SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MMN10.9 (Universal genetic code) : 907 aa vs library searching att5k1821 library 814 residues in 1 sequences The best scores are: s-w ATT5K1821, 814 bases, 246B checksum. (814)1188 >>ATT5K1821, 814 bases, 246B checksum. (814 aa) Smith-Waterman score: 1188; 29.736% identity in 834 aa overlap 10 20 30 40 MMN10. MKLPCTIRSITSSH--FRNSFRNVSSVI---DSAQEECRIAEDKQFVDAV .. :..:. :..: : ... . :.. :: . :... . . ATT5K1 MDLRRLSRASYLFTRRLKFIAKSRKCFHTS-RYLQQCVHRPDKS-EET--SSDRHLHERL 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 MMN10. KRIVRGKRSWEIALSSELVSRRLKTVHVEEILI---GTIDDPKLGLRFFNFLGLHRGFDH . .. .::: . ..:.. :. .. .... . .. :: .: :: . . .:. ATT5K1 SSVL-SKRSLDYEQCKQLITV-LSPLEFDRLFPEFRSKVN-PKTALDFFRLASDSFSFSF 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 MMN10. STASFCILIHALVKANLFWPASSLLQTLL------LR-ALKPS-----DVFNVLFSCYEK : :.:.:: :. :::. : .: :. : .:. : :.. : :... ATT5K1 SLRSYCLLIGLLLDANLLSAARVVLIRLINGNVPVLPCGLRDSRVAIADAMASLSLCFDE 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 MMN10. CKLSSSSSFDLLIQHYVRS-RRVLDG---VL-VFKMMITKVSLLPEVRTLSALLHGLVKF .. . : ::::. : . .: :: .: :: .. .: ...: : . :: .::. ATT5K1 -EIRRKMS-DLLIEVYCTQFKR--DGCYLALDVFPVLANK-GMFPSKTTCNILLTSLVRA 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 MMN10. RHFGLAMELFNDMVSVGIRPDVYIYTGVIRSLCELKDLSRAKEMIAHMEATGCDVNIVPY .: : : :.: :. ::::..: .: ..:. . .: .....:: .: :.: . ATT5K1 NEFQKCCEAF-DVVCKGVSPDVYLFTTAINAFCKGGKVEEAVKLFSKMEEAGVAPNVVTF 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 MMN10. NVLIDGL--CKKQKVWEAVGIKKDLAGKDLKPDVVTYCTLVYGLCKVQEFEIG--LEMMD :..:::: : . :: .:. .. . ..: ..:: :: :: .... :: .. ATT5K1 NTVIDGLGMCGRYD--EAFMFKEKMVERGMEPTLITYSILVKGLTRAKR--IGDAYFVLK 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 MMN10. EMLCLRFSPSEAAVSSLVEGLRKRGKIEEALNLVKRV-VDFGVSPNLFVYNALIDSLCKG :: : :. . ..:.... . :....:.. .: . :. :.: . .::.:: . ::. ATT5K1 EMTKKGFPPNVIVYNNLIDSFIEAGSLNKAIE-IKDLMVSKGLSLTSSTYNTLIKGYCKN 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 MMN10. RKFHEAELLFDRMGKIGLRPNDVTYSILIDMFCRRGKLDTALSFLGEMVDTGLK-LSVYP . .:: :. .: .::. :. ... .: ..: . .:.:: :.:::. :. .: : ATT5K1 GQADNAERLLKEMLSIGFNVNQGSFTSVICLLCSHLMFDSALRFVGEML---LRNMS--P 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 MMN10. ----YNSLINGHCKFGDISAA-EGFMAEMINKKLEPTVV-TYTS--LMGGYCSKGKINKA ..::.: :: : : : : .. ...:: . :: : :: :. : : ::...: ATT5K1 GGGLLTTLISGLCKHGKHSKALELWF-QFLNKGF---VVDTRTSNALLHGLCEAGKLDEA 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 MMN10. LRLYHEMTGKG-IAPSIYTFTTLLSGLFRAGLIR-DAVKLF-NEMAEWNVKPNRVTYNVM .:. .:. :.: . . ...::.:: : . : . .: .::.. ..::. ::... ATT5K1 FRIQKEILGRGCVMDRV-SYNTLISGC--CGKKKLDEAFMFLDEMVKRGLKPDNYTYSIL 520 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 600 MMN10. IEGYCEEG--DMSK---AFEFLKEMTEKGIVPDTYSYRPLIHGLCLTGQASEAKVFVDGL : : : .:.: :..: . ..:..::.:.: .: : : . .. :.. : : . ATT5K1 I---C--GLFNMNKVEEAIQFWDDCKRNGMLPDVYTYSVMIDGCCKAERTEEGQEFFDEM 580 590 600 610 620 610 620 630 640 650 660 MMN10. HKGNCELNEICYTGLLHGFCREGKLEEALSVCQEMVQRGVDLDLVCYGVLIDG-SL--KH . : . : . :. :....:: :.: :: . ..: ..:.. . . : :: : :. . ATT5K1 MSKNVQPNTVVYNHLIRAYCRSGRLSMALELREDMKHKGISPNSATYTSLIKGMSIISRV 630 640 650 660 670 680 670 680 690 700 710 MMN10. KDRKLFFGLLKEMHDRGLKPDDVI-YTSMIDAKSKTGDF-K-EAFGIWDLMINEGCVPNE .. ::.: .::. .::.:. :. ::..::. .: :.. : : . . . : ... ::. ATT5K1 EEAKLLF---EEMRMEGLEPN-VFHYTALIDGYGKLGQMVKVECL-LRE-MHSKNVHPNK 690 700 710 720 730 720 730 740 750 760 770 MMN10. VTYTAVINGLCKAGFVNEAEVLCSKMQPVSSVPNQVTYGCFL-DILTKGEVDMQ--KAVE .:::..:.: . : :.:: : ..:. . ::...:: :. : .: : .. :. . ATT5K1 ITYTVMIGGYARDGNVTEASRLLNEMREKGIVPDSITYKEFIYGYLKQGGV-LEAFKGSD 740 750 760 770 780 790 780 790 800 810 820 830 MMN10. LHN--AILKGLLANTATYNMLIRGFCRQGRIEEASELITRMIGDGVSPDCITYTTMINEL .: ::..: ATT5K1 EENYAAIIEGWNKLIQ 800 810 840 850 860 870 880 890 MMN10. CRRNDVKKAIELWNSMTEKGIRPDRVAYNTLIHGCCVAGEMGKATELRNEMLRQGLIPNN 900 MMN10. KTSRTTTSNDTSSKS Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:00