SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MMN10.13 (Universal genetic code) : 651 aa
 vs  library
 searching ig002n014 library

    589 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
IG002N014, 589 bases, 11DE checksum.               (589)2635

>>IG002N014, 589 bases, 11DE checksum.               (589 aa)
Smith-Waterman score: 2635;   62.995% identity in 581 aa overlap

               10        20        30        40        50        60
MMN10. MDTGAVKLPIHEHPIFPSARIVFSTCKGCGVEDFVYGGYVCNDSDCKARFHKECAEAPSE
       : : ::.:::::::..:::: ... : :: :. ..:.:: ::.  :   :::::::::.:
IG002N MATTAVNLPIHEHPLYPSARCIIGECDGCHVNGYMYNGYFCNEPFCFIWFHKECAEAPAE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
MMN10. ISHSFHQQHPLFLTNGLGDLPCDLCGQKRLEAAGYSCPTCEFKLDLTCGINPSPPAIEHP
       :::: :.::::.:::   : :::::::: :    ::: :::::.::::...:::::::::
IG002N ISHSSHHQHPLLLTNDSIDGPCDLCGQKLLPPC-YSCSTCEFKVDLTCAMKPSPPAIEHP
               70        80        90        100       110         

              130       140       150       160       170       180
MMN10. ICHDHPLVFLKKREEKAPCEVCKDSIGGPSYSCLGCDLYFHVDCVHLSKEVNHPCHPSHP
       .:: : ::::::::::. ::.:::::.::::::: ::.::::.:..:::::::::: .::
IG002N LCHHHSLVFLKKREEKVSCELCKDSIAGPSYSCLECDVYFHVNCIQLSKEVNHPCHSAHP
     120       130       140       150       160       170         

              190       200        210       220       230         
MMN10. LKLIASESLTDNAEKICLLCEQQP-ENMLYYCSVCNFTSCLGCTKRPPPLFIEHTKTHKH
       ::::  :::::.::  :::: ..: :::::.:::::::::::::: :: : ::: :::::
IG002N LKLIPFESLTDDAETTCLLCGKKPAENMLYHCSVCNFTSCLGCTKNPPLLVIEHIKTHKH
     180       190       200       210       220       230         

     240           250       260        270        280       290   
MMN10. QLTLF---LNGI-SYQGSALTYNSRAYMCLP-CGFVVNGNG-INLPQVININRHDHRISY
        : ::   .  : .  :.   .   .:.: : : ::. . : :.: .:::::::::::  
IG002N PLILFPRRIPCICDICGKKCEFA--VYVC-PQCDFVT-ARGCIDLARVININRHDHRIYL
     240       250       260          270        280       290     

           300       310       320       330       340       350   
MMN10. THQLGPGYLNCGVCREIVDRDCGAYACVVCSNYAVHWECAVHDNVWDGVELEGTSEITED
       ::.:: :: .::::.: :..  :::.: :: .::::  :::. .::::::::::.:::::
IG002N THHLGTGYSKCGVCHENVNQYKGAYSCSVCPHYAVHSTCAVRTDVWDGVELEGTTEITED
         300       310       320       330       340       350     

           360       370       380        390       400       410  
MMN10. IAPFKVMGDNLISHFSHEQHTLRLHKEGI-IHDAYALCEACTYPIGFDPIYSCEECHFIL
        .::::.::::: :::::.: ::..:. . ::: .  : :: .:.::  :: :: : :::
IG002N NSPFKVVGDNLICHFSHEEHPLRFQKDDVFIHDEHKRCAACIHPLGFGSIYCCETCPFIL
         360       370       380       390       400       410     

            420       430       440       450       460        470 
MMN10. HEKCANLPMKKRLVFATTPFKLVGASSRVRDVIDCGYCGECSTGFKYASQRGW-EIDVHC
       :::::::::::::::.: :. :.  .... :   :  ::  : :: :.: : : ..::::
IG002N HEKCANLPMKKRLVFGTRPYTLMKETTQLTD---CTLCGIFSDGFAYSS-R-WLDVDVHC
         420       430       440          450       460         470

             480       490       500        510       520       530
MMN10. GSLSEPFVHNGHLHPLYFDSKENHSCNACHK-VTVHMLCCNACDFDLCLSCASLPLKIRH
       :::.::.::.::.::: ::. :.: :..:.: .  .:: :.:::::::: ::.:: :: :
IG002N GSLNEPLVHDGHIHPLNFDKMEGHFCDGCKKNIDDYMLRCKACDFDLCLYCATLPKKIWH
              480       490       500       510       520       530

              540         550       560         570       580      
MMN10. RNDEHPLTLSC--GETANGKYWCDICETELDPS--KWFYTSFDCGVTLHVECVLGDFSRL
       ::: ::::: :   : :. :::::::: ::::   . : ::                   
IG002N RNDGHPLTLCCEEKEEASDKYWCDICEKELDPMCIRRFLTSRARTKLLVWGKSQVWGGS 
              540       550       560       570       580          

        590       600       610       620       630       640      
MMN10. MPGRMVDTVGGKKFYVVLNNHNTRPLCSMCRSRCKVSVILKACDEDNVYICSRSCFSDMV

        650 
MMN10. SARSC

Library scan:  0:00:00  total CPU time:  0:00:00