SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MOJ9.21 (Universal genetic code) : 456 aa
 vs  library
 searching d30622 library

    421 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
D30622, 421 bases, 17BA checksum.                  (421)1755

>>D30622, 421 bases, 17BA checksum.                  (421 aa)
Smith-Waterman score: 1755;   60.137% identity in 439 aa overlap

               10        20        30        40        50        60
MOJ9.2 MENKPSVLTERYEVGRLLGQGTFAKVYFGRSNHTNESVAIKMIDKDKVMRVGLSQQIKRE
       ::.: :::  :::::..:::::::::: .:  .:..:::::.:::.....::...:::::
D30622 MEKKGSVLMLRYEVGKFLGQGTFAKVYHARHLKTGDSVAIKVIDKERILKVGMTEQIKRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
MOJ9.2 ISVMRIAKHPNVVELYEVMATKSRIYFVIEYCKGGELFNKVAKGKLKEDVAWKYFYQLIS
       ::.::. .:::.:::.:::::::.::::.:. :::::::::. :::.:::: ::: ::. 
D30622 ISAMRLLRHPNIVELHEVMATKSKIYFVMEHVKGGELFNKVSTGKLREDVARKYFQQLVR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
MOJ9.2 AVDFCHSRGVYHRDIKPENLLLDDNDNLKVSDFGLSALADCKRQDGLLHTTCGTPAYVAP
       :::::::::: :::.::::::::.. :::.::::::::.: .:::::::::::::.: ::
D30622 AVDFCHSRGVCHRDLKPENLLLDEHGNLKISDFGLSALSDSRRQDGLLHTTCGTPTYCAP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
MOJ9.2 EVINRKGYEGTKADIWSCGVVLFVLLAGYLPFHDTNLMEMYRKIGKADFKCPSWFAPEVK
       :::.:.::.: :::.:::::.:::::::::::.:.::::.:.:::::. : :.:.:: .:
D30622 EVISRNGYDGFKADVWSCGVILFVLLAGYLPFRDSNLMELYKKIGKAEVKFPNWLAPGAK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
MOJ9.2 RLLCKMLDPNHETRITIAKIKESSWFRKGLHLKQKKMEKMEKQQVREATNPMEAGGSGQN
       ::: ..:::: .::..  :: .::::::::   :   :.. :..:.: :. ..: . : :
D30622 RLLKRILDPNPNTRVSTEKIMKSSWFRKGL---Q---EEV-KESVEEETE-VDAEAEG-N
              250       260       270              280        290  

              310       320       330         340       350        
MOJ9.2 ENGENHEPPRLATLNAFDIIALSTGFGLAGLF--GDVYDKRESRFASQKPASEIISKLVE
        ..:. :  :  .::::.::.::::: :.:::  :.  .:.: ::.:.. ::::  ::::
D30622 ASAEK-EKKRCINLNAFEIISLSTGFDLSGLFEKGE--EKEEMRFTSNREASEITEKLVE
              300       310       320         330       340        

      360       370        380       390       400       410       
MOJ9.2 VAKCLKLKIRKQGAGLFKLE-RVKEGKNGILTMDAEIFQVTPTFHLVEVKKCNGDTMEYQ
       ..: ::.:.::.     . : ::: . .. . ..::.:...:..:.: .:: .::: ::.
D30622 IGKDLKMKVRKK-----EHEWRVKMSAEATV-VEAEVFEIAPSYHMVVLKKSGGDTAEYK
      350       360            370        380       390       400  

       420       430       440       450      
MOJ9.2 KLVEEDLRPALADIVWVWQGEKEKEEQLLQDEQGEQEPS
       ....:..:::: :.: .:.                    
D30622 RVMKESIRPALIDFVLAWH                    
            410       420                     

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