SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MMN10.20 (Universal genetic code) : 886 aa vs library searching af015301 library 944 residues in 1 sequences The best scores are: s-w AF015301, 944 bases, 207A checksum. (944)2891 >>AF015301, 944 bases, 207A checksum. (944 aa) Smith-Waterman score: 2891; 48.000% identity in 925 aa overlap 10 MMN10. MKSNTPTEDSTKWMLE .:.: .:. AF0153 MKPFSKNDRRRWSFDSVSAGKTAVGSASTSPGTEYSINGDQEFVEVTIDLQDDDTI-VLR 10 20 30 40 50 20 30 40 50 60 MMN10. SVE----IDSMGESSSKE-----PEINLNKNEGGLKKNAS-R------NLGVGSIIRTLS ::: :. .:. :. . : ...... .:...: : .: . .. .. . AF0153 SVEPATAINVIGDISDDNTGIMTP-VSISRSPT-MKRTSSNRFRQFSQELKAEAVAKAKQ 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 MMN10. VS------NW-RK-SGNLGSPST--RKSGNLGPP-TN-AVPKKT-GPQR--VERTTSSAA .: .: :. :::: . :: .::. : .: :. .. :: ..:: ::: AF0153 LSQELKRFSWSRSFSGNLTTTSTAANQSGGAGGGLVNSALEARALRKQRAQLDRTRSSAQ 120 130 140 150 160 170 110 120 130 140 150 160 MMN10. RGLQSLRFLDRTVTGRER--DAWRSIENRFNQFSVDGKLPKEKFGVCIGMGDTMEFAAEV :.:..::: ...... :.: .... :..: .: . . :. :::: :. ::: :. AF0153 RALRGLRF----ISNKQKNVDGWNDVQSNFEKFEKNGYIYRSDFAQCIGMKDSKEFALEL 180 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 MMN10. YEALGRRRQIETENGIDKEQLKLFWEDMIKKDLDCRLQIFFDMCDKNGDGKLTEEEVKEV ..::.:::....:. :....: .: .. ...: :::::::. ::: ::..:::::::. AF0153 FDALSRRRRLKVEK-INHDELYEYWSQINDESFDSRLQIFFDIVDKNEDGRITEEEVKEI 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 MMN10. IVLSASANRLGNLKKNAAAYASLIMEELDPDHKGYIEMWQLEILLTGMVTNAD-TEKMK- :.::::::.:. ::..: ::.::::::::.. ::::.:::: :: : . .. .. AF0153 IMLSASANKLSRLKEQAEEYAALIMEELDPERLGYIELWQLETLLLQKDTYLNYSQALSY 300 310 320 330 340 350 290 300 310 320 330 340 MMN10. KSQTLTRAMIPERYRTPMSKYVSVTAELMHENWKKLWVLALWAIINVYLFMWKYEEFMRN ::.:.. . : .. . .. : . .:.::::..:::.:: .: . ::.::. .. .. AF0153 TSQALSQNLQGLRGKSRIHRMSSDFVYIMQENWKRIWVLSLWIMIMIGLFLWKFFQYKQK 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 400 MMN10. PLYNITGRCVCAAKGAAETLKLNMALILVPVCRKTLTILRSTFLNRVVPFDDNINFHKVI ... : :. .:::::::::.:::::: ::::.:.: :::: :. :::::::::::.: AF0153 DAFHVMGYCLLTAKGAAETLKFNMALILFPVCRNTITWLRSTRLSYFVPFDDNINFHKTI 420 430 440 450 460 470 410 420 430 440 450 460 MMN10. AYMIAFQALLHTALHIFCNYPRLSSCS-YDVFLTYAGAALGNTQPSYLGLMLTSVSITGV : :. ..:: . :. :..::. . :: . : . . ::.:. :. .:::. AF0153 AGAIVVAVILHIGDHLACDFPRIVRATEYD-YNRYLFHYFQTKQPTYFDLVKGPEGITGI 480 490 500 510 520 530 470 480 490 500 510 520 MMN10. LMIFFMGFSFTLAMHYFRRNIVKLPKPFNVLAGFNAFWYAHHLLVLAYILLIIHGYYLII ::...: .::::: ..::::.:::::::. :.:::::::.:::.:..:::::.:: .: . AF0153 LMVILMIISFTLATRWFRRNLVKLPKPFDRLTGFNAFWYSHHLFVIVYILLILHGIFLYF 540 550 560 570 580 590 530 540 550 560 570 580 MMN10. EKPWYQKTTWMYLAVPMLFYASERLFSRLLQEHSHRVNVIKAIVYSGNVLALYVTKPPGF :::: .:::::::::.:.:..:: . : .. :. : ..:. .: ::::.: ..:: : AF0153 AKPWYVRTTWMYLAVPVLLYGGERTL-RYFRSGSYSVRLLKVAIYPGNVLTLQMSKPTQF 600 610 620 630 640 650 590 600 610 620 630 640 MMN10. KYKSGMYMFVKCPDLSKFEWHPFSITSAPGDDYLSVHIRALGDWTTELRSRFAKTCEPTQ .::::.::::.:: .: :::::::::::: :::.:.::: ::::: ::. :...::: AF0153 RYKSGQYMFVQCPAVSPFEWHPFSITSAPEDDYISIHIRQLGDWTQELKRVFSEVCEPP- 660 670 680 690 700 650 660 670 680 690 700 MMN10. AAAKPKPNSLMRMETRAAGVNPHIEESQVLFPKIFIKGPYGAPAQNYQKFDILLLVGLGI ...: ..:.: . : .. .::..: ::::::::.:.:.:.:::::::: AF0153 VGGK---SGLLRAD----------ETTKKSLPKLLIDGPYGAPAQDYRKYDVLLLVGLGI 710 720 730 740 750 710 720 730 740 750 MMN10. GATPFISILKDMLNHLKPGIPRSGQKYEGSVGGESIGGDSVSGGGGKKFPQR-------- :::::::::::.::.. . . ... :.. : ... .:..: :.: AF0153 GATPFISILKDLLNNI---V-KM-EEHADSISDFSRSSEYSTGSNGDT-PRRKRILKTTN 760 770 780 790 800 810 760 770 780 790 800 810 MMN10. AYFFWVTREQASFDWFKGVMDDIAEYDKTHVIEMHNYLTSMYEAGDARSALIAMVQKLQH :::.::::::.:::::::::...:: :. ::::::::::.:: ::::::::.::: :.: AF0153 AYFYWVTREQGSFDWFKGVMNEVAELDQRGVIEMHNYLTSVYEEGDARSALITMVQALNH 820 830 840 850 860 870 820 830 840 850 860 870 MMN10. AKNGVDIVSESRIRTHFARPNWRKVFSELSSKHEAC--RIGVFYCGSPTLVRPLKELCQE ::::::::: .:.:::::::::.::...::::: : :::::::: :.: . :..::. AF0153 AKNGVDIVSGTRVRTHFARPNWKKVLTKLSSKH--CNARIGVFYCGVPVLGKELSKLCNT 880 890 900 910 920 880 MMN10. FSLESSTRFTFHKENF :. ..::.: ::::.: AF0153 FNQKGSTKFEFHKEHF 930 940 Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:01