SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MNC17.13 (Universal genetic code) : 674 aa vs library searching gi:3236253 library 675 residues in 1 sequences The best scores are: s-w gi|3236253 (675)2008 >>gi|3236253 (675 aa) Smith-Waterman score: 2008; 47.405% identity in 713 aa overlap 10 20 30 40 50 MNC17. MAGVLGSVVFWLIIGIHVTF---LVF--AQEGDHFVYYD-FRN--ADLELDGMAN-TNHG .: .. : : :.: .... .:.: . : : .:: ..:... : .: gi|323 MFLKLLTIFFFFFFNLIFQSSSQSLNFAYNNGF-NPPTDLSIQGITTVTPNG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 MNC17. PLHLTNNTNTGTGHAFYNIPIKFTAS---SLSSFSFSTEFVFAIFPLQKSTY-GHGMAFV :.:::.: ::::::. ::.: : ..:::: : ::::: : . :::.::: gi|323 LLKLTNTTVQKTGHAFYTKPIRFKDSPNGTVSSFS--TSFVFAIHS-QIAILSGHGIAFV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 MNC17. VSPTKDLRSNGSANSNLGIFNRAND-NKTATHIFAVELDTNQNSESF-DKGGNDVGIDIN :.:. .: :. .. .:.:: ::. :.: .:.::::::: ..: : : . : :::::: gi|323 VAPNASL-PYGNPSQYIGLFNLANNGNET-NHVFAVELDTILSTE-FNDTNDNHVGIDIN 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 MNC17. SIVSVESADASYFNARKG--KNISLPLASGKSILVWIDYDG-IEKVLNVTLAPVQTPKPD :. ::.:. :.:.. .:: ::.. : : : . ::.:::: .:. .::.:: . :: gi|323 SLKSVQSSPAGYWD-EKGQFKNLT--LISRKPMQVWVDYDGRTNKI-DVTMAPFNEDKPT 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 MNC17. SPYFSSFIKPKVPLLSRSINLSEIFTETMYVGFSGSTGSIKSNQYILGWSFKQGGKAESL : .. : : .:: .. . ::::::..:::. :..::::::: . :: : gi|323 RPLVTA-----V----R--DLSSVLLQDMYVGFSSATGSVLSEHYILGWSFGLNEKAPPL 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 MNC17. DISRLSNPPPSPKRF-P--LKEV--LGATISTIAFLTLGGIVYL--Y---KKKKYAEVLE .::: : : :: : ..: .: . .. :: .. ...: : ...:.:: :: gi|323 ALSRL---PKLP-RFEPKRISEFYKIGMPLISL-FLIFS-FIFLVCYIVRRRRKFAEELE 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 MNC17. QWEKEYSPQRYSFRILYKATKGFRENQLLGAGGFGKVYKGILPSGTQ--IAVKRVYHDAE .::::.. .:. :. :: :::::.:. :::.::::.::::..: ::. :::::: :... gi|323 EWEKEFGKNRFRFKDLYYATKGFKEKGLLGTGGFGSVYKGVMP-GTKLEIAVKRVSHESR 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 MNC17. QGMKQYVAEIASMGRLRHKNLVHLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDDYLFHKNKLKDLT ::::..::::.:.::. :.::: :::::::.:::::::::::::::: ::.. .. :. gi|323 QGMKEFVAEIVSIGRMSHRNLVPLLGYCRRRGELLLVYDYMPNGSLDKYLYNTPEVT-LN 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 MNC17. WSQRVNIIKGVASALLYLHEEWEQVVLHRDIKASNILLDADLNGKLGDFGLARFHDRGVN :.::...: ::::.:.::::::::::.:::.::::.:::..:::.::::::::..:.: . gi|323 WKQRIKVILGVASGLFYLHEEWEQVVIHRDVKASNVLLDGELNGRLGDFGLARLYDHGSD 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 MNC17. LEATRVVGTIGYMAPELTAMGVTTTCTDVYAFGAFILEVVCGRRPVD-PDAPREQVILVK ..:.::::.::.::: : : .: :::.:::::.:::.:::::.. . : .:: gi|323 PQTTHVVGTLGYLAPEHTRTGRATMATDVFAFGAFLLEVACGRRPIEFQQETDETFLLVD 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 MNC17. WVASC-GKRDALT--D-TVDSKLIDFKVEEAKLLLKLGMLCSQINPENRPSMRQILQYLE :: . .: : :. : .. :. : : :....::::.:::. .:. ::::::.:.::. gi|323 WVFGLWNKGDILAAKDPNMGSEC-DEK--EVEMVLKLGLLCSHSDPRARPSMRQVLHYLR 570 580 590 600 610 630 640 650 660 670 MNC17. GNVSVPAIS-F---GT-VALGIPNISHETVTQMTTT-SSSA--NF----SFEDVTVLFGG :....: .: . :. . .:. :. ... . :::. .: :. : . : :: gi|323 GDAKLPELSPLDLSGSGMMFGV----HDGFSELGMSYSSSVFKGFTGGSSIAD-SQLSGG 620 630 640 650 660 670 MNC17. R : gi|323 R Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:00