SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MOJ9.14 (Universal genetic code) : 1036 aa vs library searching atac00233218 library 1039 residues in 1 sequences The best scores are: s-w ATAC00233218, 1039 bases, 1D5A checksum. (1039)1483 >>ATAC00233218, 1039 bases, 1D5A checksum. (1039 aa) Smith-Waterman score: 1483; 30.194% identity in 1083 aa overlap 10 20 30 40 50 60 MOJ9.1 MPPGAVTLDDVDLDQVSVDYVINCAKKGGMLELAEAIRDYHDHIGLPYMNSVGTADEFFL 70 80 90 100 110 MOJ9.1 ATIPESSGSPPKRAPPPIPVLISSSSPMVTNPEWCESPSAPPLMRSESFD-SPKAQELTV : :::. .:... .: ATAC00 MTHHHRRESFSVTPSTMGGSV 10 20 120 130 140 150 160 MOJ9.1 ---DDID---DF---E--DDDDLDEVGNFRISRRTA-NDAADLVPRLP-SFATGITDDDL . : : : : ::. :.. ..: :: .. . : .: .. ...: ATAC00 VLCPNTDLLWPFGKLEGLDRDDIRETA-YEIFF-TACRSSPGFGGRTALTFYSNHNSNDH 30 40 50 60 70 170 180 190 200 MOJ9.1 R-ETAFEILLACAGASG---GL-------IV--P-SKEKK----K--EKSRSRLIKKLGR . . . : . .:..: :. .: : :. :. : ..: :: .. .: ATAC00 HGDGGGGI--GSGGSTGVGSGFGSSGRKEVVTTPTSRVKRALGLKMLKRSPSRRMSTIGA 80 90 100 110 120 130 210 220 230 240 MOJ9.1 K---SESVSQS--QSSSGLVS----LL--------------EMMRGQMEISEAMDIRTRQ . :.: . .::.: .: .: :.:: ::...: : : :. ATAC00 AGGAATSLSPGGMNSSAGHISPGAGFLTVQPSRPRRPLTSAEIMRQQMKVTEQSDSRLRK 140 150 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 MOJ9.1 GLLNALAGKVGKRMDSLLVPLELLCCVSRTEFSDKKAYLRWQKRQLNMLAEGLINNPVVG :: .:.:..:.: .....::::: .. .::.: . : ::.:::..: ::. .: . ATAC00 TLLRTLVGQTGRRAETIILPLELLRHLKTSEFGDIHEYQLWQRRQLKVLEAGLLLHPSIP 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 MOJ9.1 FGESGRKATDLKSLLLRIEESESLPSSAGEVQRAECLKSLREVAISLAERPARGDLTGEV . ... : :. . ...::. : ..... .. ...: .:..::. : . :. : .: ATAC00 LDKTNNFAMRLREV---VRQSETKPIDTSKT--SDTMRTLTNVVVSLSWRGTNGNPT-DV 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 MOJ9.1 CHWADGYHLNVRLYEKLLLCVFDILNDGKLT-EEVEEILELLKSTWRVLGITETIHYTCY ::::::: ::..:: :: .::. : :. .:..:.:::.:.:: .::::. :: :. ATAC00 CHWADGYPLNIHLYVALLQSIFDV-RDETLVLDEIDELLELMKKTWSTLGITRPIHNLCF 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 MOJ9.1 AWVLFRQYVITS--ERGLL--RHAIQQLKKIPLKEQRGPQERLHLKTLKCRVDNEEISFL .::::.:::.:: : :: ::. : .. .. .: :..: : : ATAC00 TWVLFHQYVVTSQMEPDLLGASHAM--LAEVANDAKKLDREALYVKLL-----N------ 380 390 400 410 480 490 500 510 520 MOJ9.1 ESFLSPIRSWADKQLGDYHLHFAEGSL-VMEDTVTVAMITWRLLLEE---S--------D : :. ...:..:.: .:: .: .:.. ..:. . .:. . :.: :. : : ATAC00 -STLASMQGWTEKRLLSYHDYFQRGNVGLIENLLPLALSSSRILGEDVTISQGKGQEKGD 