SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MOK9.P2 (Universal genetic code) : 1056 aa vs library searching atac00238724 library 1374 residues in 1 sequences The best scores are: s-w ATAC00238724, 1374 bases, 2224 checksum. (1374)1010 >>ATAC00238724, 1374 bases, 2224 checksum. (1374 aa) Smith-Waterman score: 1010; 26.975% identity in 1253 aa overlap 10 20 30 40 50 MOK9.P MRTLAWNCQGAGAKKTHRRLVEMNRMYSPGFFFLSETKNQKMYLQDVQV-ELGFDNLQTG :: :.:::::.: : :.: :. .: : .:: :::... ::..: : .::: .:.: ATAC00 MRILSWNCQGVGNTPTVRHLREIRGLYFPEVIFLCETKKRRNYLENV-VGHLGFFDLHTV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 MOK9.P EPEGSSGGLALLYSNEFPVKFLLLDDRLIDIETIINGNRVFMTFIFGDHVVSNREYVCER :: :.::::::.... .: : : :::: : . .. ..: :.:. : ..: . :: ATAC00 EPIGKSGGLALMWKDSVQIKVLQSDKRLIDALLIWQDKEFYLTCIYGEPVQAERGELWER 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 MOK9.P LMRIGVSRSEAWFIIGDFNEITGNHEKRGGKKRSEASFLPFRAMIHSCGLIDFPFH-GNQ : :.:.::: :.. :::::.. :: :: :.:.: : :: :..:::: . : : : ATAC00 LTRLGLSRSGPWMLTGDFNELVDPSEKIGGPARKESSCLEFRQMLNSCGLWEVN-HSGYQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 MOK9.P FSWIGKRENGKIRCRLDIAMGNEEWYNIFSHSNVEYLKMWGSDHRPLLH-LY-NQLRE-- ::: :.:.. ..:::: ...:. :...: .... ::. ::: ::.. : .. :. ATAC00 FSWYGNRNDELVQCRLDRTVANQAWMELFPQAKATYLQKICSDHSPLINNLVGDNWRKWA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 MOK9.P ------R--SRENLCLTKDGLANPGSKKQLKDGT---ELVV--R--IDPLKN-PKLTSNL : .::.. :: : : :... : .. : .. : :. : : .: . ATAC00 GFKYDKRWVQREGF---KDLLCNFWSQQSTKTNALMMEKIASCRREISKWKRVSKPSSAV 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 MOK9.P YMEEINPNKFG-D--TYETP-DEKLCQCFLGRSSGPKNIGRRLYRRRDIFVPKKPKLAGT ..:. .: : : . : :.. . :.: . :..... : .. : .: .. ATAC00 RIQEL---QFKLDAATKQIPFDRR--E--LARLK--KELSQE-YNNEEQFWQEKSRIM-- 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 MOK9.P W-----RKYKIFSCLNETKKSKK--Q---D--SRHPRS-RDLGRRHRNYGRLFQKFVFIL : :. : : ........ : : .:. : .:::: . : :.:. : ATAC00 WMRNGDRNTKYFHAATKNRRAQNRIQKLIDEEGREWTSDEDLGRVAEAY---FKKL-FAS 350 360 370 380 390 390 400 410 MOK9.P K-LGRS-----RLCP---KYLS---IGYFSHEE-----FSKKSHR----SGSARFILSK- . .: . : : .. .. ...:: :: . :. .: :. .. ATAC00 EDVGYTVEELENLTPLVSDQMNNNLLAPITKEEVQRATFSINPHKCPGPDGMNGFLYQQF 400 410 420 430 440 450 420 430 440 450 MOK9.P -SDKGRDQMG-LLFSFY-------GFGKMAI--LP--------T-WR-IFLASVF----- : ::. .. .:. :..: : .: : .: : : .:. ATAC00 WETMG-DQITEMVQAFFRSGSIEEGMNKTNICLIPKILKAEKMTDFRPISLCNVIYKVIG 460 470 480 490 500 510 460 470 480 490 500 MOK9.P -LMGS-MKPIFVLSLAKDREKCLAFV---------LLAYAMVIRLFQKSACASRGFFRTS ::.. .: :. :: .. . ::: :.:. .. : ... : :. :. . ATAC00 KLMANRLKKILP-SLISETQA--AFVKGRLISDNILIAHELLHALSSNNKC-SEEFI--A 520 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 MOK9.P PRHNLPSLQEDLNIIFLRRT--SMHF-DP-TRQIGRSLWHKRIARLKT--NGGS-SELKR . .. . . .. ::... .. : : : : . . : . : .. :: .:. ATAC00 IKTDISKAYDRVEWPFLEKAMRGLGFADHWIRLIMECV--KSV-RYQVLINGTPHGEI-- 580 590 600 610 620 560 570 580 590 MOK9.P WVSTIDGI--GCNAL-PQLH---TASLLMAIQKAAL-NHIEAF-V-KG---IQFLC---- . . :. : . : : : : :. .:.: :.: .. : .: :. : ATAC00 -IPS-RGLRQG-DPLSPYLFVICTEMLVKMLQSAEQKNQITGLKVARGAPPISHLLFADD 630 640 650 660 670 680 600 610 620 630 640 650 MOK9.P TYLLCVRKRLLTLERLRGKEKFRVFEFHVQAHMSLIFYLLMIVFFSVRPMS--KR--VK- ... : : .. : : :. .:..: . : . . :: ..:. . .: .: :: ATAC00 SMFYC--K--VNDEAL-GQ-IIRIIEEYSLASGQRVNYLKSSIYFG-KHISEERRCLVKR 690 700 710 720 730 660 670 680 690 700 MOK9.P KL-LHYPLLWGIWT---RSF----II-IHYVWGPTPCSAR-NQNN-SW--NYTRRDG-DI :: .. :.. .:: . . :. . : ... .: :. : .: ATAC00 KLGIEREGGEGVYLGLPESFQGSKVATLSYL------KDRLGKKVLGWQSNFLSPGGKEI 740 750 760 770 780 790 710 720 730 740 MOK9.P F-R------PSRENPWVKSPSLRVCERITNS-NEFLVIKIPLK--RG---K------RSP . . :. : :. .:..: . :: : : :: : : : ATAC00 LLKAVAMALPTYTMSCFKIPKT-ICQQIESVMAEFWW-KNK-KEGRGLHWKAWCHLSR-P 800 810 820 830 840 750 760 770 780 790 MOK9.P N-ITSTSSSDICNVVFSIA--SNML--QTNQCDCQLL--V-ESELRNTLDSLG-P--NLP . . . . ..: .:.:: ...: . .. : .:. : .:. . : :. : . : ATAC00 KAVGGLGFKEIE--AFNIALLGKQLWRMITEKD-SLMAKVFKSRYFSKSDPLNAPLGSRP 850 860 870 880 890 900 800 810 820 830 840 MOK9.P SIRWR-V---RIVF--G-RFSCHIGEVIMEITTIPGISTSDP-RTILSIFSARDHCLPSV :. :. . .... : : ::.: .. : : :... : .. .. :.: : : ATAC00 SFAWKSIYEAQVLIKQGIRAVIGNGETI-NVWTDPWIGAK-PAKAAQAV--KRSH-LVSQ 910 920 930 940 950 850 860 870 880 MOK9.P IWLEK-HVGWQRRSQIWDSNYWLWVWNM-HL---DS-----LDSRCPGSPR-RE-LLW-- .. :: . . :. : ::. : :. : : ::. . :. . : ATAC00 YAANSIHV--VKDLLLPDGRD--WNWNLVSLLFPDNTQENILALR-PGGKETRDRFTWEY 960 970 980 990 1000 1010 890 900 910 920 930 940 MOK9.P -REIHYTSILLTLGRSNGKWNVFGNYFPRKKLPYGNRALMSRVMDIIGPQSLAITLSNLD : :: :. .: : : :. . . ... : ...:. .: : : : .:: ATAC00 SRSGHY-SV-----KS-GYW-VMTEIINQRNNP--QEVLQPS-LDPIFQQ---IW--KLD 1020 1030 1040 1050 950 960 970 980 990 1000 MOK9.P TRPR-ELFLVLFVTTLLR---NLVLRHLRRKLGNKLRKNNTSCGNV-CQVVWLRVNDYLI . :. . :: :.. : ::. ::: :. : :: : : :: :. ATAC00 VPPKIHHFLWRCVNNCLSVASNLAYRHLARE---K------SC--VRCPSHGETVNHLLF 1060 1070 1080 1090 1100 1010 1020 1030 1040 1050 MOK9.P -VILVKIK-DV--LDV----EQKKRLLITFLNVPQLDKSGPSPISHH---PQLCFLHLHF .... . : . : . :. .. .: .. :: : .:: : . ATAC00 KCPFARLTWAISPLPAPPGGEWAESLFRNMHHVLSVHKSQPEESDHHALIPWILWRLWKN 1110 1120 1130 1140 1150 1160 MOK9.P TIIII ATAC00 RNDLVFKGREFTAPQVILKATEDMDAWNNRKEPQPQVTSSTRDRCVKWQPPSHGWVKCNT 1170 1180 1190 1200 1210 1220 ATAC00 DGAWSKDLGNCGVGWVLRNHTGRLLWLGLRALPSQQSVLETEVEALRWAVLSLSRFNYRR 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ATAC00 VIFESDSQYLVSLIQNEMDIPSLAPRIQDIRNLLRHFEEVKFQFTRREGNNVADRTARES 1290 1300 1310 1320 1330 1340 ATAC00 LSLMNYDPKMYSITPDWIKNLVDLETV 1350 1360 1370 Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:01