SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MNC17.14 (Universal genetic code) : 584 aa
 vs  library
 searching gnl:PID:e1188577 library

    635 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
gnl|PID|e1188577                                   (635)1614

>>gnl|PID|e1188577                                   (635 aa)
Smith-Waterman score: 1614;   44.359% identity in 647 aa overlap

               10        20           30          40         50    
MNC17. MAGVLRSLRFWMIICVQVLSLVLAQDRDE---FVYHD-FSQ-ADLHLDGMASID-DGRLH
              :.. . :    ..:.. :. ..   :.:.. :.  .:: ..:....  .: :.
gnl|PI      MFLKL-LTIFFFFFNLIF-QSSSQSLNFAYNNGFNPPTDLSIQGITTVTPNGLLK
                     10         20        30        40        50   

           60        70        80         90         100       110 
MNC17. LTNNTTKSTGHAFWKIPMNFTTSPSSSLS-FSTEFVFAIFPLLGD--GQGMAFVVAPFMD
       :::.:...:::::.  :. :  ::....: ::: :::::   ...  :.:.::::::  .
gnl|PI LTNTTVQKTGHAFYTKPIRFKDSPNGTVSSFSTSFVFAIHSQIASLSGHGIAFVVAPNAS
            60        70        80        90       100       110   

             120        130       140       150        160         
MNC17. IRYSGDAASYLGLFN-RKNDNKTENHILAVELDTNSSPEAIEDS-DNHVGIDINSIISED
       . : :. ..:.::::  .: :.: ::..::::::  : : ..:. ::::::::::. : .
gnl|PI LPY-GNPSQYIGLFNITNNGNET-NHVFAVELDTILSTE-FNDTNDNHVGIDINSLKSVQ
            120       130        140       150        160       170

     170       180         190       200        210       220      
MNC17. SANASYFSGTEG--KNISFRLASEKSILVWIDYNG-TEKLLNVTVAPVPTPKPALP----
       :. :.:..  .:  ::..  : :.: . ::.::.: :.:. .::.::    ::. :    
gnl|PI SSPAGYWD-EKGQFKNLT--LISRKPMQVWVDYDGRTNKI-DVTMAPFNEDKPTRPLVTA
               180         190       200        210       220      

                                             230              240  
MNC17. ------------YL--SS---SI---------------K-P-----RKPLLSRF--INIS
                   :.  ::   :.               : :     : : : ::    ::
gnl|PI VRDLSSVLLQDMYVGFSSATGSVLSEHYILGWSFGLNEKAPPLALSRLPKLPRFEPKRIS
        230       240       250       260       270       280      

                 250                              260          270 
MNC17. EIFN-G----TMFVGFS-----------------------GSTGTVK---SDQYILGWSF
       :... :    ..:  ::                          :  .   .: :    .:
gnl|PI EFYKIGMPLISQFFFFSFIFLVCYIVRRRRKFAEELEEWEKEFGKNRFRFKDLYYATKGF
        290       300       310       320       330       340      

                   280         290       300       310       320   
MNC17. K-KG-----GFGKVYKGELPSGTQ--IAVKRVYHNAEQGMKQYAAEIASMGRLRHKNLVQ
       : ::     :::.:::: .: ::.  :::::: :...::::...:::.:.::. :.::: 
gnl|PI KEKGLLGTGGFGSVYKGVMP-GTKLEIAVKRVSHESRQGMKEFVAEIVSIGRMSHRNLVP
        350       360        370       380       390       400     

           330       340       350       360       370       380   
MNC17. LLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDDYLFNKNKLKDLTWSQRVNIIKGVASALLYLHEEWE
       :::::::.:::::::::::::::: ::.:  ..  :.:.::...: ::::.:.:::::::
gnl|PI LLGYCRRRGELLLVYDYMPNGSLDKYLYNTPEVT-LNWKQRIKVILGVASGLFYLHEEWE
         410       420       430        440       450       460    

           390       400       410       420       430       440   
MNC17. QVVLHRDIKASNILLDADLNGRLGDFGLARFHDRGENLQATRVVGTIGYMAPELTAMGVA
       :::.:::.::::.::: .::::::::::::..:.: . :.:.::::.::.::: :  : :
gnl|PI QVVIHRDVKASNVLLDRELNGRLGDFGLARLYDHGSDPQTTHVVGTLGYLAPEHTRTGRA
          470       480       490       500       510       520    

           450       460       470        480          490         
MNC17. TTKTDIYAFGSFILEVVCGRRPVEPDRPPEQMHLL-KWVATCG---KRDTLMDVVDSKLG
       :  ::..:::.:.:::.:::::.: ..  ..  ::  ::   :   : : :  . : ..:
gnl|PI TMATDVFAFGAFLLEVACGRRPIEFQQETDETFLLVDWV--FGLWNKGDILA-AKDPNMG
          530       540       550       560         570        580 

      500       510       520       530       540        550       
MNC17. -DFKAKEAKLLLKLGMLCSQSNPESRPSMRHIIQYLEGNATIPSIS-FDTAGFGIPNISN
        .   ::....::::.:::.:.:..:::::....::.:.: .: .: .: .  :      
gnl|PI SECDEKEVEMVLKLGLLCSHSDPRARPSMRQVLHYLRGDAKLPELSPLDLSEVG      
             590       600       610       620       630           

       560       570       580    
MNC17. ETITQMTATSSSANFSFEDVTILFGGR

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