SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MRG7.14 (Universal genetic code) : 849 aa vs library searching spac1b34 library 630 residues in 1 sequences The best scores are: s-w SPAC1B34, 630 bases, E69 checksum. (630)1041 >>SPAC1B34, 630 bases, E69 checksum. (630 aa) Smith-Waterman score: 1041; 31.370% identity in 832 aa overlap 10 20 30 40 50 60 MRG7.1 MGASRKLQGEIDRVLKKVQEGVDVFDSIWNKVYDTDNVNQKEKFEADLKKEIKKLQRYRD : . .:: ...:. ...:.::::.:.::: .:::::: :: SPAC1B MIAFYLHLEKIAIFDEVYEKLSASNSVSQKEKLEGDLKTQIKKLQRLRD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 MRG7.1 QIKTWIQSSEIKDKKVSASYEQSLVDARKLIEKEMERFKICEKETKTKAFSKEGLGQQPK ::::: .:..::::: .:.. :.::: .::.:: :.: : ::::::::. : SPAC1B QIKTWASSNDIKDKK-------ALLENRRLIEAKMEEFKAVEREMKIKAFSKEGLSIASK 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 MRG7.1 TDPKEKAKSETRDWLNNVVSELESQIDSFEAELEGL--SVKKGKTRPPRLTHL---ETSI ::::: :..: .:..:.: ::: : . .::: :.: . :.:: .:.:: :. : SPAC1B LDPKEKEKQDTIQWISNAVEELERQAELIEAEAESLKATFKRGKKDLSKLSHLSELESRI 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 MRG7.1 TRHKDHIIKLELILRLLDNDELSPEQVNDVK-DFLDDYVERNQ-DDFDEFSDVDELYSTL ::: : :::::.: :.:...::: :::.. :.. ::: .: .:: : : ..::. : SPAC1B ERHKWHQDKLELIMRRLENSQISPEAVNDIQEDIMY-YVECSQSEDFAE--D-ENLYDEL 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 MRG7.1 PLDEVEGLEDLVTAGPLVKSISLPTHHQEKTEDTSLPDSSAEMVPKTPPPKNGAGLHSAP ::: : : : . :.. .: ::. :: : SPAC1B NLDE---------A-----SAS---YDAERSGRSS---SSS---------------HS-P 220 230 240 300 310 320 330 340 350 MRG7.1 STPAGGRPSLNVPAGNVSNTSVTLSTSIPTQTSIESMGSLSPVAAKEE-DATT-LPSRKP : :: :.. :.. :. . .. .. . .:.. .: :: :: : . SPAC1B S------PS----ASSSSSSENLLQDKAEAEEKVSADASVQDIAEKESLDADKELATNDQ 250 260 270 280 290 360 370 380 390 400 410 MRG7.1 PSSVADTPLRGIGRVGIPNQPQPSQPPSPIPANGSRISATSAAEVAKRNIMGVESNVQPL . : :: . .: .: : : : : : .:.:: SPAC1B ED---DEE---------ENQAE-TQK------DG----AISNNE----N-M--QSEVQT- 300 310 320 420 430 440 450 460 470 MRG7.1 TSPLSKMVLPPTAKGNDGTASDSNPGDVAASIGRAFSPSIVSGSQWRPGSPFQSQNETVR :.: .:: : :. .: . :... : :..:.. .: : SPAC1B TNP---------------SASTSA---VT-NITK---PTLI---Q-NPSTPLSVSNSKV- 330 340 350 480 490 500 510 520 530 MRG7.1 GRTEIAPDQREKFLQRLQQVQQGHGNLLGIPSLSGGNEKQFSSQQQNPLLQQSSSISPHG . : .:. : :.. : ...: .. . . SPAC1B ASPE-TPNAT-------------HTA----PKV----EMRYAS----------AAAAAAA 360 370 380 540 550 560 570 580 590 MRG7.1 SLGIGVQAPGFNVMSSASLQQQSNAMSQQLGQQPSVADLLEPQFLDSSIESTDKNI-SKI .:. ..:. . . : ::. .: . . :. :.:.. : :: SPAC1B ALAK--ESPSHHYI-----------M-QQV--RPETPN--SPR-LNSTV------IQSK- 390 400 410 600 610 620 630 640 MRG7.1 KGFVFDVCADVDHVRNDD-QSQQNLPDDSASIAASKAIQSEDDSKVLFDTPI-DFKADKK .: .. :. . :.: : :.. :.: .: . : : . .:: SPAC1B ----WD---SLGHTASPKMQTQ---P--VRSVSQSSAT-TETNVK-----PTKEENAD-- 420 430 440 450 650 660 670 680 690 700 MRG7.1 LLSLLVLSGMPSYMLDPVQVSSGPDFSPGQPIQPGQSSSSLGVIGRRSNSELGAIGDPSA : : ::: ::. .. . ..:.. ...... ::: : SPAC1B -----V----P--------VSS-PDY-----LK--DLVNALNT-SKEQHK--GAI-DKE- 460 470 480 710 720 730 740 750 760 MRG7.1 VGPMHDQMHNLQMLEAAFYKRPQPSDSERPRPYSPRNPAITPQTFPQTQAPIINNPLLWE . . . :. . : :. .:. .:. : :..: .:. .:: :.... . : SPAC1B --KLTEAL-NI----SCVYV-PDATDAAKPQYYIPKDPYPVPHYYPQQPLPLFDSSEMTE 490 500 510 520 530 770 780 790 800 810 820 MRG7.1 RLGSDAYGTDTLFFAFYYQQNSYQQYLAAKELKKQSWRYHRKFNTWFQRHKEPKIATDEY : : ::::. :::. ..::::.:..::::::::.:.:..::::::.:::. :::. SPAC1B -L-VDP---DTLFYMFYYRPGTYQQYIAGQELKKQSWRFHKKYTTWFQRHEEPKMITDEF 540 550 560 570 580 590 830 840 MRG7.1 EQGAYVYFDFQTPKDENQEGG :.:.: ::::. SPAC1B ESGSYRYFDFEGDWVQRKKADFRFTYQYLEDDDDWTR 600 610 620 630 Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:03