SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MQN23.12 (Universal genetic code) : 571 aa
 vs  library
 searching dcu93048 library

    553 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
DCU93048, 553 bases, 43B checksum.                 (553)1784

>>DCU93048, 553 bases, 43B checksum.                 (553 aa)
Smith-Waterman score: 1784;   54.982% identity in 542 aa overlap

               10        20        30        40        50        60
MQN23. MALLIITALVFSSLWSSVSPDAQGDALFALRSSLRASPEQLSDWNQNQVDPCTWSQVICD
                                                                : .
DCU930                    MNRNSINILNYMQFTDAYLDKYGVLMTLELYSNNISGPIPS
                                  10        20        30        40 

                70          80        90       100       110       
MQN23. DKKHVTS-VTLS-YMN-FSSGTLSSGIGILTTLKTLTLKGNGIMGGIPESIGNLSSLTSL
       :  ..:. :.:. ::: :: : . . .: :: :. : :..:.. : :: :. :...:  :
DCU930 DLGNLTNLVSLDLYMNSFS-GPIPDTLGKLTRLRFLRLNNNSLSGPIPMSLTNITTLQVL
              50        60         70        80        90       100

       120       130       140           150                   160 
MQN23. DLEDNHLTDRIPSTLGNLKNLQFF---FTANNLS-CG--------GT--F--PQPCVTES
       :: .:.:.  .:.. :.. .: :    : ::::. ::        :.  :  : : .  :
DCU930 DLSNNRLSGPVPDN-GSF-SL-FTPISF-ANNLNLCGPVTGRPCPGSPPFSPPPPFIPPS
              110          120        130       140       150      

               170        180           190       200       210    
MQN23. S--PSGDSSSRKTGIIAG-VVSGIAVIL----LGFFFFFFCKDKHKGYKRDVFVDVAGTN
       .  : :...   :: ::: :..: :...    ..: ..   . ..:   :. : :: .  
DCU930 TVQPPGQNGP--TGAIAGGVAAGAALLFAAPAMAFAWW---R-RRK--PREHFFDVPA--
        160         170       180       190             200        

          220       230       240       250       260       270    
MQN23. FKKGLISGEVDRRIAFGQLRRFAWRELQLATDEFSEKNVLGQGGFGKVYKGLLSDGTKVA
               : : .. .:::.::. ::::.::: ::  ..::.::::::::: :.::. ::
DCU930 --------EEDPEVHLGQLKRFSLRELQVATDTFS--TILGRGGFGKVYKGRLADGSLVA
                210       220       230         240       250      

          280        290       300       310       320       330   
MQN23. VKRLTDFER-PGGDEAFQREVEMISVAVHRNLLRLIGFCTTQTERLLVYPFMQNLSVAYC
       :::: . :: :::.  :: ::::::.::::::::: ::: : ::::::::.: : ::: :
DCU930 VKRLKE-ERTPGGELQFQTEVEMISMAVHRNLLRLRGFCMTPTERLLVYPYMANGSVASC
        260        270       280       290       300       310     

           340       350       360       370       380       390   
MQN23. LREIKPGDPVLDWFRRKQIALGAARGLEYLHEHCNPKIIHRDVKAANVLLDEDFEAVVGD
       ::: .:..: :::  ::.::::.:::: :::.::.::::::::::::.::::.:::::::
DCU930 LRERQPSEPPLDWPTRKRIALGSARGLSYLHDHCDPKIIHRDVKAANILLDEEFEAVVGD
         320       330       340       350       360       370     

           400       410       420       430       440       450   
MQN23. FGLAKLVDVRRTNVTTQVRGTMGHIAPECISTGKSSEKTDVFGYGIMLLELVTGQRAIDF
       ::::.:.: . :.::: ::::.:.:::: .:::::::::::::::::::::.:::::.:.
DCU930 FGLARLMDYKDTHVTTAVRGTLGYIAPEYLSTGKSSEKTDVFGYGIMLLELITGQRAFDL
         380       390       400       410       420       430     

           460       470       480       490       500       510   
MQN23. SRLEEEDDVLLLDHVKKLEREKRLEDIVDKKLDEDYIKEEVEMMIQVALLCTQAAPEERP
       .:: ..:::.::: ::.: .::.:: .::  :...::  :::..:::::::::..: :::
DCU930 ARLANDDDVMLLDWVKSLLKEKKLEMLVDPDLENNYIDTEVEQLIQVALLCTQGSPMERP
         440       450       460       470       480       490     

           520       530       540        550       560       570 
MQN23. AMSEVVRMLEGEGLAERWEEWQNLEVTRQE-EFQRLQRRFDWGEDSINNQDAIELSGGR
        ::::::::::.::::.:.:::..:: .:. :.   .:  .:  :: .:  :.:::: :
DCU930 KMSEVVRMLEGDGLAEKWDEWQKVEVIHQDVELAP-HRTSEWILDSTDNLHAFELSGPR
         500       510       520       530        540       550   

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