SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MRG7.13 (Universal genetic code) : 488 aa
 vs  library
 searching atfca83 library

    502 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
ATFCA83, 502 bases, 24A checksum.                  (502)1509

>>ATFCA83, 502 bases, 24A checksum.                  (502 aa)
Smith-Waterman score: 1509;   46.061% identity in 495 aa overlap

                                    10         20         30       
MRG7.1                      MSNRRKQSTTAGIFL-CITIVSLLSGDV-SALGVNWGTM
                             :. .:... .:. :  .... :.: .: ::.::::::.
ATFCA8 MQSVYKNKAVTFKKLLSLHPRESSVKKMGSGVGVALFALSLL-LVSHEVESAIGVNWGTL
               10        20        30        40         50         

        40        50        60        70        80        90       
MRG7.1 STHQLPPKTVVQMLKDNNVKKVKLFDADTNTMVALAGSGIEVMVAIPNDQLKAMGSYNRA
       : :.. :.:::..:: :.. :::::::. ... :: :.::.::..:::..:   ...:  
ATFCA8 SFHKMRPSTVVDLLKANKITKVKLFDANPDALRALMGTGIQVMIGIPNEML---STFN--
      60        70        80        90       100       110         

        100         110       120       130       140       150    
MRG7.1 KD-WVRRNITRF--NDDVKIKYVAVGNEPFLTAYNGSFINLTYPALFNIQKALNEAGVGD
       .: .:..:..::  .. . :.:::::::::::.:.:.: : . :.. :.:..: .:....
ATFCA8 SDLFVQQNLSRFIGKNGADIRYVAVGNEPFLTGYGGQFQNYVVPTMVNLQQSLVRANLAS
          120       130       140       150       160       170    

          160       170       180       190       200       210    
MRG7.1 FIKATVPLNADVYNSPLENPVPSAGSFRQDIFEEMKLIVNFLAHNKAPFTVNIYPFLSLY
       ..: .:: :::.:.:   : ::: : :: .. . :  .:.::  : .::.::::::::::
ATFCA8 YVKLVVPCNADAYQS---N-VPSQGMFRPELTQIMTQLVSFLNSNGSPFVVNIYPFLSLY
          180          190        200       210       220       230

          220       230        240       250       260       270   
MRG7.1 LSSDFPFDYAFFNGQN-TVSDNGVIYTNVFDANFDTLLASLKALGHGDMTVIVGEVGWPT
        .:::: :::::.:..  : :.   : :.::.:::::.:.:  ::.:.: ...::.::::
ATFCA8 GNSDFPQDYAFFEGSSHPVPDGPNTYYNAFDGNFDTLVAALTKLGYGQMPIVIGEIGWPT
              240       250       260       270       280       290

           280       290       300         310       320       330 
MRG7.1 DGDKNANIPNAERFYTGLLPKLAANRGTPMRPGY--IEVYLFGFIDEDAKSIAPGNFERH
       ::  .::.  :. :  ::. .. .:.:::.:::    .:::::..:: :::  :::::::
ATFCA8 DGAVGANLTAARVFNQGLISHVLSNKGTPLRPGSPPADVYLFGLLDEGAKSTLPGNFERH
              300       310       320       330       340       350

             340       350       360       370       380       390 
MRG7.1 WGIFKYDGQPKFPADLSGAGQKKILTGAQNVQYLRNQWCMFNPNALTFSNNTNQLGDNVN
       ::::..::: :.  .: : :..  : .:.::::: ..::. .:     : . .:.::.. 
ATFCA8 WGIFSFDGQAKYRLNL-GLGNRG-LKNAKNVQYLPSRWCVAHP-----SRDMTQVGDHLR
              360        370        380       390            400   

             400       410       420       430       440       450 
MRG7.1 YACTFSDCTALGYGSSCGNLDEVGNASYAFNMYFQVQNQKAEACDFEGLAIITTRNISRE
        ::. .:::.:. :.::..: :  : ::::: :.:.: :. ..:::.::...:  . :  
ATFCA8 LACSEADCTTLNDGGSCSQLGEKDNISYAFNSYYQMQMQHEKSCDFDGLGMVTFLDPSVG
           410       420       430       440       450       460   

             460        470       480          
MRG7.1 QCNFPIQIGD-PTSGHSDHNHRFISFSLVSM-LLLFTAL 
       .: : . . :   :. ..   :. :.  . . ::..:   
ATFCA8 DCRFLVGVTDIGLSSSTEPMARW-SIYHICIGLLIWTLTM
           470       480        490       500  

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