SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MHK7.P3 (Universal genetic code) : 812 aa vs library searching atfca15 library 1996 residues in 1 sequences The best scores are: s-w ATFCA15, 1996 bases, 2385 checksum. (1996)2473 >>ATFCA15, 1996 bases, 2385 checksum. (1996 aa) Smith-Waterman score: 2473; 51.348% identity in 816 aa overlap 10 20 30 40 50 60 MHK7.P MAFSSPSDFKRYHVFSSFHGPDVRSGFLSHLHNHFESKGITPFKDQEIERGHTIGPELIQ : ::::::..::.: ::. ATFCA1 MFDDQEIERSQTIAPALIK 10 70 80 90 100 110 120 MHK7.P AIRESRVSIVVLSEKYASSGWCLDELVEILKCKEASGHAVMTIFYKVDPSSVRKQWGDFG ::.:::.::..::..::::.::::::.::.::::: :. :::.:: ::::.:::: :.:: ATFCA1 AIKESRISIILLSKNYASSSWCLDELLEIVKCKEAMGQIVMTVFYGVDPSDVRKQTGEFG 20 30 40 50 60 70 130 140 150 160 170 180 MHK7.P STFKKTCEGKTEEVKQRWSKALAYIATVAGEHSLNWDNEAEMIQKIAIDVSNKLNVTPSR .:..:: .:.: ...::.:: .....:::: :::::..::.::. :.::::: : :: ATFCA1 RSFNETCSRSTKEKRRKWSQALNHVGNIAGEHFQNWDNESKMIEKISRDISNKLNSTISR 80 90 100 110 120 130 190 200 210 220 MHK7.P DFEGMC-------------D-DVK---MI-GIWGPAGIGKTTIARALFNQLFTGFRHSCF ::. : : : : :: :: ::::::::::::::.. :...:. ::: ATFCA1 DFDDMVGLEAHLEEMKYLLDLDYKDGAMIVGICGPAGIGKTTIARALYSLLLSSFQLSCF 140 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 MHK7.P MGNI---D---VNNYDSKLRLHNMLLSKILNQKDMKIHHLGAIEEWLRNQRVLIVLDDVD . :. : ...: ::::...::::::::. :.:.:::::.: : .:.::::::::. ATFCA1 VENLSGSDNRGLDEYGFKLRLQEQLLSKILNQNGMRIYHLGAIQERLCDQKVLIVLDDVN 200 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 330 MHK7.P DLEQLEVLAKESFWFGPGSRVIVTLKDKKILMAHGINDIYHVDYPSQKKALEIFCLSAFK ::.:::.::.:. :::::::.::: .:: .: :::: ::: .:: ..::::::. ::. ATFCA1 DLKQLEALANETSWFGPGSRIIVTTEDKGLLEQHGINKTYHVGFPSIEEALEIFCIYAFR 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 MHK7.P QSSPQDGFEELARKVVELCGNLPLALRVVGSSFYGESEDEWRLQLYGIETNLDRKIEHVL .::: :::..:...:... ::::.:::.:::. :..::::. : .::.:::.:: .: ATFCA1 KSSPPDGFKKLTKRVTNVFDNLPLGLRVMGSSLRGKGEDEWEALLDRLETSLDRNIEGAL 320 330 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 MHK7.P RVGYDKLLEKHQSLFLHIACFFNHESVDYVSTMLADSTLDVENGLKTLAAKSLVHISTHG :::::.: :..:.:::::: :::... ..: .:::::.:::..::: :. ::::. :: : ATFCA1 RVGYDSLQEEEQALFLHIAVFFNYNKDEHVIAMLADSNLDVKQGLKILTNKSLVYRSTSG 380 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 MHK7.P LVRMHCLLQQLGRQVVVQQSGEPGKRQFLVEAKEIRDVLANET-----IG---EFS-IRK . :: ::::.::... .: :: ::..:..:.:: :: :.: .: . : : : ATFCA1 KIVMHKLLQQVGRKAIQRQ--EPWKRHILIDAHEICYVLENDTDTRAALGISLDTSGINK 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 MHK7.P RVF-EG----MHNLKFLKFYNG----N--VSLLEDMKYLPRLRLLHWDSYPRKRLPLTFQ .. :: :.::.::. :: : :.. ::... :.::::.:..::. : .. ATFCA1 VIISEGAFKRMRNLRFLSVYNTRYVKNDQVDIPEDLEFPPHLRLLRWEAYPK----LDMK 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 MHK7.P PECLVELYLVSSKLEKLWGGIQPLTNLKKINLEYSSNLKEIPNLSKATNLETLRLTGCES : :.::::: : ::::::::..: ::.:::.:.::.::::: :.:. :.: ATFCA1 -----E-----SQLEKLWQGTQPLTNLKKMDLTRSSHLKELPDLSNATNLERLELSYCKS 