420 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 580 MOJ9.1 RAMHSNSSDREQIESYVLSSIKNTFTRM---SLA-IDRSDRNNEHHLALL--AEETKKLM . ..:.:: .. :. :::::.:... . : : .:...: .:: :.::..: ATAC00 VKLVDHSGDR--VDYYIRSSIKNAFSKVIENTKAKIAATDEGEEAAGTLLQLAKETEELA 480 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 MOJ9.1 KKDSTIFMPILSQRHPQA--IAFSASLIHKLYGNKLKPFLDGAEHLTEDAVSVFPAADSL .. : :::.. : : .: :.:: :. ::. : .: : ...:.: :. .: .: ATAC00 LRERECFSPILKRWHSVAAGVA-SVSL-HQCYGSILMQYLAGRSFISRDTVEVLQTAGKL 540 550 560 570 580 590 640 650 660 MOJ9.1 EQYLLELMT--SV-CGEDTSGPYF-KKLIPYE---------------------------- :. :..... : : :: .: . ....::: ATAC00 EKVLVQMVAEDSEEC-ED-GGKGLVREMVPYEVDSIILRLLRQWVEEKLKAVQECLFRAK 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 MOJ9.1 ---HWDPISPQQRYGSSIVEVFRIVEETVDQFFALKVPMRSI-E-L-SALFRGIDNAFQV :.: : .. :..: :.......:.:.:: ..:. .: : : . .:... :: ATAC00 ETETWNPKSKSEPYAQSAGELMKLAKDTIDEFF--EIPI-GITEDLVHDIAEGLEQLFQE 660 670 680 690 700 730 740 750 760 770 MOJ9.1 YTNHVMEKLASKDDLVPPVPVLTRYKKETA-IKVFVKKEL-FDSKHLDERRSINI--D-- ::. : . ..... .: .: ::: .... .:.. :. ... : . . .. : ATAC00 YTTFVA-SCGARQSYIPTLPPLTRCNRDSRFVKLW-KRATPCTTSNEDLKYTTSVISDGH 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 MOJ9.1 --VPATAM----LCVQLNTLHYAVSQLSKLEDSMWLRWIAKKPREKIV--IRKSMVEKSK :.:. : ..:::::. :.. .:. .. : .:: :. :: . . . ATAC00 HPRPSTSRGTQRLYIRLNTLHFLSSHIHSLNKTLSL-----NPR--ILPATRKRY--RHR 770 780 790 800 810 830 840 850 860 870 880 MOJ9.1 SFNQKESFEGSRKDINAALDRICEFTGTKIIFCDLREPFIENLYKPNVSQSRLEGLIEAL . :.. :. . :..: ... : .. ..:: : . :.:: .:...:.. .. . ATAC00 NNNSSSYFDFTYAGIESACQHVSEVAAYRLIFLDSNSVLYESLYVGEVANARIRPALRIM 820 830 840 850 860 870 890 900 910 920 930 940 MOJ9.1 DTELGQLCSVIMEPLRDRIVTSL-----LQASLDGLLRVLLDGGASRVFHPSESKLLEED .: : :.: : :: . :: ...:....: ::: :: ::::. :. ...::: ATAC00 KQNL-TLMSAI---LADR-AQSLAMREVMKSSFEAFLMVLLAGGYSRVFYRSDHSIIEED 880 890 900 910 920 930 950 960 970 980 990 MOJ9.1 VEVLKEFFISGGDGL-PRGVVENQVARVRLVVKLHGYETRELIDDLRSRSSLEMQ-QG-- : ::. : . :.:: :. ::. .. :. :..: . :..:..:. : . : . .: ATAC00 FENLKRVFCTCGEGLIPEEVVDREAETVEGVIQLMSQPTEQLMEDF-SIVTCETSGMGMV 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 MOJ9.1 GKG-KL------G----ADTQTLVRVLCHRNDSEASQFLKKQYKIPRSHG :.: :: : .: .:..:::::::: :.:::::....:. ATAC00 GSGQKLPMPPTTGRWNRSDPNTILRVLCHRNDRVANQFLKKSFQLPKRR 1000 1010 1020 1030 Library scan: 0:00:01 total CPU time: 0:00:06