SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MSN9.14 (Universal genetic code) : 709 aa
 vs  library
 searching i49127 library

    594 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
I49127, 594 bases, 881 checksum.                   (594) 914

>>I49127, 594 bases, 881 checksum.                   (594 aa)
Smith-Waterman score: 914;   33.279% identity in 613 aa overlap

               10        20        30        40        50        60
MSN9.1 MASINFFKDAGEVVRVRLFVTAKRIHRCYGLVDFASANEAKKVLYKKNGEYLHDYKIFLY

               70        80        90       100       110       120
MSN9.1 VYSRRPQPPRRPRPPGLNYNDYLQRESLPIEENETPSDFVEVQPCREALSRANTLGCYIQ

              130       140       150       160       170          
MSN9.1 AVAVRKKTLFVSRLSPEAQISDIINFFKDVGQVVHVRLIVDYTGEHVGDGFVEFASAN-E
                                                             :.::  
I49127                            MQSAPLEQPAKRPRCDGSPRTPPSTPPATANLS
                                          10        20        30   

     180       190           200       210         220       230   
MSN9.1 AEKRRCFSREDLRA----AINRFPRRRKKGFINTIIWFWAYVLE--RPPFKIAFSILVVV
       :.    :.  :::.     .  : . :  :: .        ::.  :   ::: :.:   
I49127 ADDD--FQNTDLRTWEPEDVCSFLENR--GFRE------KKVLDIFRDN-KIAGSFL---
              40        50          60              70             

           240          250       260       270       280          
MSN9.1 PISVSLNVTASRRR---VSEFDVKFQLMGAYCDENLSSLPVFSSGAPANELRFSKHVY-D
       :.   :.   .: .   :: .. . ...   : ..::     .:     .. . : :. :
I49127 PF---LD--EDRLEDLGVSSLEERKKMI--ECIQQLS-----QS-----RIDLMK-VFND
      80             90       100              110             120 

     290       300       310       320       330       340         
MSN9.1 NVHGNIYLDPLCLKFIDTEQFQRLRELKQLGVTNMVYPGAVHSRFEHSLGVYWLAGETAQ
        .::.: . :: ...::: :::::: .::::   .:.::: :.:::::::: .:::  ..
I49127 PIHGHIEFHPLLIRIIDTPQFQRLRYIKQLGGGYYVFPGASHNRFEHSLGVGYLAGCLVR
             130       140       150       160       170       180 

     350       360       370       380       390       400         
MSN9.1 RLKNFQGMELGIDNYDLQTVRLAGLLHDIGHGPFSHMFEREFLPKVISDCQWSHELMSVN
        : . :  :: :.. :.  :..::: ::.:::::::::. .:.:..  . .:.::  :..
I49127 ALAEKQP-ELQISERDILCVQIAGLCHDLGHGPFSHMFDGRFIPRARPEKKWKHEQGSIE
              190       200       210       220       230       240

     410       420               430         440            450    
MSN9.1 MIDHMVDTHHIDI---DAQMLKR-----VKDMILAS--TEFSQ-L---KGN-AEKRFLYD
       :..:.:..... .   .  .. .     .:..:..   :  .. :   ::  : : :::.
I49127 MFEHLVNSNELKLVMKNYGLVPEEDITFIKEQIMGPPITPVKDSLWPYKGRPATKSFLYE
              250       260       270       280       290       300

          460       470                       480               490
MSN9.1 IVANGRNGIDVDKLTETMR------VLDN----------EIC---FRAKE---YL-SV-H
       ::.: ::::::::     :      . .:          .::   ...::   :. .: :
I49127 IVSNKRNGIDVDKWDYFARDCHHLGIQNNFDYKRFIKFARICEVEYKVKEDKTYIRKVKH
              310       320       330       340       350       360

                          500       510        520                 
MSN9.1 -----K-------LFATRADLYRTVYTHSKVKA-IELMIVDAMVKANNHLEI--------
            :       .: ::  :.: .: : :..  :..::.::..::. ..::        
I49127 ICSREKEVGNLYDMFHTRNCLHRRAYQH-KISNLIDIMITDAFLKADPYVEITGTAGKKF
              370       380        390       400       410         

       530       540       550         560        570       580    
MSN9.1 --SSMINDPSEYWKLDDTILKTIEI--APDPELAEAKELILR-VRRRQLYQFCNEYAVPK
         :. :.:   . :: :.:.  .:.  . ::.:.::.  ::: .. :.::.. .: . ::
I49127 RISTAIDDMEAFTKLTDNIF--LEVLHSTDPQLSEAQS-ILRNIECRNLYKYLGE-TQPK
     420       430         440       450        460       470      

             590       600         610       620         630       
MSN9.1 -DKI--DHFKAVTPQDIICSQ--KHTSLTLKEEDIAVTNVKIDLARGRE--NPLECINFY
        .::  .... . ::..  ..  :  .. :: ::. :  ...:   : :  ::.. ..::
I49127 REKIRKEEYERL-PQEVAKAKPEKAPDVELKAEDFIVDVINVDY--GMEDKNPIDRVHFY
         480        490       500       510         520       530  

       640       650       660       670         680       690     
MSN9.1 KDYDSAEKFVIPEDRVSHLLPTTYQDMIVRVYAKKPE--LVEAVSEAFENFQMRTYGIKA
          .: .   : ...::.:::  . ....::: :: .   ..:  ::. .       . :
I49127 CKSNSKQAVRINKEQVSQLLPEKFAEQLIRVYCKKKDGKSLDA-REALCSV------VCA
            540       550       560       570        580           

           700         
MSN9.1 Q-VH-ATPEKKKRRVM
       : .: ::         
I49127 QGLHQATGW       
         590           

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