SSEARCH searches a sequence database
 using the Smith-Waterman algorithm
 version 2.0u54, July. 1996
Please cite:
 T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; 
 W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650

 >MMN10.12 (Universal genetic code) : 656 aa
 vs  library
 searching ig002n014 library

    589 residues in     1 sequences
The best scores are:                              s-w
IG002N014, 589 bases, 11DE checksum.               (589)2600

>>IG002N014, 589 bases, 11DE checksum.               (589 aa)
Smith-Waterman score: 2600;   59.589% identity in 584 aa overlap

               10        20        30        40          50        
MMN10. MDTSAVQLPFRDYSLQPAPRYINARCHICSVTGAIYNGYFCNDPI--VWMHKECVELPSE
       : :.::.::.... : :. : : ..:  : :.: .:::::::.:.  .:.::::.: :.:
IG002N MATTAVNLPIHEHPLYPSARCIIGECDGCHVNGYMYNGYFCNEPFCFIWFHKECAEAPAE
               10        20        30        40        50        60

       60        70          80          90       100       110    
MMN10. INHLFHPQHPLLLTYE--EGWWSCFCALCGETK--PAKYFYSCSTCKIKVDLTCGMNPPP
       :.:  : ::::::: .  .:     : :::. :  :    ::::::..::::::.:.: :
IG002N ISHSSHHQHPLLLTNDSIDG----PCDLCGQ-KLLPP--CYSCSTCEFKVDLTCAMKPSP
               70        80             90         100       110   

          120       130       140       150       160       170    
MMN10. PAIEHPICHDHPLVFLKKRQEKTPCEVCKNRILGSSYSCLGCELYFHVGCIHLSKEVNHP
       ::::::.:: : :::::::.::. ::.::. : : ::::: :..::::.::.::::::::
IG002N PAIEHPLCHHHSLVFLKKREEKVSCELCKDSIAGPSYSCLECDVYFHVNCIQLSKEVNHP
           120       130       140       150       160       170   

          180       190       200        210       220       230   
MMN10. CHSDHPLMLVESESLTDNDKKTCFLCGQQP-HGILYHCSICNFTLCIGCIKSPPPLVVEN
       ::: ::: :.  :::::. . ::.:::..: ...:::::.:::: :.:: :.:: ::.:.
IG002N CHSAHPLKLIPFESLTDDAETTCLLCGKKPAENMLYHCSVCNFTSCLGCTKNPPLLVIEH
           180       190       200       210       220       230   

           240       250       260       270       280       290   
MMN10. VKTHKHPLTFFPRGVYCTCNVCGVKGLILSYMCLQCGFAVHCSCVDLPQVININRHDHRI
       .::::::: .::: . : :..:: :  .  :.: :: :..  .:.:: .:::::::::::
IG002N IKTHKHPLILFPRRIPCICDICGKKCEFAVYVCPQCDFVTARGCIDLARVININRHDHRI
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
MMN10. SFTQHLGPGYLNCGVCRRSVCQFNGAYSCLVCPNYAVHSRCATRYDIWDGVELEGKAENI
        .:.::: :: .::::...: :..::::: :::.::::: ::.: :.:::::::: .:  
IG002N YLTHHLGTGYSKCGVCHENVNQYKGAYSCSVCPHYAVHSTCAVRTDVWDGVELEGTTEIT
           300       310       320       330       340       350   

           360       370       380        390       400       410  
MMN10. EDIAPFKVVGDDLIRHFSHSKHSLRLHKNNI-IYDDSTRCEACGHPVEFGRIYNCEECCF
       :: .:::::::.:: :::: .: ::..:... :.:.  :: :: ::. :: :: :: : :
IG002N EDNSPFKVVGDNLICHFSHEEHPLRFQKDDVFIHDEHKRCAACIHPLGFGSIYCCETCPF
           360       370       380       390       400       410   

            420       430       440       450       460       470  
MMN10. ILHEKCANLPMKKRLVFSTLPFLLLGPGNDVCKVLDCKLCGMFFTGFEYKSQERRQSDID
       :::::::::::::::::.: :. :.   ... .. :: :::.:  :: :.:   :  :.:
IG002N ILHEKCANLPMKKRLVFGTRPYTLM---KETTQLTDCTLCGIFSDGFAYSS---RWLDVD
           420       430          440       450       460          

            480       490       500       510       520       530  
MMN10. VHCGSLTEPFVHDGHLHPLYFDQKQKELPCNACQKTIRDYMLCCADCDFNLCLWCASLPK
       ::::::.::.:::::.::: ::. . .. :..:.:.: :::: :  :::.:::.::.:::
IG002N VHCGSLNEPLVHDGHIHPLNFDKMEGHF-CDGCKKNIDDYMLRCKACDFDLCLYCATLPK
       470       480       490        500       510       520      

            540         550       560         570       580        
MMN10. KIRHSNDEHILTLCC--GEEANGKYWCDICEAELDPS--KWFYTCFGCGGTLHVECVLGD
       :: : :: : :::::   :::. :::::::: ::::   . : :                
IG002N KIWHRNDGHPLTLCCEEKEEASDKYWCDICEKELDPMCIRRFLTSRARTKLLVWGKSQVW
        530       540       550       560       570       580      

      590       600       610       620       630       640        
MMN10. FSRLMPGCTIDYRVYTVEVVFNNHNTRPMCSRCHSRCKVSVILKFREGNIVYFFCSRSCF
                                                                   
IG002N GGS                                                         
                                                                   

      650      
MMN10. LMHFSYYL

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