SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MDH9.14 (Universal genetic code) : 801 aa vs library searching gnl:PID:d1010711 library 714 residues in 1 sequences The best scores are: s-w gnl|PID|d1010711 (714) 788 >>gnl|PID|d1010711 (714 aa) Smith-Waterman score: 788; 28.535% identity in 785 aa overlap 10 20 30 40 50 60 MDH9.1 MEALSHVGIGLSPFQLCRLPPATTKLRRSHNTSTTICSASKWADRLLSDFNFTSDSSSSS 70 80 90 100 110 MDH9.1 FATATTTATLVSPPPSIDRPERHVPIPIDFYQVLGAQTHFLTDG--IRRAFEARVSKPPQ ::.:::..:: . . : :..:.. :. . :. gnl|PI MFIPLDFYRILGIPPQ--SGGETIEQAYQDRLLQLPR 10 20 30 120 130 140 150 160 170 MDH9.1 FGFSDDALISRRQILQAACETLSNPRSRREYNE---GLLDDE--EATVITDVP-WDKVP- ::: :. : :.: : ::: .:..:. :.. : .:. :: .: .: . : gnl|PI REFSDAAVTLRNQLLAIAYETLRDPEKRQAYDQEWWGAMDEALGEALPLT-TPELECSPE 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 MDH9.1 ---GALCVLQEGGETEIVLRVGEALLKERLPKS--FKQDVVLVMALAFLDVSRDAMALDP ::: .: . :: :.:.. :: .:.. : . . :: .: . :: ..::. . gnl|PI QEIGALLILLDLGEYELVVKYGEPVLHDPNPPAGGLPQDYLLSVILAHWELSRERWQQQQ 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 MDH9.1 PDFITGYEFVEEA-LK-L--LQEEGASSLAPDLRAQIDETLEEITPRYVLELL---GLPL :::. : :: : ::.. ... : :.:.: . : .. : .:::: : gnl|PI ------YEFAATASLKALARLQQD--NDF-PALEAEIRQELYRLRPYRILELLAKEGQ-- 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 MDH9.1 GDDYAAKRLNGLSGVRNILWSVGG--G-GASALVGGLTRE---KFMNEAFLR--MTAAEQ :.. .: .::. .. .. . :: : : . .:: . ::... :: .:.::: gnl|PI GEE---QRQQGLALLQAMVQDRGGIEGKGED--YSGLGNDDFLKFIHQ--LRCHLTVAEQ 210 220 230 240 250 340 350 360 370 380 MDH9.1 VDLFVATP-SNIPAESFEVYEVALALVAQAFIGKKPH-LLQDADKQFQQLQQAKVMAM-E ::. : :. : : ::: .... : :. .. :. :. ::. : gnl|PI NALFL--PESQRP--S---------LVA-SYLAV--HSLMAEGVKE----QDP--MAIVE 260 270 280 290 390 400 410 420 430 440 MDH9.1 IPAMLYDTRNNWEIDFGLERGLCALLIGKVDECRMWLGLDSEDSQYRNPAIVEFVLENSN ... . .: :..::. .: ::.:.. : . ..:. : : :: ::.. gnl|PI AKSLIIQLENCQ--DLALEKVICELLLGQT-EVVL-AAIDQGD-----PKIVAG-LESKL 300 310 320 330 340 450 460 470 480 490 500 MDH9.1 RDDNDDLPGLCKLLETWLAGVVFPRFRDTKDKKFKLGDYYDDPMVLSYLERVE----VVQ .: : .. . : :: . : ::: . . .. :...: : .:::..: ... gnl|PI ATGEDPLTAFYTFTEQWLEEEIVPYFRDLSPETLSPKAYFNNPSVQQYLEQLEPDSFTTD 350 360 370 380 390 400 510 520 530 540 550 MDH9.1 GS---P-LAAAAAMARIGAEHVKASAM--QALQKVFPSRYTDRNSAEPKDVQETVFSVDP .: : : ..:. .. : .: :. . : .. ::: :. . :. .. :: : gnl|PI NSFASPALLSTATESETPMVHSSA-ALPDRPLTSTVPSR---RGRS-PRRSRDDVF---P 410 420 430 440 450 560 570 580 590 600 610 MDH9.1 VGNNVGRDGEPGVFIAEAV-RPSENFETN----DYAIRAGVSESSVDETTVEM-SVADML ..: .: . .. :. .... :: : . : : .:. :.: . : gnl|PI SADN--SSGLAVTTLSPAIAYDTHSLGTNGIGGD-STSNGFSSNSAPESTSKHKSPRRRK 460 470 480 490 500 510 620 630 640 650 MDH9.1 KEASVK-------ILA-AGVAIGLISLFSQKY------FLKSS-SSFQRKDMVSSMESDV :....: .: ::.. : .:. .. .:.. . : :. : . : gnl|PI KRVTIKPVRFGIFLLCLAGIVGGATALIINRTGDPLGGLLEDPLDVFL--DQPSEFIPDE 520 530 540 550 560 570 660 670 680 690 700 710 MDH9.1 ATIGSVRADDSEALPRMDARTAENIVSKWQKIKSLAFGPDHRIEMLPEVLDGRMLKIWTD :: : : . . : .. .... .:. : :.:::: .. . : :: .: gnl|PI AT--S-R-NLILSQPNFNQQVGQMVVQGWLDSKKLAFGQNYDVGALQSVLAPNLLAQQRG 580 590 600 610 620 720 730 740 750 760 770 MDH9.1 RAA-ETAQLGLVY-DYTLLKLSVDSVTVSA-DGTRALVEATLEE-SA--CLSDLVHPENN :: . :: :: .: ::.. . :. : .:: : : .:: : :.. . ... gnl|PI RAQRDQAQK--VYHQYEH-KLQILAYQVNPQDPNRATVTARVEEISQPFTLGNQ-QQKGS 630 640 650 660 670 680 780 790 800 MDH9.1 AT-DVRTYTTRYEVFWSKSG-WKITEGSVLAS :: : :.::.. ..: ::: . .:. gnl|PI ATKD--DLTVRYQLV-RHQGVWKIDQIQVVNGPR 690 700 710 Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:00