SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MLF18.P1 (Universal genetic code) : 1027 aa vs library searching gi:3746069 library 1231 residues in 1 sequences The best scores are: s-w gi|3746069 (1231)4281 >>gi|3746069 (1231 aa) Smith-Waterman score: 4281; 58.867% identity in 1077 aa overlap gi|374 MHLIVVYAAPSVSRRSGLWGELKDVVNGLEGPLLIGGDFNTILWVDERMGGNGRLSPDSL 10 20 30 40 50 60 gi|374 AFGDWINELSLIDLGFKGNKFTWRRGRQESTVVAKRLDRVFVCAHARLKWQEAVVSHLPF 70 80 90 100 110 120 MLF18. IMCK .. : gi|374 MASDHAPLYVQLEPLQQRKLRKWNREVFGDIHVRKEKLVADIKEVQDLLGVVLSDDLLAK 130 140 150 160 170 180 10 20 30 40 50 60 MLF18. EETLLKEFDIILEQEETLWFQKSR-KWIHMGDRNTSYFHTSTVIRRRRNRIKMLKNDEDQ ::.::::.:..::::::::::::: :.:..:::::..:::::.::::::::. ::.:.:. gi|374 EEVLLKEMDLVLEQEETLWFQKSREKYIELGDRNTTFFHTSTIIRRRRNRIESLKGDDDR 190 200 210 220 230 240 70 80 MLF18. WVSDTRDLEKLVL----------D--E--------------EVERA-------------- ::.: .:: ..: : : :.:.: gi|374 WVTDKVELEAMALTYYKRLYSLEDVSEVRNMLPTGGFASISEAEKAALLQAFTKAEVVSA 250 260 270 280 290 300 90 100 110 120 130 140 MLF18. IRGMGSYKSPGPDGFQPIFYQRCWETVGESVTNLVLKFFETAELPSNLNDVLGVLLQKVG ...:: .:.:::::.::.:::.:::::: ::: .::.::::. ::.. ::.: ::. ::. gi|374 VKSMGRFKAPGPDGYQPVFYQQCWETVGPSVTRFVLEFFETGVLPASTNDALLVLIAKVA 310 320 330 340 350 360 150 160 170 180 190 200 MLF18. KPEKIP-FRPISLCNVLFKIITKTMVERLKPVMNKIIGPAQSSFLPGKVSTDNIVVVQEA :::.: :::.:::::::::::: :: ::: :..:.:::::.::.::..: ::::.:::: gi|374 KPERIQQFRPVSLCNVLFKIITKMMVTRLKNVISKLIGPAQASFIPGRLSIDNIVLVQEA 370 380 390 400 410 420 210 220 230 240 250 260 MLF18. LHSMRRKKGVKGWMLLKLDLEKAYDRIRWDFLEDTLVVAGFSELWVRWIMKCVSGPSMSL .:::::::: ::::::::::::::::.:::::..:: .::.:: :. :: :. ::::. gi|374 VHSMRRKKGRKGWMLLKLDLEKAYDRVRWDFLQETLEAAGLSEGWTSRIMAGVTDPSMSV 430 440 450 460 470 480 270 280 290 300 310 320 MLF18. LWNGEKTNSFRPLRGLRQGDPLSPYL-VLCMERLCHLIKESIEKKRWKPFNLSRGGPKLS :::::.:.:: : ::::::::::::: :::.:::::::. :. :..:::. .: :: ::: gi|374 LWNGERTDSFVPARGLRQGDPLSPYLFVLCLERLCHLIEASVGKREWKPIAVSCGGSKLS 490 500 510 520 530 540 330 340 350 360 370 380 MLF18. HICFADDLILFSEASVAQVRAIRGVLETFCTASGQKVSLEKSKIFFLNNVSRVLGNSISD :.:::::::::.::::::.: :: ::: :: ::::::::::::::: .:::: . . ::. gi|374 HVCFADDLILFAEASVAQIRIIRRVLERFCEASGQKVSLEKSKIFFSHNVSREMEQLISE 550 560 570 580 590 600 390 400 410 420 430 440 MLF18. ESGIKSTKDLGKYLGMPVLHRRINKTTFGEILERASTKLSGWKEKTLSFTGRLTLTKAVL :::: ::.::::::::.:..:.:: ::::.:::.:..:.::: ..::..::.::::::: gi|374 ESGIGCTKELGKYLGMPILQKRMNKETFGEVLERVSARLAGWKGRSLSLAGRITLTKAVL 610 620 630 640 650 660 