SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MTE17.10 (Universal genetic code) : 537 aa vs library searching mlp1_yeast library 1875 residues in 1 sequences The best scores are: s-w MLP1_YEAST, 1875 bases, C5C checksum. (1875) 378 >>MLP1_YEAST, 1875 bases, C5C checksum. (1875 aa) Smith-Waterman score: 378; 24.631% identity in 609 aa overlap MLP1_Y MSDHDTPMESIQNGENSDERLNAIASFFGCSLEQVKSFDGDVVKHLNDKLLQFNELKSEN 10 20 30 40 50 60 MLP1_Y LKVTVSFDELKASSLKKIDGLKTEMENVIRENDKIRKERNDTFVKFESVENEKMKLSSEL 70 80 90 100 110 120 MLP1_Y EFVKRKLDDLTEEKKETQSNQQRTLKILDERLKEIELVRVENNRSNSECKKLRSTIMDLE 130 140 150 160 170 180 MLP1_Y TKQQGYITNDLNSRTELERKTQELTLLQSNNDWLEKELRSKNEQYLSYRQKTDKVILDIR 190 200 210 220 230 240 MLP1_Y NELNRLRNDFQMERTNNDVLKQKNNELSKSLQEKLLEIKGLSDSLNSEKQEFSAEMSLKQ 250 260 270 280 290 300 MLP1_Y RLVDLLESQLNAVKEELNSIRELNTAKVIADDSKKQTPENEDLLKELQLTKEKLAQCEKE 310 320 330 340 350 360 MLP1_Y CLRLSSITDEADEDNENLSAKSSSDFIFLKKQLIKERRTKEHLQNQIETFIVELEHKVPI 370 380 390 400 410 420 MLP1_Y INSFKERTDMLENELNNAALLLEHTSNEKNAKVKELNAKNQKLVECENDLQTLTKQRLDL 430 440 450 460 470 480 MLP1_Y CRQIQYLLITNSVSNDSKGPLRKEEIQFIQNIMQEDDSTITESDSQKVVTERLVEFKNII 490 500 510 520 530 540 MLP1_Y QLQEKNAELLKVVRNLADKLESKEKKSKQSLQKIESETVNEAKEAIITLKSEKMDLESRI 550 560 570 580 590 600 MLP1_Y EELQKELEELKTSVPNEDASYSNVTIKQLTETKRDLESQVQDLQTRISQITRESTENMSL 610 620 630 640 650 660 MLP1_Y LNKEIQDLYDSKSDISIKLGKEKSSRILAEERFKLLSNTLDLTKAENDQLRKRFDYLQNT 670 680 690 700 710 720 MLP1_Y ILKQDSKTHETLNEYVSCKSKLSIVETELLNLKEEQKLRVHLEKNLKQELNKLSPEKDSL 730 740 750 760 770 780 10 20 30 MTE17. MEVFSDQKAVQVLENKLVGL---TSCWQNAYSYLLAGCKET : :: .. ::. : : :: :. . .. :. MLP1_Y RIMVTQLQTLQKEREDLLEETRKSCQKKIDELEDALSELKKETS--QKDH-HI----KQL 790 800 810 820 830 40 50 60 70 80 90 MTE17. IATEEKRKRFAWYLSDCFIKDSGRPAFPTCKD-ESVMMSCLKKLDDHE---HKIY-L--- :.. . . :: . :. :. :: :::. : .: : : .:. : MLP1_Y --EEDNNSNIEWYQNK--IE-----ALK--KDYESVITSVDSKQTDIEKLQYKVKSLEKE 840 850 860 870 880 100 110 120 130 140 MTE17. ---DFL-LET-NTICQQLQSNAFKNEIERL-VNELKNT-AQYTEDKLDILESKSDALIQT : . :.: :.. . ........:.:. .: : .. .: : : :. :. :..: :: MLP1_Y IEEDKIRLHTYNVMDETINDDSLRKELEKSKIN-LTDAYSQIKEYK-DLYETTSQSLQQT 890 900 910 920 930 940 150 160 170 180 190 200 MTE17. SSMIHDSLGSLDVRVQNVASVTNTLETSVSGLSQQTVEISQE---QKNIAESQLALRDGQ .: . .:. .. ...:... ..:: ..: :..: ....: ::. :.. : : . MLP1_Y NSKLDESFKDFTNQIKNLTDEKTSLEDKISLLKEQMFNLNNELDLQKKGMEKEKA--DFK 950 960 970 980 990 210 220 