SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MMN10.21 (Universal genetic code) : 577 aa
 vs  library
 searching ltu73106 library

    585 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
LTU73106, 585 bases, 17D0 checksum.                (585)3100

>>LTU73106, 585 bases, 17D0 checksum.                (585 aa)
Smith-Waterman score: 3100;   74.443% identity in 583 aa overlap

                         10        20            30        40      
MMN10.           MALQLLLAVFSCVLLLPQPAF----GITRHYTLEIKMQNVTRLCHTKSLV
                 ::  ::::. : ..:.:. .     :::::: ..:..:::::::::::.:
LTU731 MAPLLQTSGPMA-ALLLAL-SAIFLFPELSHAKHAGITRHYKFNIRLQNVTRLCHTKSIV
               10          20        30        40        50        

         50        60        70        80        90       100      
MMN10. SVNGQFPGPKLIAREGDQVLIKVVNQVPNNISLHWHGIRQLRSGWADGPAYITQCPIQTG
       .:::.:::::..:::::.:..::::.: :::.:::::.:::::::::::::.::::::::
LTU731 TVNGRFPGPKIFAREGDRVVVKVVNHVQNNITLHWHGVRQLRSGWADGPAYVTQCPIQTG
       60        70        80        90       100       110        

        110       120        130       140       150       160     
MMN10. QSYVYNYTIVGQRGTL-WYHAHISWLRSTVYGPLIILPKRGVPYPFAKPHKEVPMIFGEW
       :.::::. :..::::: : ::::::::.:.:::..::::.:::::: ::.::::.:::::
LTU731 QTYVYNFRIISQRGTLFW-HAHISWLRATIYGPIVILPKHGVPYPFIKPYKEVPIIFGEW
      120       130        140       150       160       170       

         170       180       190       200       210       220     
MMN10. FNADTEAIIRQATQTGGGPNVSDAYTINGLPGPLYNCSAKDTFRLRVKPGKTYLLRLINA
       ::::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::::::::::::
LTU731 FNADTEAIITQALQTGGGPNVSDAYTINGLPGPLYNCSARDTFRLSVKPGKTYLLRLINA
       180       190       200       210       220       230       

         230       240       250       260       270       280     
MMN10. ALNDELFFSIANHTVTVVEADAIYVKPFETETILIAPGQTTNVLLKTKSSYPSASFFMTA
       ::::::::::::::.:.:..::::::::.:. .::.::::::::::::  ::.:.:::.:
LTU731 ALNDELFFSIANHTLTIVDVDAIYVKPFDTDILLITPGQTTNVLLKTKPHYPNATFFMSA
       240       250       260       270       280       290       

         290       300       310       320       330       340     
MMN10. RPYVTGQGTFDNSTVAGILEYEPPKQTKGAHSRTSIKNLQLFKPILPALNDTNFATKFSN
       :::.::.:::::.:..:::::. :.... ...  .:::: ::.: ::.:::: ::.... 
LTU731 RPYATGRGTFDNTTTVGILEYQKPNSSHPSNA-IGIKNLPLFRPSLPGLNDTAFAANYTR
       300       310       320        330       340       350      

         350       360       370       380       390       400     
MMN10. KLRSLNSKNFPANVPLNVDRKFFFTVGLGTNPCNHKNNQTCQGPTNTTMFAASISNISFT
       .:::: . .:::::: .:::.:::::::::.::  :: :::::: : : ::::..:.::.
LTU731 RLRSLANAQFPANVPQTVDRRFFFTVGLGTQPCP-KN-QTCQGP-NGTKFAASVNNVSFV
        360       370       380       390          400       410   

         410       420       430       440       450       460     
MMN10. MPTKALLQSHYSGQSHGVYSPKFPWSPIVPFNYTGTPPNNTMVSNGTNLMVLPYNTSVEL
       .:: ::::.:. :::.:::. .:: .:  ::::::::::::::::::...:::.::::::
LTU731 LPTTALLQTHFFGQSNGVYTTNFPTNPPFPFNYTGTPPNNTMVSNGTKVVVLPFNTSVEL
           420       430       440       450       460       470   

         470       480       490       500       510       520     
MMN10. VMQDTSILGAESHPLHLHGFNFFVVGQGFGNFDPNKDPRNFNLVDPIERNTVGVPSGGWA
       ::::::: :::::::::::::::::::::::..::::: ::::.::.::::::::.:::.
LTU731 VMQDTSIQGAESHPLHLHGFNFFVVGQGFGNYNPNKDPSNFNLIDPVERNTVGVPAGGWV
           480       490       500       510       520       530   

         530       540       550       560        570       
MMN10. AIRFLADNPGVWFMHCHLEVHTSWGLRMAWLVLDGDKPDQKLLP-PPADLPKC
       :::: .::::::::::::::::::::.:::.::::  :.::: : ::.:::::
LTU731 AIRFQTDNPGVWFMHCHLEVHTSWGLKMAWVVLDGKLPNQKL-PSPPSDLPKC
           540       550       560       570        580     

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