRVVATS 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 MUA2.1 GHEISNEGFHDKPLGG----------IPLNS-ANRSAEERGFHYGNNLYPPGPDSIHSAG : :.. . ..: : .: :: ::. . .: ... : .: : . T1G114 KWEDSDDIYFNNPEGKRCKELELTKEVP-NSWINRDNNPDSFDQATK-KQDGSNSNSSFS 450 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 MUA2.1 HSHM---HHPQPNIWQNVSNPIAGPPGLPMQINGTVNQTVIRNPIETA-PRYSTGMENQ- ... :.: .: .. :. .: . ...: : :. : .. . ... :.... T1G114 PNYFSPNHQPAAQITSSDSQD-SGSSVFSLSVN-T-NE----NYLDCSREKFN-GFQHDM 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 MUA2.1 --GVLVGSPQRISGFDGMSSLGQPS----YPNPHLQDRAFPLDPNWVPSENPTVHNEHLQ .:. : . :. : . : . : : .: . ::.: . . :.. .. . : T1G114 SLDILIRS--HTSATDQLCSTTKSSDKADYSSP---NTNFPVDLE-TNSDDSDTQ-KSLP 560 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 660 MUA2.1 VREPLPGPLLQTNLTAAPIMQTPVMQTSVESKLAQGGEQFNYVNTGISNGVPYQDKPQPL :: . ..: :. .. .:. .::...: . .. . : :: . T1G114 -REE---SIHYSGL---PLRKVGSRETTFMH--TQGSDDF-F-KSKLL-G------PQLI 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 MUA2.1 AGGKKDMGNLVEVNPSAATLEGAELSVERLSFLPELMESVKRAALEGAAEVKAHPEEAKD . .:. : : .. . : ::. ...:. :.: :. . :.. .: :. T1G114 V---EDVTNEV-ISDN---L----LSA---TIVPQ----VNR---ESDDDHKSYTRE-KE 660 670 680 690 730 740 750 760 770 MUA2.1 QVRPELVENESE---HMNA-----QDEPEIDSDSDNPNNFKIEQTKAEAEAKSRGLQSIR . . :.: : .... :.. . . ..: ..:. : . .: :: ::: :. T1G114 ITNADH-ESEMEVGVYLSGIFFILQEKYKKSRNTD--DSFS-EAAMVEIEAGIYGLQIIK 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 MUA2.1 NDDLEEIRELGHGTYGSVYHGKWKGSDVAIKRIKASCFAGKPSERERLIEDFWKEALLLS : :::...::: ::.:.::.:::.:.:::::::: :::.: ::. : .:::.:: .:. T1G114 NTDLEDLHELGSGTFGTVYYGKWRGTDVAIKRIKNSCFSGGSSEQARQTKDFWREARILA 750 760 770 780 790 800 840 850 860 870 880 890 MUA2.1 SLHHPNVVSFYGIVRDGPDGSLATVAEFMVNGSLKQFLQKKDRTIDRRKRLIIAMDTAFG .:::::::.:::.: ::: :..:::.:.::::::.. ::.::: ::.:.:..:.::: T1G114 NLHHPNVVAFYGVVPDGPGGTMATVTEYMVNGSLRHVLQRKDR----RKKLMITLDSAFG 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 MUA2.1 MEYLHGKNIVHFDLKCENLLVNMRDPQRPICKIGDLGLSKVKQKTLVSGGVRGTLPWMAP ::::: ::::::::::.:::::.:::::::::.::.:::..:..:::::::::::::::: T1G114 MEYLHMKNIVHFDLKCDNLLVNLRDPQRPICKVGDFGLSRIKRNTLVSGGVRGTLPWMAP 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 MUA2.1 ELLSGKSNMVSEKIDVYSFGIVMWELLTGEEPYADMHCA------SI-IGGIVNNALRPK :::.:.:: ::::.::.::::::::.::::::::..::. .. .::::::.::: T1G114 ELLNGSSNRVSEKVDVFSFGIVMWEILTGEEPYANLHCVFEQDELGLSFGGIVNNTLRPP 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 MUA2.1 IPQWCDPEWKGLMESCWTSEPTERPSFTEISQKLRTMAAAMNLK .:. :. ::. :::.::. .: ::::::: ..::.:..:.. : T1G114 VPERCEAEWRKLMEQCWSFDPGVRPSFTEIVERLRSMTVALQPKRRT 990 1000 1010 1020 Library scan: 0:00:01 total CPU time: 0:00:06