SSEARCH searches a sequence database using the Smith-Waterman algorithm version 2.0u54, July. 1996 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 >MCA23.12 (Universal genetic code) : 981 aa vs library searching sp:P33174:KIF4_MOUSE library 1231 residues in 1 sequences The best scores are: s-w sp|P33174|KIF4_MOUSE (1231)1919 >>sp|P33174|KIF4_MOUSE (1231 aa) Smith-Waterman score: 1919; 37.409% identity in 1104 aa overlap 10 20 30 40 50 MCA23. MESTPPPDDCSVKVAVHIRPLIGDERIQ-GCQDCVTVVTGKPQVQIGS-HSFTFDHVYGS :.::.. :::.. : :. ::: :.. : :.::: .:. .:::.: :. sp|P33 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVSKE-IKEGCQTCLSFVPGEPQVVVGNDKSFTYDFVF-- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 MCA23. SGSPSTEMYEEC---A-APLVDGLFQGYNATVLAYGQTGSGKTYTMGTGC------GDSS .::::. :: : :::. :.:.::::::::::::::::::.:: : ::. sp|P33 --DPSTEQ-EEVFNTAVAPLIKGVFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMG-GAYTAEQEHDSA 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 MCA23. QTGIIPQVMNALFTKIETLKQQIEFQIHVSFIEIHKEEVQDLLDPCTVNKSDTNNTGHVG :.::.:.. :: .:. :...:: ..::..::..::. ::: :. .. sp|P33 -IGVIPRVIQLLFKEINK-KSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLL--CS-SRE--------- 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 MCA23. KVAHVPGKPPIQIRET-SNGVITLAGSTEVSVSTLKEMAACLDQGSVSRATGSTNMNNQS :... :.::: ..: : ..: :: .: . .. ..::.::. ::...:: ::.:: sp|P33 KATQ------INIREDPKEG-IKIVGLTEKTVLVASDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQS 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 MCA23. SRSHAIFTITVEQMRKINTDSPENGAYNGSLKEEYLCAKLHLVDLAGSERAKRTGSDGLR :::::::::..:: :: : :. :.:.. .:::::::::::: :.: ..: : sp|P33 SRSHAIFTISIEQ-RKKN-DK------NSSFR-----SKLHLVDLAGSERQKKTKAEGDR 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 MCA23. FKEGVHINKGLLALGNVISALGDEKKRKDGAHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNSRTVMIACI ..::..::.::: ::::::::::.:: : ::::::::::::::::::::.:.::::. sp|P33 LREGININRGLLCLGNVISALGDDKK---GNFVPYRDSKLTRLLQDSLGGNSHTLMIACV 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 MCA23. 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