450 460 470 480 490 500 MLF18. SSLPVHAMSSILLPQSTISQLDKISRSFLWGSTQEKKKQHLVAWKKVCSPKSEGGLGIRS ::.:::.::.:::: ::.. ::. ::.::::::.:::::::..:.:.:.::.:::.:.:: gi|374 SSIPVHVMSAILLPVSTLDTLDRYSRTFLWGSTMEKKKQHLLSWRKICKPKAEGGIGLRS 670 680 690 700 710 720 510 520 530 540 550 560 MLF18. AKHMNKSLIAKVGWRLLQDQSALWARVLRCKYKVGEVSDGRWLIKKNTWSPTWMSIVVGF :. :::.:.::::::::::. .:::::.: ::::: :.: :: . :: :: :..::. gi|374 ARDMNKALVAKVGWRLLQDKESLWARVVRKKYKVGGVQDTSWLKPQPRWSSTWRSVAVGL 730 740 750 760 770 780 570 580 590 600 610 MLF18. IEVILHSLSWVPGDGTEICFWEDKWL-HGGLLWDESNGEM-PAGFETM-LAKDLWSAGRG ::......:::::: : :: :.:: . :. : . .: : : : . .: : : : : gi|374 REVVVKGVGWVPGDGCTIRFWLDRWLLQEPLV--ELGTDMIPEG-ERIKVAADYWLPGSG 790 800 810 820 830 620 630 640 650 660 670 MLF18. WDFSKISPYV--TLKRILELSAVVLDLVTGARDRLAL-GETQDGQFTVGSAYAMLS--LN :.. .. :. :.:: : :: ::... : :... : :::: ::: :::..:. .. gi|374 WNLEILGLYLPETVKRRL-LS-VVVQVFLGNGDEISWKG-TQDGAFTVRSAYSLLQGDVG 840 850 860 870 880 890 680 690 700 710 720 730 MLF18. DLPRLNMSNFFNRIWKVLVPERVRGFLWLVSNQALMTNEERYRRHICVSNICEVCKSGVE : : ::..:::::::...::::: :.::::....::: :: :::. . :: :: .:.: gi|374 DRP--NMGSFFNRIWKLITPERVRVFIWLVSQNVIMTNVERVRRHLSENAICSVC-NGAE 900 910 920 930 940 950 740 750 760 770 780 790 MLF18. TTLL-ILPDCPAMAEIWTRIVPRRRQREFFSKTLFEWVYDNLREGVPFAESSWSTVFAMA :.: .: ::::: :: :..: ::..::::..:.::.. :. : ... : :.:.:. gi|374 ETILHVLRDCPAMEPIWRRLLPLRRHHEFFSQSLLEWLFTNMD---P-VKGIWPTLFGMG 960 970 980 990 1000 800 810 820 830 840 MLF18. AWWGWKWRCGNVFGENRR-CRDRVQFVRDVAKEVFVTKKNMNVV--R--GVQSRVEKLIG ::.::::: .:::: :. ::::..:..:.:.:: . ....: : :: :::..: gi|374 IWWAWKWRCCDVFGE-RKICRDRLKFIKDMAEEV--RRVHVGAVGNRPNGV--RVERMIR 1010 1020 1030 1040 1050 1060 850 860 870 880 890 900 MLF18. WEAPRVVWIKINTDGASHGNPGLAAAGGVLRDGDGNWLGGFALNIGICSAQLAELWGGGG :..: :.::.:::::.:: :::::::..:.:.:.:::::::::: :.: :::::: . gi|374 WQVPSDGWVKITTDGASRGNHGLAAAGGAIRNGQGEWLGGFALNIGSCAAPLAELWG--A 1070 1080 1090 1100 1110 1120 910 920 930 940 950 960 MLF18. YYGLYLAWERRFPKVELEVDFAVVVGFLTAGISDMHPLSFLVRLCHDFLSKDWDVRVSHV :::: .::.. : .:::..: .:::::..:.:. ::::::::::. :...:: :::::: gi|374 YYGLLIAWDKGFRRVELDLDCKLVVGFLSTGVSNAHPLSFLVRLCQGFFTRDWLVRVSHV 1130 1140 1150 1160 1170 1180 970 980 990 1000 1010 1020 MLF18. YREANRLADGLASYAFSLCLGFHYCEF--VP--IVLDSILRDDNLGSTRPRQVRVYIFFF ::::::::::::.:::.: ::.: : : : . : .: : : :. :: : gi|374 YREANRLADGLANYAFTLPLGLH-C-FDACPEGVRL-LLLADVN-GTEFPRAVLL 1190 1200 1210 1220 1230 MLF18. YSFQ Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:01