SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MPI7.P1 (Universal genetic code) : 492 aa
 vs  library
 searching f7g1916 library

    546 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
F7G1916, 546 bases, 205A checksum.                 (546) 902

>>F7G1916, 546 bases, 205A checksum.                 (546 aa)
Smith-Waterman score: 902;   35.674% identity in 527 aa overlap

F7G191 MELISSSTIGNSALCLTLISILIFFFLTTTTIPTFPDHPLRSLLDDSQITTNSSSIVNPK
               10        20        30        40        50        60

                       10          20           30        40       
MPI7.P   CASQ------GFFDYLSFLYCNF-EG-F---PILGQFLLFLWLLLLFYLLGHTASEYF
         :.:.      : ..:.:. :: : :. :   :::.  ::   .:: ::.: .::. .:
F7G191 SSCVSSRSHDNGGVINYFSLHYCIFNENLFFSIPILS--LL---ILLHFYILIKTAQTHF
               70        80        90            100       110     

        50         60        70        80        90       100      
MPI7.P CSSLES-LSKLLNLSPTVAGVTLLSLGNGAPDLFASLVSFMGESKGTYDVGLNTVVGGSG
        :.. . :.  :::::..:.::::.:::::::.:::.... :   : : .:........ 
F7G191 -STVTTKLADRLNLSPSMAAVTLLALGNGAPDVFASVAALRG---GQYRTGFGAILSAGT
          120       130       140       150          160       170 

        110       120       130       140       150          160   
MPI7.P FVTCVVVGIISISLHKRRVRIERAAFIRDICFFCAAIGSLALILVY--GKINF-WGALGF
       ::.  :::...:  .     .. :.:.::. :.   :..: :. ::  :.: : : :.::
F7G191 FVSAFVVGFVAI--YAAPFPVDAASFVRDVLFYL--IAALFLFYVYLSGEI-FVWQAIGF
             180         190       200         210        220      

           170       180       190        200       210            
MPI7.P CSLYAVYVAFVVLSWRFGGDQGAESDLESIHKRG-SLSEPILQRDGLE----EIEDGVVN
        ..:  .:.::   :    : :  ...:    .: :.::   ..: :.    ::  : . 
F7G191 VGFYIFFVGFVF--WM---DFG--TNVE----KGKSISEE--EKDLLRLQDCEIAAGSL-
        230         240                250         260       270   

      220       230             240       250       260       270  
MPI7.P GEHQIVDDDDDHQ-----RYY-YWKRLVIWAITLPLNLPRILTIPVVSEDKWSKPLAVAS
       : ..    . .::     : :   .:.  :  : :...   ::::  : ..::.    :.
F7G191 GSYKA---EKEHQFSGIFRLYGTISRM--WE-T-PVSVLLNLTIPKPSPSEWSRFYRSAN
               280       290           300       310       320     

             280            290           300       310       320  
MPI7.P VTFAP-VLL----SFLW-NWKRKPTSF---EAGV-VYLIGCLIGIALGFIAGATTKKLTP
       ..: : .::    ::.  :   .: ::   .. . ..:.  ..  .:.:.   :..:  :
F7G191 IVFCPFALLYTCNSFVQLN---HPISFLFPNTHLPLWLVVLFMTSSLAFLH-FTVEK-QP
         330       340          350       360       370         380

            330       340        350       360       370       380 
MPI7.P PKKWLLPWLAGGFVMSMTW-SYISAQELVALLTSLGYIFGVSPSILGLTVLAWGNSIGDL
       ::   :: .. .:.::. : : : : ::.  :..:: .. . :..:::::::::::.:::
F7G191 PKTEQLPVIVVAFIMSVFWISTI-AGELLNCLAALGTLLKLPPALLGLTVLAWGNSVGDL
              390       400        410       420       430         

             390       400       410       420       430       440 
MPI7.P ITNLTMALHDGNEGAQVAVSGCYAGPIFNTLFALGISLVGCAWEAYPLSIVIKTDPRLLE
       ......: . :   : .:..::.:::.:: : .:: .::  . ..:: .  .     .. 
F7G191 VADVAVA-KAGRP-A-MAMAGCFAGPMFNMLVGLGSALVMQTANVYPDAYKLGFHVGIVI
     440        450         460       470       480       490      

             450       460       470        480        490  
MPI7.P SLGFLVAGLVWSFLVLFSNRMRLGGVMGIGLLVIYLA-SL-SLRIMQTVGDAH
       .. ::. .:. :.::.  .:.:.    :: :. .:.: .. :: :. .:.   
F7G191 AFVFLLLSLMGSLLVITWSRFRVPRFWGICLVGLYVAFTFVSL-IIASVST  
        500       510       520       530        540        

Library scan:  0:00:00  total CPU time:  0:00:01