SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MCA23.14 (Universal genetic code) : 751 aa vs library searching gi:1597723 library 901 residues in 1 sequences The best scores are: s-w gi|1597723 (901)1458 >>gi|1597723 (901 aa) Smith-Waterman score: 1458; 35.624% identity in 873 aa overlap 10 20 30 40 50 MCA23. MALTISISCFSSYFVSLLLLVLSSFSFVC-F-SLSTVSISHISNQTLVCALNNH-S ::... :: : :: ...: . :.:....:. . . :.::. : gi|159 MDHVPALVLAGCCF------LALLP----GWACGLGSMSSIAVSYGEDGPVFCGLNSDGS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 MCA23. YL-QCSSFPLN-SIPFSLTGNLRNRRFSGVVSGNGFVCGLISRLDSNTSTLLCWRFSVDG .: : : . :. : : : : :...:.::::::. :: : :: : gi|159 HLVAC--FGADASV---LYGAPPNIPFLGLTAGDGFVCGLL--LD--TRQPYCW-----G 60 70 80 90 120 130 140 150 MCA23. TNMLHKRIYHGPELE-----ELEAGNFRICGVERVSR---R--------LRCWQPYYLPR .: : : .: :: ::. ..:.. :... : . :: : . gi|159 SNSYVKSGVPQPMVEGARYSELSAGDNHLCAL-RAAQDGGRGSSAATSLIDCWG-YNMTA 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 MCA23. P---DNYRS-IALGDNFFCGLSQPPGMISCEG---IAKV----PSGD-HYIAIAAGSRQA :. : .. :. : ::: . : : .. : : : :. .:.::. .. gi|159 THAVDEAVSTVSAGSVFNCGLFARNRTVFCWGDETVSGVVGLAPR-DLHFQSIGAGGYHV 160 170 180 190 200 210 210 220 230 240 MCA23. CAITVDN-DVECWGQT----QSLPREKF---------L-ALA--VGEDR--GCGVRWS-N :.. ..: .: :::.. : .: . . :.. :: : .::.: : . gi|159 CGV-LENAQVFCWGRSLEMQQVVPSSAIGDGDVNIVPMDAMSTVVG-GRFHACGIR-SLD 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 MCA23. GTVVCWGN--NNNFSLPQTLKDIHFTSIYAKGPMF-CGVATRNYTLI--CWGNEN----- :.::: .:. : :. :: .. .. : : .: ::: ... .:. :::: . gi|159 HQVACWGFTLHNSTSPPKGLK-MY--ALVA-GDYFTCGVPAET-SLMPRCWGNSGPLALP 280 290 300 310 320 300 310 320 330 MCA23. --FKSGVFTP-------FQ----GLI-S-QVVMPG------PCRRECPYRPLSGSQSLCG :. .: .. : . : .: :. :: :: . : : : : gi|159 MAVPPGICVPTACSHGYYEYVNHGEVGSIKVCKPANSRLCLPCSTGCP-EGLYES-SPC- 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 MCA23. NELM--IC--D-LK-RNDGE---FPDTRAQNSKNKTWSRRNIAF---LVVGCVGTFSLLL : .: : :: .: : : .: : .: ::. .:: . :. . .:...: gi|159 NATADRVCQFDCLKCVTD-ECLSF--CLSQ--K-RTKSRKLMAFQMRIFVAEI-VFAVVL 390 400 410 420 430 390 400 410 420 MCA23. VISFLI----F---K-SHCRC-----RVHDSG----RLDDTRTIDIPKLEKRLCTLASLG :.: . . : ::.: :. : : :. . :. : .: : .. gi|159 VLSVSVTTCLYVRHKLRHCQCSNRELRLAKSTAYSFRKDNMK-IQ-PDMED-L----KI- 440 450 460 470 480 430 440 450 460 470 480 MCA23. NPGQLMEFSIDELALATDGFSVRFHLGIGSFGSVYQGVLSDGRHVAIKRAELTNPTLSGT .: ::: .:: :: ::: ..: :::. :..:.: :: ::.::: .... gi|159 RRAQ--EFSYEELEQATGGFSEDSQVGKGSFSCVFKGILRDGTVVAVKRA------IKAS 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 MCA23. TMRHRRADKDSAFVNELESMSRLNHKNLVRLLGFYEDTEERILVYEYMKNGSLADHLH-- . ....:. : :::. .::::: .:. :::. :: ::.::::.: .::: .::: gi|159 DV--KKSSKE--FHNELDLLSRLNHAHLLNLLGYCEDGSERLLVYEFMAHGSLYQHLHGK 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 MCA23. NPQFDP-LSWQTRLMIALDAARGIQYLHEFIVPPVIHRDIKSSNILLDATWTAKVSDFGL .:.. :.: :. ::..:::::.::: . ::::::::::::::.: .:.:.:::: gi|159 DPNLKKRLNWARRVTIAVQAARGIEYLHGYACPPVIHRDIKSSNILIDEDHNARVADFGL 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 MCA23. SQMGPTEEDDVSHLSLHAAGTLGYIDPEYYKFQQLTTKSDVYSFGVVLLELLSGHKAIHN : .::. :. . :: ::::::.:::::... ::::::::::::::::.:::.::: gi|159 SILGPA--DSGTPLSELPAGTLGYLDPEYYRLHYLTTKSDVYSFGVVLLEILSGRKAIDM 660 670 680 690 700 710 670 680 690 700 710 MCA23. NEDENPRNLVEYVVPYILLDEAHRILDQRIPPPTPYEIEAVAHVGYLAAECL-MPCSRKR . .:. :.::..:: : . ::: . ::. ..::. ... .: .:. : .. : gi|159 QFEEG--NIVEWAVPLIKAGDIFAILDPVLSPPS--DLEALKKIASVACKCVRMR-GKDR 720 730 740 750 760 720 730 740 750 MCA23. PSMVEVVSKLESALA-----ACLTAP--KTETV---SRSNTY ::: .:.. :: ::: :. : ::.: :: gi|159 PSMDKVTTALEHALALLMGSPCIEQPILPTEVVLGSSRMHKVSQMSSNHSCSENELADGE 770 780 790 800 810 820 gi|159 DQGIGYRAPSWITFPSVTSSQRRKSSASEADIVGRRATDGRNVGSSIGDGLRSLEEEIAP 830 840 850 860 870 880 gi|159 ASPQENLYLQHNF 890 900 Library scan: 0:00:00 total CPU time: 0:00:00