SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MRA19.13 (Universal genetic code) : 512 aa
 vs  library
 searching ac00229230 library

    588 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
AC00229230, 588 bases, 1C24 checksum.              (588)1747

>>AC00229230, 588 bases, 1C24 checksum.              (588 aa)
Smith-Waterman score: 1747;   54.426% identity in 531 aa overlap

                  10        20        30        40        50       
MRA19. ME-ISLM--KFLFLGIWVYYYSVLDSVSAMDSLLSPKGVNYEVAALMSVKNKMKDEKEVL
       :: . ..  .. :: ..:.....  : ::    ::: ::::::.::..:::...:  .::
AC0022 MEGVRFVVWRLGFL-VFVWFFDI--S-SAT---LSPTGVNYEVTALVAVKNELNDPYKVL
               10         20              30        40        50   

        60        70        80        90       100       110       
MRA19. SGWDINSVDPCTWNMVGCSSEGFVVSLLLQNNQLTGPIPSELGQLSELETLDLSGNRFSG
        .::.::::::.: ::.:. .:.: ::.:::: .:::::  .:.: .:..::::.: :.:
AC0022 ENWDVNSVDPCSWRMVSCT-DGYVSSLVLQNNAITGPIPETIGRLEKLQSLDLSNNSFTG
            60        70         80        90       100       110  

       120       130       140       150        160       170      
MRA19. EIPASLGFLTHLNYLIVGNAFLCGPASQELCSDA-TPVRNGMLLRKFFAKLYLKHGFVYL
       ::::::: : .:::: ..:  : :      : .. . .. :. :  .   :    :   .
AC0022 EIPASLGELKNLNYLRLNNNSLIGT-----CPESLSKIE-GLTLVVIGNALIC--GPKAV
            120       130            140        150         160    

        180                  190       200       210          220  
MRA19. TSCNRSAA----T----GLSE---KDNSKHHSLVLSFAFGIVVAFII---SLMFLFFWVL
       ..:  ::.    :    : .:   . :. :: ..:.:: .. .::..   : :::  :  
AC0022 SNC--SAVPEPLTLPQDGPDESGTRTNG-HH-VALAFAASFSAAFFVFFTSGMFL--W--
            170       180       190         200       210          

            230       240       250       260       270       280  
MRA19. WHRSRLSRSHGTYLIVSLCLSYTIYVKTLLKSALLFMDFLVQQDYEFEIGHLKRFSFREI
       : : :  :.                     :.  .:.:   : : :  .:::::..:.:.
AC0022 W-RYR--RN---------------------KQ--IFFDVNEQYDPEVSLGHLKRYTFKEL
         220                                230       240       250

            290       300       310       320        330       340 
MRA19. QTATSNFSPKNILGQGGFGMVYKGYLPNGTVVAVKRLKD-PIYTGEVQFQTEVEMIGLAV
       ..::..:. :::::.::.:.::::.: .::.::::::::  :  :::::::::: :.::.
AC0022 RSATNHFNSKNILGRGGYGIVYKGHLNDGTLVAVKRLKDCNIAGGEVQFQTEVETISLAL
              260       270       280       290       300       310

             350       360       370        380       390       400
MRA19. HRNLLRLFGFCMTPEERMLVYPYMPNGSVADRLRDNY-GEKPSLDWNRRISIALGAARGL
       ::::::: ::: . .::.::::::::::::.::.::  :: :.:::.:: .::.:.::::
AC0022 HRNLLRLRGFCSSNQERILVYPYMPNGSVASRLKDNIRGE-PALDWSRRKKIAVGTARGL
              320       330       340       350        360         

              410       420       430       440       450       460
MRA19. VYLHEQCNPKIIHRDVKAANILLDESFEAIVGDFGLAKLLDQRDSHVTTAVRGTIGHIAP
       :::::::.:::::::::::::::::.:::.:::::::::::.::::::::::::.:::::
AC0022 VYLHEQCDPKIIHRDVKAANILLDEDFEAVVGDFGLAKLLDHRDSHVTTAVRGTVGHIAP
     370       380       390       400       410       420         

              470       480       490       500       510          
MRA19. EYLSTGQSSEKTDVFGFGVLILELITGHKMIDQGNGQVRKGMILSWVSKKIL        
       ::::::::::::::::::.:.::::::.: .: : .  .::..:.:: ::.         
AC0022 EYLSTGQSSEKTDVFGFGILLLELITGQKALDFGRSAHQKGVMLDWV-KKLHQEGKLKQL
     430       440       450       460       470        480        

AC0022 IDKDLNDKFDRVELEEIVQVALLCTQFNPSHRPKMSEVMKMLEGDGLAERWEATQNGTGE
      490       500       510       520       530       540        

AC0022 HQPPPLPPGMVSSSPRVRYYSDYIQESSLVVEAIELSGPR
      550       560       570       580        

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