560 570 580 590 600 620 630 640 650 660 670 MHK7.P LMEIPSSISNLHKLEVLDASGCSKLHVIPTKINLSSLKMVGMDDCSRLRSFPDISTNIKI :.:::::.:.:.:::.: .:.::.:.:: :::.:: . .: : .:..:: :::.:. ATFCA1 LVEIPSSFSELRKLETLVIHNCTKLEVVPTLINLASLDFFNMHGCFQLKKFPGISTHISR 610 620 630 640 650 660 680 690 700 710 720 MHK7.P LSIRGTKIKEFPASIV--GGLGILLI-GSRSLKRLTHVPESVSYLDLSHS----DIKMIP : : : ..:.:.::. : :.: :: ..: ::..: :..:::: . ..: .: ATFCA1 LVIDDTLVEELPTSIILCTRLRTLMISGSGNFKTLTYLPLSLTYLDLRCTGGCRNLKSLP 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 MHK7.P DYVIGLPHLQHLTIGNCRKLVSIEGHSPSLESIVAYRCISLESMCCSFHRPILKLEFYNC . :: :.: : : . . :::: :: :.: :. :: . :.: :: ATFCA1 Q----LP----LSI---RWLNACD--CESLES-VA--CVS--SLN-SF----VDLNFTNC 730 740 750 760 790 800 810 MHK7.P LKLDNESKRRIILHSGHRIIFLT .::..:..: .: .: : ATFCA1 FKLNQETRRDLIQQSFFRSLRILPGREVPETFNHQAKGNVLTIRPESDSQFSASSRFKAC 770 780 790 800 810 820 ATFCA1 FVISPTRLITGRKRLISLLCRLISKNGDSINEVYHCFSLPDQSPGTQSEHLCLFHYDFHD 830 840 850 860 870 880 ATFCA1 RDRYFEVDSEILFEFSCTPSDAYEIVQCGVGTYGEEIEQISDWSNASEEIETENISDDVN 890 900 910 920 930 940 ATFCA1 QYRDRHPCKSDKASKEANHLYLIYMPLNNFSKEKELKTDASMKTDGMADPSSYVNHDRDI 950 960 970 980 990 1000 ATFCA1 DQALVSLKKGTQLLKYSRKGRPKFRSFRLSPAVFRRYLRPEKDYLSFSLIYHNGDRSLDL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 ATFCA1 ICKDKAETEVWFAGLKSLIRQNRNKQAKSEIPEIHDSDCFSTGRPSTASIDFAPNNTRRG 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ATFCA1 RTSIDLGIQNSPTKFGSSDVGYERGNMLRPSTDGFRISVSSTPSCSTGTSGPDDIESLGD 1130 1140 1150 1160 1170 1180 ATFCA1 VYVWGEVWSDGISPDGVVNSTTVKIDIACGVRHIALVTRQGEVFTWEEEAGGRLGHGIQV 1190 1200 1210 1220 1230 1240 ATFCA1 DVCRPKLVEFLALTNIDFVACGEYHTCAVSTSGDLFTWGDGIHNVGLLGHGSDLSHWIPK 1250 1260 1270 1280 1290 1300 ATFCA1 RVSGPVEGLQVLSVACGTWHSALATANGKLFTFGDGAFGVLGHGDRESVSYPKEVKMLSG 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ATFCA1 LKTLKVACGVWHTVAIVEVMNQTGTSTSSRKLFTWGDGDKNRLGHGNKETYLLPTCVSSL 1370 1380 1390 1400 1410 1420 ATFCA1 IDYNFNQIACGHTFTVALTTSGHVFTMGGTSHGQLGSSNSDGKLPCLVQDRLVGEFVEEI 1430 1440 1450 1460 1470 1480 ATFCA1 SCGDHHVAVLTSRSEVFTWGKGSNGRLGHGDKDDRKTPTLVEALRERHVKSISCGADQSV 1490 1500 1510 1520 1530 1540 ATFCA1 CSGCRQAFGFTRKRHNCYNCGLVHCHACSSKKALKAALAPTPGKPHRVCDACYTKLKAGE 1550 1560 1570 1580 1590 1600 ATFCA1 SGYNSNVANRNSTTPTRSLDGTGRPDRDIRSSRILLSPKTEPVKYSEVRSSRSESSIVRA 1610 1620 1630 1640 1650 1660 ATFCA1 SQVPALQQLRDVAFPSSLSAIQNAFKPVASSSTSTLPSGTRSSRISSPPRSSGFSRGMID 1670 1680 1690 1700 1710 1720 ATFCA1 TLKKSNGVINKEMTKLQSQIKNLKEKCDNQGTEIQRLKKTAREASDLAVKHSSKHKAATE 1730 1740 1750 1760 1770 1780 ATFCA1 VMKSVAEHLRELKEKLPPEVSRCEAFESMNSQAEAYLNASEASESCLPTTSLGMGQRDPT 1790 1800 1810 1820 1830 1840 ATFCA1 PSTNTQDQNIEEKQSSNGGNMRSQEPSGTTEASSSSKGGGKELIEQFEPGVYVTYVLHKN 1850 1860 1870 1880 1890 1900 ATFCA1 GGKIFRRVRFSFFVANGDLMSIKQKNGGIAKKIGCLRVPTPTQPQPPASDSVPTPTQPQP 1910 1920 1930 1940 1950 1960 ATFCA1 PASDSVPTPTQPQPPASPTQPNSDQAEDSKEVLDES 1970 1980 1990 Library scan: 0:00:01 total CPU time: 0:00:06