230 240 250 MTE17. VKMKETLKDGMDMFLDAYTNIQEG-VDKLKSDTEQIEVEISVLGNNLSTKMIDLQSTTDD ... :... . ..: . :. ..:...: .: . .. :: .::. .: MLP1_Y KRIS-ILQNN-NKEVEAVKSEYESKLSKIQNDLDQQTIYANTAQNNYEQ---ELQKHAD- 1000 1010 1020 1030 1040 1050 260 270 280 290 300 310 MTE17. IGTKTRSSLDKQQKLLDGQTVALDGIQFLTRFQSE-ALQESRNTL--QR--LKE---FSQ . .:: : : .: . ::. .:. :.: : : ::.:.... :. : : .:. MLP1_Y V-SKTISELREQLHTYKGQVKTLN----LSRDQLENALKENEKSWSSQKESLLEQLDLSN 1060 1070 1080 1090 1100 320 330 340 MTE17. EQQEDLAKRQEKL---Q-EVH---DHLFENS----------------KSMLEAQVAFEAK . :::.. :.:: : ... :. .:: ...:...:. . MLP1_Y SRIEDLSS-QNKLLYDQIQIYTAADKEVNNSTNGPGLNNILITLRRERDILDTKVTVAER 1110 1120 1130 1140 1150 1160 350 360 370 380 390 400 MTE17. QANMF---VAL-DKLFALHNAML-LE-SRVIKAFVIYFLSIFVIY--MFTSTKQTYIIRP .:.:. ..: : :..: :. ::: : ::. . .. . .: ..: MLP1_Y DAKMLRQKISLMD--VELQDARTKLDNSRVEKE---NHSSIIQQHDDIMEKLNQLNLLRE 1170 1180 1190 1200 1210 1220 410 420 430 440 450 MTE17. RLYIGLCVTLALEVASLRYVNDTER--QAWMINLIRSLFALLASAQLLHAALSY----RD .:: : :. :. .. :. . .: ... : . : .: .::.: .. MLP1_Y S-----NITLRNE---LENNNNKKKELQSELDKLKQNV-APIES-EL--TALKYSMQEKE 1230 1240 1250 1260 460 470 480 490 500 510 MTE17. YEV-LNHQILLRLVDKVNDMQSKKE-LSY-D-EDTESEVDWTSWVDTDLTDDDDNLADPD :. : .. . : . .:. :.: :: : : :::.. . . .: . . . :. . MLP1_Y QELKLAKEEVHRWKKRSQDILEKHEQLSSSDYEKLESEIE--N-LKEELENKERQGAEAE 1270 1280 1290 1300 1310 1320 520 530 MTE17. YKIPLL-------IKDNPVTTSSLTRRLYNFRPR :. : .: . .. .:::... ..: MLP1_Y EKFNRLRRQAQERLKTSKLSQDSLTEQVNSLRDAKNVLENSLSEANARIEELQNAKVAQG 1330 1340 1350 1360 1370 1380 MLP1_Y NNQLEAIRKLQEDAEKASRELQAKLEESTTSYESTINGLNEEITTLKEEIEKQRQIQQQL 1390 1400 1410 1420 1430 1440 MLP1_Y QATSANEQNDLSNIVESMKKSFEEDKIKFIKEKTQEVNEKILEAQERLNQPSNINMEEIK 1450 1460 1470 1480 1490 1500 MLP1_Y KKWESEHEQEVSQKIREAEEALKKRIRLPTEEKINKIIERKKEELEKEFEEKVEERIKSM 1510 1520 1530 1540 1550 1560 MLP1_Y EQSGEIDVVLRKQLEAKVQEKQKELENEYNKKLQEELKDVPHSSHISDDERDKLRAEIES 1570 1580 1590 1600 1610 1620 MLP1_Y RLREEFNNELQAIKKKSFDEGKQQAMMKTTLLERKLAKMESQLSETKQSAESPPKSVNNV 1630 1640 1650 1660 1670 1680 MLP1_Y QNPLLGLPRKIEENSNSPFNPLLSGEKLLKLNSKSSSGGFNPFTSPSPNKHLQNDNDKRE 1690 1700 1710 1720 1730 1740 MLP1_Y SLANKTDPPTHLEPSFNIPASRGLISSSSTLSTDTNDEELTSNNPAQKDSSNRNVQSEED 1750 1760 1770 1780 1790 1800 MLP1_Y TEKKKEGEPVKRGEAIEEQTKSNKRPIDEVGELKNDEDDTTENINESKKIKTEDEEEKET 1810 1820 1830 1840 1850 1860 MLP1_Y DKVNDENSI 1870 Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:00