SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MTE17.9 (Universal genetic code) : 401 aa
 vs  library
 searching tm021b0410 library

    457 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
TM021B0410, 457 bases, 172F checksum.              (457)1553

>>TM021B0410, 457 bases, 172F checksum.              (457 aa)
Smith-Waterman score: 1553;   59.762% identity in 420 aa overlap

                                                        10         
MTE17.                                          MSIGLTEFVTNKLAAEHPQ
                                                    ..: .:  :      
TM021B MLDSLVSKLPSLSTSDHASVVALNLFVALLCACIVLGHLLEENRWMNESITALLI-----
               10        20        30        40        50          

      20        30        40        50        60        70         
MTE17. GAASGTVILLISKGKSSHILVFDEELFFIYLLPPIIFNAGFQVKKKKFFHNFLTIMSFGV
       : ..:..:::::::::::.:::.:.:::::::::::::::::::::.::.::.::: ::.
TM021B GLGTGVTILLISKGKSSHLLVFSEDLFFIYLLPPIIFNAGFQVKKKQFFRNFVTIMLFGA
          60        70        80        90       100       110     

      80        90       100          110       120       130      
MTE17. IGVFISTVIISFGTWWLFPKL--G-FKGLSARDYLAIGTIFSSTDTVCTLQILHQDETPL
       .:..:: .:::.:.  .: ::  : :  :.  ::::::.::..::.:::::.:.::::::
TM021B VGTIISCTIISLGVTQFFKKLDIGTFD-LG--DYLAIGAIFAATDSVCTLQVLNQDETPL
         120       130       140          150       160       170  

        140       150       160       170       180       190      
MTE17. LYSLVFGEGVVNDATSVVLFNAVQKIQFESLTGWTALQVFGNFLYLFSTSTLLGIGV---
       ::::::::::::::::::.:::.:....  :.  .:....:::::::  ::::: .:   
TM021B LYSLVFGEGVVNDATSVVVFNAIQSFDLTHLNHEAAFHLLGNFLYLFLLSTLLGAAVSPL
            180       190       200       210       220       230  

                    200               210       220       230      
MTE17. ---------GLITSFVLKTLYFGR--------HSTTRELAIMVLMAYLSYMLAELFSLSG
                :::...:.: :::::        ::: ::.:.:.:::::::::::::.:::
TM021B FSSLPFFLTGLISAYVIKKLYFGRWPHINCHRHSTDREVALMMLMAYLSYMLAELFDLSG
            240       250       260       270       280       290  

        240       250       260       270       280       290      
MTE17. ILTVFFCGVLMSHYASYNVTESSRITSRHVFAMLSFIAETFIFLYVGTDALDFTKWKTSS
       ::::::::..::::. .:::::::::..:.:: :::.:::::::::: ::::. ::.. :
TM021B ILTVFFCGIVMSHYTWHNVTESSRITTKHTFATLSFLAETFIFLYVGMDALDIDKWRSVS
            300       310       320       330       340       350  

        300       310       320       330       340       350      
MTE17. LSFGGTLGVSGVITALVLLGRAAFVFPLSVLTNFMNRHTERNESITFKHQVIIWWAGLMR
        . : ...::... .::..:::::::::: :.:. ...  ..:.:.:. ::.:::.::::
TM021B DTPGTSIAVSSILMGLVMVGRAAFVFPLSFLSNLAKKN--QSEKINFNMQVVIWWSGLMR
            360       370       380       390         400       410

        360       370         380       390       400   
MTE17. GAVSIALAFKQFTYSGVTLDPV--NAAMVTNTTIVVLFTTLVKQILP  
       ::::.:::...:: .: : : :  :: :.:.:  : ::.:.:...    
TM021B GAVSMALAYNKFTRAGHT-D-VRGNAIMITSTITVCLFSTVVRNLWMIK
              420         430       440       450       

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