SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MTE17.13 (Universal genetic code) : 967 aa vs library searching af0524273 library 730 residues in 1 sequences The best scores are: s-w AF0524273, 730 bases, 1363 checksum. (730) 373 >>AF0524273, 730 bases, 1363 checksum. (730 aa) Smith-Waterman score: 373; 23.367% identity in 796 aa overlap 10 20 30 40 50 60 MTE17. MESEPDQSFKDLSWFLQAIKDPQQTFFNLQTLSFSSSGNTTHCQLITESSMNINVTRDNL AF0524 MFASVG 70 80 90 100 110 MTE17. TSLSQIFIELATSLETQTSLRNL-EFEGIFWEIELLQSLGLLLDNTSKIKQLAFRKNRFS : :.: .: . .:. .: . . .: :. . ...: .. :. .::.:.. AF0524 VSEEQVFGDLYLAWLKDTGEKNSNDSRKLFREV-VERGFG------GR--QIILRKERLG 10 20 30 40 50 120 130 140 150 160 170 MTE17. EQCLNELSEILKRNRFLKEVMFLESSIGYR--GATLLGSALQVND--SLEELQIWEDSIG . :. .:.:. . . . :... : : .. . : . : .: :.. ..:: AF0524 ANVAASLAALLHRSPLTR--LDLHGNT-LRDSGCEMV-AHL-IRDIPNLVYLDLGANDIG 60 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 MTE17. SKGAEELSRMIEMNSSLK-LF---SIFDS-----SPFTATPLISAVLGMNREMEVHM-WS : . :: .. ...:. :. :: :. . .:: :. . : :: .. :. : AF0524 PLGIQTLSYVVAAHKKLQTLILGSSIKDAYANRINAASATSLLEGCL-RNRTLR-HLDLS 120 130 140 150 160 170 230 240 250 260 270 MTE17. GDHKR--DRSLKL------VEF-L---PESKTLRIYQIDISGSCRVAAALGMNTTVRSL- :. : :.. ::: . :.: :. : . ..::... ..: AF0524 GSTIGIPDAILNIHGGTGAVEFNVAPPPRSPGSSIFPT-ARRSQQGQSSLGFGSG-KGLA 180 190 200 210 220 280 290 300 310 MTE17. -DMTGAKLNSRWAKE--------FRW---VLEQ----NKTLREVKLSKTGLK-DKAVVYI . ::: ... . : :: :: . . :: .:: .. : : :. : AF0524 GSATGAAASGKGVAETDGDIGGSFRRPIDVLSELISTSTTLTTLKLREVRLTTDAALRII 230 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 MTE17. AAGLFKNKSLQSLYVD--GNRF-GSVGVEDLLCPL--SRFSALQLQANITLRSIVFGGSN :.. :. :: : .:: :: . :.:: : . : .: .::: .. :..:... .: AF0524 HAAM-KSPSL-S-FVDLSGNALTGAVG--DAFGELVWNRAGALQTSG---LHTILLS-NN 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 MTE17. TKIG-RDGLTA--VLKMVTTNETVVHLGIHDDASLG-PDDFIHIFKS-LQKNASLRRFSL : ..:. : ... .. .. :..: : : . : :: :. . : :..:..:. . : AF0524 PLIQPKSGMPAPKLFSALSMDRLVLRL--HLD-NCGVDDDAIEALCSALKRNGALQSLHL 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 MTE17. -QGCKGVRGDRVLEAITETLQINPLIEEIDLARTPLQDSGKADEIYQKLGHNGR---KID :. .: :. : ..: .. ...:..: . . : : : . . ...: ... AF0524 NQNAITSEGA-VMLA--RALCVHIFLKEVSLEGNKILDEG-A-CAFAGMLETNRTLLSLN 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 MTE17. EAET---DDSLKDM--PLTEPKSV-RAFLCGQNY--AGKTTLCNSILQSSSASGFPYVEN :.: . .: . :.: :.. : . ..:. : :.:.:. .. AF0524 LAHTWMGERGLVALGVSLVENKTLLRLNI-AENHFTEDATEAFASLLESNH-----HLLR 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 MTE17. VRNLMNPVEQVVKTVGGMKI-K-TFKDEETKISMWNLAGQHEFFALHDLMFPSPCFFLIV : : . . .:: ..: : : ...:.. .: . . : ..: : . AF0524 CRMQGNSIGH--HTV--LRIEKITSRNREAHRNMEK--DELEENVIH-LHY--------- 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 MTE17. LSLFRKPSNKEPKTPAEVEEELEYWLRFIVSNSRKAIQQCMKPNVTIVLTHSEKINLQSE .... : . ::.:. :. : . .: :.. .. .. . ....:: ... AF0524 -QMYKLD---EAR--AELEN-LQ---RKKMELGR-ALET-LEAQLKLDMAEAEK---KDR 550 560 570 580 590 660 670 680 690 700 MTE17. SFQATV-GCI-Q--R-LRDKFQALVEFYPTVFTVDARSSPSVSKLTHHIRMTSK-AILQR ... .. .:: : : :..: . : : . .:... :. : . :.... :. .. AF0524 DMKDAIENCITQEARCLEEK-KRL----DTELE-EAKKQLEVDMETAKERLAAEVAVREK 600 610 620 630 640 710 720 730 740 750 760 MTE17. VPRVY-QLCNDIVQLLSDWRSENSNKPIMRWKAFADL---CQFKVPSL-RIKSRNENIQI : . . :: .:: : ... .. . . . .: :: . :: : . :: : AF0524 VEEEHRQLK---LQL-EDMMNNGPQREAAKRQQLKELNEDCQ-RW-SLQRKEYRNA---I 650 660 670 680 690 770 780 790 800 810 820 MTE17. VETRRHAIATCLHQMGEVIYFDDLGFLILDYEWFCGEVLTQLIKLDVRKQSTGERNGFVS .: : :: ..:. : AF0524 AE----AQAT-VNQLQERDGAGTKSKKGKKRAGKAK 700 710 720 730 830 840 850 860 870 880 MTE17. RKELEKTLRSSLQSPIPGMTSKVLEHFDACDLVKMMKKVELCYEQDPSSPDSSLLVPSIL 890 900 910 920 930 940 MTE17. EEGRGKTQKWQINTHDCVYSGRHLQCDDSSHMFLTAGFFPRLQARAQNHFSVSFISLTQT 950 960 MTE17. LPIFHVACTGASSQQNHGTEEPTRGDL Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:00